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楼主 Author: sobereva
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[综合交流] 简单量子化学问题答疑专帖(旧版,已关帖)

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2016-9-27 22:34:18 | 只看该作者 Only view this author
小书童 发表于 2016-9-27 22:18
B2PLYP/def2-tzvp计算单点能,报错如下 Leave Link  801 at Tue Sep 27 09:15:07 2016, MaxMem=  214748364 ...

用E.01版本,还不行就是bug,问客服
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发表于 Post on 2016-9-27 22:34:45 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2016-9-27 22:34
用E.01版本,还不行就是bug,问客服

多谢sob老师指点

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2016-9-27 22:47:28 | 只看该作者 Only view this author
shangfang 发表于 2016-9-27 21:51
老师,您好。
我看了好多遍高斯手册也没弄明白guess=only到底是什么意思。。做cas的时候首先用savenbos保 ...

savenbo之后chk里的轨道就是NBO,本征值就不是分子轨道能量了而是NBO占据数

guess=only加了这个说明从chk里读取初猜轨道,并且什么也不干,也不做SCF,直接基于读取的波函数做个布居分析输出一下轨道信息就完事。chk里的波函数信息还是一开始chk里的信息
不加这个显然就是照常产生初猜,做SCF迭代到收敛,最后chk里的信息就是收敛后的MO。
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发表于 Post on 2016-9-28 08:34:42 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2016-9-27 22:47
savenbo之后chk里的轨道就是NBO,本征值就不是分子轨道能量了而是NBO占据数

guess=only加了这个说明从 ...

好的,谢谢老师。
另外,比如经过casscf(12,8)选取活化空间后,组成的8个新的分子轨道到底是怎么计算出来的呢。
我看了modern quantum chemistry这本书两遍,在介绍CI的章节中,我也明白最准确的表示基态波函数的方法是用slter波函数表示出的基态和各个激发态的线性组合,后续的解方程步骤也与HFSCF迭代类似。
但是cas形成活化空间后的这8个新的分子轨道到底是什么意思呢,现在越来越晕了。。。

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发表于 Post on 2016-9-28 09:05:43 | 只看该作者 Only view this author
还有就是,我现在做cas做呋咱这样对称性很好的小分子,做了许多种排列组合的方式,可视化后的活化轨道也与文献上有差别,我也知道可能是由于选取初猜轨道时所选的方法对轨道形状有所影响(比如问师兄,他说有些人喜欢用mp2选为一开始的方法),初猜轨道的保存形式(比如保存为自然轨道,局域化轨道)也会对最后的活化轨道有所影响,但是这其中不为人知的事情太多了,有没有比较主流的流程呢。。

另外就是,即使选取的初猜轨道一样,初猜轨道的不同排列也会影响到最后活化轨道的形状,即使会选初猜轨道,也不一定能排列成符合实验结果的样子,这该怎么办呢。。难道只能去与实验结果比较验证自己的活化轨道到底正不正确吗(当然我也知道占据数要在0.02到1.98之间,但是最准确的验证方法还是与实验值比较)

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发表于 Post on 2016-9-28 10:14:02 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2016-9-25 21:00
1 那些离底部很远的就不管了
2 没有确切范围,只是程度问题。蓝的是强氢键、卤键等静电主导的吸引作用, ...

谢谢老师!请问老师,可用multiwfn计算得到态密度,如何得到Fermi能级呢?具体怎么做?

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2016-9-28 12:57:18 | 只看该作者 Only view this author
dingniu2 发表于 2016-9-28 10:14
谢谢老师!请问老师,可用multiwfn计算得到态密度,如何得到Fermi能级呢?具体怎么做?


Multiwfn是处理孤立体系的,孤立体系没有确切Fermi能级的概念。死活非要说这个的话,往往就用HOMO能级或者HOMO与LUMO能级的中间值。
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2016-9-28 13:05:45 | 只看该作者 Only view this author
shangfang 发表于 2016-9-28 08:34
好的,谢谢老师。
另外,比如经过casscf(12,8)选取活化空间后,组成的8个新的分子轨道到底是怎么计算出 ...

意义不明。做CASSCF的时候会对轨道进行优化,轨道是指所有轨道,而不是仅仅活性空间里的8个占据轨道。
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2016-9-28 13:07:43 | 只看该作者 Only view this author
shangfang 发表于 2016-9-28 09:05
还有就是,我现在做cas做呋咱这样对称性很好的小分子,做了许多种排列组合的方式,可视化后的活化轨道也与 ...

多数情况就是用MO作为初猜轨道
活性空间里,占据轨道的顺序可以随意换,空轨道的顺序也可以随意换,但占据轨道和空轨道不能随意换。
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发表于 Post on 2016-9-28 19:38:54 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2016-9-28 13:07
多数情况就是用MO作为初猜轨道
活性空间里,占据轨道的顺序可以随意换,空轨道的顺序也可以随意换,但占 ...

谢谢sob老师。
其实我现在脑子里也很混乱,想要问的东西自己也说不太清楚。
不过您所说的cas是对所有轨道进行优化和活性空间的轨道可以随意换以前我也是不知道的。。。所以仍然学到了新的东西,谢谢老师。

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发表于 Post on 2016-9-28 19:49:41 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2016-9-28 13:07
多数情况就是用MO作为初猜轨道
活性空间里,占据轨道的顺序可以随意换,空轨道的顺序也可以随意换,但占 ...

您所说的意思我可不可以这样理解,首先,初猜轨道需要我选择一次,然后,做完casscf后得到一系列新的轨道,再在这里面选取我想要的轨道组成活性空间(比方说是8个)
希望老师不要嫌弃我笨,对这个问题我一直处于晕乎乎的状态。。

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发表于 Post on 2016-9-28 20:05:42 | 只看该作者 Only view this author
今天都文献发现了一个观点,说DFT计算热力学量没问题,计算活化能会有比较大的误差,思索半天没理解为什么,截图如下,望老师指点一下,这里面的原因。

QQ截图20160928195932.jpg (517.62 KB, 下载次数 Times of downloads: 15)

QQ截图20160928195932.jpg

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2016-9-28 22:23:11 | 只看该作者 Only view this author
小书童 发表于 2016-9-28 20:05
今天都文献发现了一个观点,说DFT计算热力学量没问题,计算活化能会有比较大的误差,思索半天没理解为什么 ...

不要理他,是错误观点。
M06-2X算有机反应势垒很好的,更高级点可以再用双杂化
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2016-9-28 22:28:21 | 只看该作者 Only view this author
shangfang 发表于 2016-9-28 19:49
您所说的意思我可不可以这样理解,首先,初猜轨道需要我选择一次,然后,做完casscf后得到一系列新的轨道 ...


不是。
通常是你先做HF计算,用.fch在multiwfn或gview里看MO,找出你要纳入活性空间的MO,记下编号。然后CASSCF计算时加上guess(read,alter),代表从chk里读取MO,并且按照你的设定把要纳入活性空间的MO编号都调成最高几个占据轨道和最低几个空轨道,它们一起构成接下来CASSCF计算的活性空间里的轨道。
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发表于 Post on 2016-9-29 08:47:44 | 只看该作者 Only view this author

QST3计算出错

本帖最后由 风飞 于 2016-9-29 08:48 编辑

老师:您好!我的QST3计算出现如下错误,请问可以怎样解决呢?还有就是在计算QST3的时候,请问有什么需要注意的或者是技巧吗?谢谢~~

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