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楼主 Author: sobereva
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[综合交流] 简单量子化学问题答疑专帖(旧版,已关帖)

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2017-1-3 14:30:18 | 只看该作者 Only view this author
jingyubo 发表于 2017-1-3 11:43
老师您好,我做了ELF图,但是我不知道图上的这些数字该怎样分析,还有ELF只能分析成键类型吗?老师能不能给 ...


不清楚你的体系,我不好说
分析ELF应当用填色图,不要用等值线图,否则直观度不够
而且要结合等值面图看,等值面图上不好考察的区域、平面再用平面图进一步研究
分析方式在这些文中有充分展示:
电子定域性的图形分析
http://sobereva.com/63
使用AdNDP方法以及ELF/LOL、多中心键级研究多中心键
http://sobereva.com/138
通过键级曲线和ELF/LOL/RDG等值面动画研究化学反应过程
http://sobereva.com/200
以及看
http://bbs.keinsci.com/forum.php?mod=viewthread&tid=2100

ELF较高数值处体现共价性较强以及电子高度定域的区域
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2017-1-3 14:32:51 | 只看该作者 Only view this author
wxy 发表于 2017-1-3 12:40
Sob老师:向你求教三重激发态计算问题:

一共轭烯酮,C=C存在顺反异构,在室内自然光条件下Cis-Trans会 ...


这种比较复杂的问题还是单独发个帖子吧
由于要准备即将开展的gromacs培训班,时间特别紧张,很难抽出时间看复杂问题,单独发帖可能有别人能帮上你
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发表于 Post on 2017-1-3 14:44:57 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2017-1-3 14:32
这种比较复杂的问题还是单独发个帖子吧
由于要准备即将开展的gromacs培训班,时间特别紧张,很难抽出 ...

好的,谢谢您!

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发表于 Post on 2017-1-3 15:13:22 | 只看该作者 Only view this author
恩  谢谢老师

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发表于 Post on 2017-1-3 21:43:42 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2016-12-28 13:44
不是,没理解我的意思
ELF/LOL是用来展现共价作用区域的。能量密度判断是否是共价作用更直接

      如图是ELF图
  如图是LOL图

继续请教Sob,刚算出的截图如上。
金属和配体之间存在定域的电子且受到金属的影响,但是中间的能量密度好像为正吧,像这种情况说明金属和负离子之间是配位还是离子形式?

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2017-1-3 22:15:03 | 只看该作者 Only view this author
alexwpch 发表于 2017-1-3 21:43
如图是ELF图
  如图是LOL图

原子间能量密度是正是负作个能量密度图就知道了,一般都是为负的,说明是共价作用(配位键)
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发表于 Post on 2017-1-3 23:14:05 | 只看该作者 Only view this author
Sob老师,请教您一个问题
在文章中经常看到绝热激发和垂直激发两个概念(adiabatic detachment和vertical detachment),我不大明白二者是什么 以及区别
能解释一下吗
谢谢老师

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2017-1-3 23:19:10 | 只看该作者 Only view this author
lastzealot 发表于 2017-1-3 23:14
Sob老师,请教您一个问题
在文章中经常看到绝热激发和垂直激发两个概念(adiabatic detachment和vertical d ...

Gaussian中用TDDFT计算激发态和吸收、荧光、磷光光谱的方法
http://sobereva.com/314

里面写得很清楚
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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发表于 Post on 2017-1-4 00:03:32 | 只看该作者 Only view this author
Sob老师,再请教您一个问题
我看了一个用DFT方法研究卤化铀的文章,里面提到
含有铀5f(pi) 5f(fi) 6p成分多的分子轨道,在考虑SO后劈裂宽度较大,而含有卤离子p轨道成分多的分子轨道劈裂较小。
请问这是为什么呢?
谢谢老师

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发表于 Post on 2017-1-4 00:03:51 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2017-1-3 23:19
Gaussian中用TDDFT计算激发态和吸收、荧光、磷光光谱的方法
http://sobereva.com/314

感谢老师解答

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发表于 Post on 2017-1-4 01:13:32 | 只看该作者 Only view this author
老师我做势能面扫描,快结束了报了103错误。现在这张图是否有意义?还是继续取点加cartesian?

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s.png

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2017-1-4 02:31:50 | 只看该作者 Only view this author
paradise 发表于 2017-1-4 01:13
老师我做势能面扫描,快结束了报了103错误。现在这张图是否有意义?还是继续取点加cartesian?

有没有意义显然看实际情况、要研究什么
柔性扫描用不了cartesian
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发表于 Post on 2017-1-4 08:46:11 | 只看该作者 Only view this author

撘界面时出现错误

研究分子间相互作用 撘界面 优化时出现这种错误 请问这是什么意思 谢谢大家

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10.png

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发表于 Post on 2017-1-4 15:57:03 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2017-1-4 02:31
有没有意义显然看实际情况、要研究什么
柔性扫描用不了cartesian

这个也是同时扫描两个键长需要得到过渡态。这样子可以得到吗?

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2017-1-4 16:02:06 | 只看该作者 Only view this author
paradise 发表于 2017-1-4 15:57
这个也是同时扫描两个键长需要得到过渡态。这样子可以得到吗?


我不清楚你具体是什么情况
诸如H--H--H这种体系,你刚性扫描两个H-H键长,得到二维势能面,上面一下就能看出TS位置。
而一般情况没这么简单。如果目的是找过渡态,不要过度依赖于扫描,靠化学直觉判断初猜结构更重要
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