计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
楼主 Author: sobereva
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[综合交流] 简单量子化学问题答疑专帖(旧版,已关帖)

   关闭 [复制链接 Copy URL]

14

帖子

0

威望

175

eV
积分
189

Level 3 能力者

2206#
发表于 Post on 2016-9-29 13:53:00 | 只看该作者 Only view this author
新提问:对于常见的偶数电子的分子体系,有哪些是开壳层呢?我只知道氧气分子这一个例子。有没有可以查询分子的开闭壳层性质的数据库呢?具体来说,比如像C4H8,C6H6,CCl4,CH3NH2,CH3OH,CH4,CO,CS2,如何快速的知道这些分子是开壳层还是闭壳层呢?   

6万

帖子

99

威望

6万

eV
积分
125177

管理员

公社社长

2207#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2016-9-29 14:48:29 | 只看该作者 Only view this author
风飞 发表于 2016-9-29 08:47
老师:您好!我的QST3计算出现如下错误,请问可以怎样解决呢?还有就是在计算QST3的时候,请问有什么需要注 ...

有可能是bug
尝试g09
如果最后结构有过渡态的苗头,可直接拿最后结构当过渡态初猜用opt(ts,noeigen,calcfc)来继续找过渡态
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

6万

帖子

99

威望

6万

eV
积分
125177

管理员

公社社长

2208#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2016-9-29 15:08:47 | 只看该作者 Only view this author
ygao_ustc 发表于 2016-9-29 13:53
新提问:对于常见的偶数电子的分子体系,有哪些是开壳层呢?我只知道氧气分子这一个例子。有没有可以查询分 ...


没有这种数据库。凭化学直觉和基础知识能判断出绝大部分情况,如果不会的话大抵没好好学过结构化学。实在判断不出来就各种情况都算算看哪种能量最低。
苯、甲胺、甲醇、甲烷、CO、CS2显然是单重态闭壳层能量最低。
C4H8,如果是指丁烷双自由基,是单重态开壳层能量最低,看
谈谈片段组合波函数与自旋极化单重态
http://sobereva.com/82
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

3

帖子

0

威望

27

eV
积分
30

Level 2 能力者

2209#
发表于 Post on 2016-9-29 18:01:49 | 只看该作者 Only view this author
求问高斯计算结果中初始参数中这一段是什么意思?

! A31   L(1,19,7,3,-2)        180.1556        estimate D2E/DX2         !               
! A32   L(3,19,9,1,-2)        179.9014        estimate D2E/DX2        !               
! A33   L(5,19,11,1,-2)        179.9642        estimate D2E/DX2        !
前部分的是键角,后部分是的是二面角都好理解,但是这三行没搞明白,还有后面导数信息estimate D2E/DX2是什么意思?

45

帖子

0

威望

95

eV
积分
140

Level 2 能力者

2210#
发表于 Post on 2016-9-29 20:15:08 | 只看该作者 Only view this author
老师您好,我在大基组的情况下优化好基态的分子构型了,然后想算激发态的单点能,这时候我重新换成小基组再算到大基组,这样的激发态单点能对不对。。

14

帖子

0

威望

175

eV
积分
189

Level 3 能力者

2211#
发表于 Post on 2016-9-29 22:11:28 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2016-9-29 15:08
没有这种数据库。凭化学直觉和基础知识能判断出绝大部分情况,如果不会的话大抵没好好学过结构化学。实 ...

非常感谢您!我没有上过结构化学课。C4H8指的是1-丁烯,我想这个应当是闭壳层。老师,笑气分子N2O是开壳层还是闭壳层呢?

6万

帖子

99

威望

6万

eV
积分
125177

管理员

公社社长

2212#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2016-9-30 01:45:21 | 只看该作者 Only view this author
ygao_ustc 发表于 2016-9-29 22:11
非常感谢您!我没有上过结构化学课。C4H8指的是1-丁烯,我想这个应当是闭壳层。老师,笑气分子N2O是开壳 ...

