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楼主 Author: sobereva
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[综合交流] 简单量子化学问题答疑专帖(旧版,已关帖)

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发表于 Post on 2016-12-23 09:48:32 | 只看该作者 Only view this author

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发表于 Post on 2016-12-23 09:52:39 | 只看该作者 Only view this author
谢谢老师开这个专门为新手开的贴

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发表于 Post on 2016-12-23 21:57:32 | 只看该作者 Only view this author

模拟自由基化学反应来算Free energies (∆G) ,必有重谢!

小弟最近做了一个自由基化学反应,想通过模拟自由基化学反应来算化学位垒和Free energies (∆G)  ,求大神点播点播。因为我一点都不懂模拟计算,如果大神能够帮我,我必有重谢!~

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发表于 Post on 2016-12-23 22:47:33 | 只看该作者 Only view this author

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2016-12-24 06:27:38 | 只看该作者 Only view this author
daichen 发表于 2016-12-23 21:57
小弟最近做了一个自由基化学反应,想通过模拟自由基化学反应来算化学位垒和Free energies (∆G)  ,求 ...

不是几句话就能教会的,怎么入门看
谈谈学量子化学如何正确地入门
http://sobereva.com/355

不要在论坛里和群里同时问同一问题
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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发表于 Post on 2016-12-24 11:33:25 | 只看该作者 Only view this author
Sob老师,以前在用限制性自旋处理无单电子的体系时,a和b电子总是在一起的;后来用非限制性自旋处理有单点子的体系,发现有时会出现a和b能级匹配不上的情况,其实我的目的很简单,就是想找到单电子填充在那个轨道,但是这么一来根本就很难找到只有单电子的那个轨道了呀!!!

请问这种情况应该如何处理

比如图中的情况应该有两个单电子,但是我找不到对应的是哪个轨道。(这是采用M06 metaGGA时出现的问题,在用GGA或hybrid时没有这种情况,请问这是为啥)

老师辛苦

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m06/tp2z

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2016-12-24 11:57:48 | 只看该作者 Only view this author
lastzealot 发表于 2016-12-24 11:33
Sob老师,以前在用限制性自旋处理无单电子的体系时,a和b电子总是在一起的;后来用非限制性自旋处理有单点 ...


这种做法本来就没什么意义。U的时候由于自旋极化,alpha和beta轨道都是不匹配的,各个价层轨道可以认为都对自旋密度有贡献。

非要把单电子和轨道去对应,要么用RO,要么在高斯里对U的波函数做双正交化
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发表于 Post on 2016-12-24 14:50:11 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2016-12-24 11:57
这种做法本来就没什么意义。U的时候由于自旋极化,alpha和beta轨道都是不匹配的,各个价层轨道可以认为 ...

谢谢老师
我通过不同的泛函得到的分子轨道能级有显著差异,甚至出现能级顺序不同。
请问如何来选择更加可信的结果呢?(我没有做postHF计算,所以没法知道哪个结果更为可信,依您的经验,这种情况如何来选择合理的结果)

谢谢老师

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发表于 Post on 2016-12-26 10:16:06 | 只看该作者 Only view this author
xujian 发表于 2016-12-23 09:48
可以看看http://sobereva.com/314

好的,谢谢

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发表于 Post on 2016-12-26 19:23:33 | 只看该作者 Only view this author
sob老师您好~
问一个软件上的问题,我用macbook通过ssh连接服务器上的高斯。
发现可以打开gview.但是背景是白色的,无法看到分子。更改颜色也不行,却可以看到左下角提示有多少原子。
所以请求老师能指点一下~

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发表于 Post on 2016-12-26 20:01:52 | 只看该作者 Only view this author

跪求Guassian软件

电脑系统win7 64位,Guassian03点击setup就是没反应,跪求其他版本

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发表于 Post on 2016-12-26 22:11:36 | 只看该作者 Only view this author
又见“瓜斯”。下载地址:http://pan.baidu.com/s/1eSICQhs
Stand on the shoulders of giants

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发表于 Post on 2016-12-26 22:45:44 | 只看该作者 Only view this author
还有请问sob老师这个能量是您隐式溶剂模型下的溶剂环境下溶质自由能吗?
即前后的(溶质在溶剂环境下标况(298.15K、1M)时的自由能 = 溶质在1atm气相下的自由能 + 直接通过隐式溶剂模型计算的溶解自由能(始末都是1M) + 1.89kcal/mol)这样计算能量的差值?

g.png (5.17 KB, 下载次数 Times of downloads: 21)

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发表于 Post on 2016-12-27 00:00:03 | 只看该作者 Only view this author

mp2方法和b3lyp是用的单行列式吗

请问mp2方法和b3lyp是用的单行列式吗?谢谢老师

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2016-12-27 07:36:32 | 只看该作者 Only view this author
现在就好 发表于 2016-12-27 00:00
请问mp2方法和b3lyp是用的单行列式吗?谢谢老师


MP2这种后HF方法一律是多行列式
半经验、HF、DFT(非双杂化泛函)是单行列式
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