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楼主 Author: sobereva
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[综合交流] 简单量子化学问题答疑专帖(旧版,已关帖)

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发表于 Post on 2016-9-19 00:15:37 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2016-9-17 15:43
打开文件的界面选上read intermediate geometries复选框

sober老师感谢您的回答
这个可以再file-open-然后选择文件的对话框最后勾选。
我的优化结果如图所示,能量应该是渐渐降低的,最后稳定了。但是优化结果却是l9999?
是不是只要接着将优化完毕的结构继续进行优化?
谢谢!

1.png (18.71 KB, 下载次数 Times of downloads: 22)

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发表于 Post on 2016-9-19 08:36:53 | 只看该作者 Only view this author
Sob老师,你好,我要用Gaussian 09 程序算水为隐式溶剂下酚类与自由基的氢转移和单电子转移反应,44个原子,含C, H, O, N, 四种元素,四个O, 五个N, 剩下的都为C、H 元素,主要想得到热力学量,计算反应活化能,机器有八核和十二核的,用M062X方法计算体系,请问老师在优化和算单点时分别用什么基组比较好?

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发表于 Post on 2016-9-19 14:01:03 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 liyuanhe211 于 2016-9-20 21:55 编辑
chengxing545946 发表于 2016-9-19 08:36
Sob老师,你好,我要用Gaussian 09 程序算水为隐式溶剂下酚类与自由基的氢转移和单电子转移反应,44个原子 ...

RI-PWPB95-D3/def2-QZVPP//M06-2X-D3/TZVP
前者要用ORCA,不愿离开Gaussian的话用B2PLYP代替

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发表于 Post on 2016-9-19 14:59:49 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2016-9-18 22:23
就是CASSCF没收敛
最后提示很明确,64步是上限还没收敛
ITN= 63 MaxIt= 64 E=   -595.0979615291 DE=- ...

sobber老师您好,最后的那种未收敛问题我经常碰到,一直没明白什么意思,经过您的指点终于明白了。
但是即使我不做opt,也会出现不收敛的情况,比如,我只想计算S1态的能量,也会出现上述不收敛问题。。

QQ截图20160919145900.png (7.86 KB, 下载次数 Times of downloads: 11)

QQ截图20160919145900.png

QQ截图20160919145834.png (12.3 KB, 下载次数 Times of downloads: 14)

QQ截图20160919145834.png

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发表于 Post on 2016-9-19 15:23:50 | 只看该作者 Only view this author
shangfang 发表于 2016-9-19 14:59
sobber老师您好,最后的那种未收敛问题我经常碰到,一直没明白什么意思,经过您的指点终于明白了。
但是 ...

我明白了。。我把scf和opt混了。
谢谢sobber老师。。。

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发表于 Post on 2016-9-19 16:14:17 | 只看该作者 Only view this author

关于理论计算荧光量子效率

请教大家一个问题  这个荧光量子产率能理论计算出来吗  如果能 该如何计算  谢谢大家

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发表于 Post on 2016-9-19 17:11:13 | 只看该作者 Only view this author
哪位能简单解释下APT电荷不?没有查相关文献。
谢谢!!

apt.jpg (73.42 KB, 下载次数 Times of downloads: 9)

apt.jpg

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2016-9-19 20:47:32 | 只看该作者 Only view this author
好好学习 发表于 2016-9-19 16:14
请教大家一个问题  这个荧光量子产率能理论计算出来吗  如果能 该如何计算  谢谢大家

很难算,看此贴
http://bbs.keinsci.com/thread-2516-1-1.html
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2016-9-19 20:47:42 | 只看该作者 Only view this author
hzfish 发表于 2016-9-19 17:11
哪位能简单解释下APT电荷不?没有查相关文献。
谢谢!!

GAPT电荷的原理和性质
http://sobereva.com/208
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2016-9-19 20:49:28 | 只看该作者 Only view this author
yezhonghua 发表于 2016-9-19 00:15
sober老师感谢您的回答
这个可以再file-open-然后选择文件的对话框最后勾选。
我的优化结果如图所示, ...

明显是碰上震荡导致不收敛
量子化学计算中帮助几何优化收敛的常用方法
http://sobereva.com/164

拿最后结构继续优化解决问题的几率严格为0,这和把maxcyc设好几百、几千是一样的
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发表于 Post on 2016-9-20 09:31:23 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2016-9-19 20:47
GAPT电荷的原理和性质
http://sobereva.com/208

谢谢老师。

导师问起了这种电荷,想了解一下。

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发表于 Post on 2016-9-20 09:33:52 | 只看该作者 Only view this author
请问老师,gaussian 09计算过渡态时,关键词opt=noeigen什么情况下加?总是加上opt=noeigen会对结果造成影响吗?

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2016-9-20 09:45:07 | 只看该作者 Only view this author
dingniu2 发表于 2016-9-20 09:33
请问老师,gaussian 09计算过渡态时,关键词opt=noeigen什么情况下加?总是加上opt=noeigen会对结果造成影 ...

opt=TS找过渡态时候才加
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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发表于 Post on 2016-9-20 09:52:27 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2016-9-20 09:45
opt=TS找过渡态时候才加

谢谢sob老师,opt=TS时加上noeigen不会对结果造成影响吧?

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2016-9-20 10:03:30 | 只看该作者 Only view this author
dingniu2 发表于 2016-9-20 09:52
谢谢sob老师,opt=TS时加上noeigen不会对结果造成影响吧?

不会
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