这种常见的分子肯定有实验和理论计算的文章,直接搜一下就有
不常见的小分子自己又不好凭知识判断时就各种自旋多重度都算算就完了
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

265

帖子

5

威望

2363

eV
积分
2728

Level 5 (御坂)

2213#
发表于 Post on 2016-9-30 13:57:30 | 只看该作者 Only view this author
请问ORCA布局分析里面有一项MULLIKEN REDUCED ORBITAL CHARGES AND SPIN POPULATIONS,手册里说表示了轨道的成分,但是和Multiwfn结果对比并不是Mulliken方法的基组shell成分值。这个值代表什么?
搜索文献没发现orca计算结果之外的文献有了这个名词,
感谢
sincerely
本周目已沉沦,下个世界再会

45

帖子

0

威望

95

eV
积分
140

Level 2 能力者

2214#
发表于 Post on 2016-9-30 17:01:30 | 只看该作者 Only view this author
老师,您好。
请问做HF方程迭代的时候,最后一步要要求前后两次求出的密度矩阵满足规定的标准才会收敛。这个密度矩阵的物理意义是什么,为什么把它作为收敛的标准呢。

6万

帖子

99

威望

6万

eV
积分
125177

管理员

公社社长

2215#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2016-9-30 17:15:37 | 只看该作者 Only view this author
zhanfei 发表于 2016-9-30 13:57
请问ORCA布局分析里面有一项MULLIKEN REDUCED ORBITAL CHARGES AND SPIN POPULATIONS,手册里说表示了轨道 ...

目前太忙没时间仔细看,就用.molden文件做mulliken或SCPA分析就行了,ORCA那个也不会有什么好处,不用管它
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

6万

帖子

99

威望

6万

eV
积分
125177

管理员

公社社长

2216#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2016-9-30 17:16:26 | 只看该作者 Only view this author
shangfang 发表于 2016-9-30 17:01
老师,您好。
请问做HF方程迭代的时候,最后一步要要求前后两次求出的密度矩阵满足规定的标准才会收敛。这 ...

密度矩阵是对波函数的一种表示方式,里面学问很大。要求密度矩阵变化较小,等价于要求波函数变化较小。
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

265

帖子

5

威望

2363

eV
积分
2728

Level 5 (御坂)

2217#
发表于 Post on 2016-9-30 20:47:38 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2016-9-30 17:15
目前太忙没时间仔细看,就用.molden文件做mulliken或SCPA分析就行了,ORCA那个也不会有什么好处,不用管 ...

好 谢谢sob sennsei
本周目已沉沦,下个世界再会

45

帖子

0

威望

95

eV
积分
140

Level 2 能力者

2218#
发表于 Post on 2016-10-1 20:48:20 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 shangfang 于 2016-10-1 20:52 编辑

用cas(12,8)优化某一结构,可否先用cas(6,5)来得到收敛的结构,再用cas(12,8)优化呢。
总是感觉cas的算法不允许先用cas(6,5),然后再做到cas(12,8),那样会让结果不对。。

6万

帖子

99

威望

6万

eV
积分
125177

管理员

公社社长

2219#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2016-10-1 21:25:48 | 只看该作者 Only view this author
shangfang 发表于 2016-10-1 20:48
用cas(12,8)优化某一结构,可否先用cas(6,5)来得到收敛的结构,再用cas(12,8)优化呢。
总是感觉cas的算法 ...

这么做不会有什么好处的,通常也不会令总耗时有所降低,除非初猜真的特别离谱。
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

210

帖子

0

威望

1855

eV
积分
2065

Level 5 (御坂)

2220#
发表于 Post on 2016-10-3 10:03:33 | 只看该作者 Only view this author
请问,我在用量化优化石墨烯片段的时候,把结构画出来觉得没问题,但是优化的时候提示我多重度和电荷不对,结构见附件,请大神看一下我这个结构是哪里出了问题?

go_single.com

3.07 KB, 下载次数 Times of downloads: 6

结构

本版积分规则 Credits rule

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2026-2-25 13:42 , Processed in 0.218231 second(s), 28 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list