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楼主 Author: sobereva
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[综合交流] 简单量子化学问题答疑专帖(旧版,已关帖)

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2016-12-27 07:42:40 | 只看该作者 Only view this author
misaki 发表于 2016-12-26 22:45
还有请问sob老师这个能量是您隐式溶剂模型下的溶剂环境下溶质自由能吗?
即前后的(溶质在溶剂环境下标况 ...

不知道DCE指什么
如果是溶剂下的某个反应过程的自由能差,就用“溶质在溶剂环境下标况(298.15K、1M)时的自由能”来求差值就完了
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
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发表于 Post on 2016-12-27 13:55:01 | 只看该作者 Only view this author
Sob老师您好,我有一个小问题想请教一下
等值面isovalue值指的是波函数的数值还是电子密度数值
有什么具体含义吗
谢谢老师

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发表于 Post on 2016-12-27 15:47:32 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2016-12-27 07:42
不知道DCE指什么
如果是溶剂下的某个反应过程的自由能差,就用“溶质在溶剂环境下标况(298.15K、1M)时 ...

DCE 是二氯乙烷。所以按老师您的意思还是要照这个公式进行运算然后求差值?
老师我上面还有一个问题:是我在Mac通过ssh连接高斯gview页面是白色的。调背景也不变。

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2016-12-27 16:47:49 | 只看该作者 Only view this author
lastzealot 发表于 2016-12-27 13:55
Sob老师您好,我有一个小问题想请教一下
等值面isovalue值指的是波函数的数值还是电子密度数值
有什么具 ...

看你绘制什么函数,单位和你绘制的函数的单位一样
等值面上所有点的数值都是你设的isovalue值
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2016-12-27 16:47:58 | 只看该作者 Only view this author
misaki 发表于 2016-12-27 15:47
DCE 是二氯乙烷。所以按老师您的意思还是要照这个公式进行运算然后求差值?
老师我上面还有一个问题:是 ...


不知道
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发表于 Post on 2016-12-27 20:41:28 | 只看该作者 Only view this author

Gussian计算VCD

各位老师,关于Gussian采用B3LYP/6-31g*优化计算化合物VCD时,是否足够,还是使用更好的泛函和基组会更好!

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发表于 Post on 2016-12-27 20:49:34 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 alexwpch 于 2016-12-27 20:52 编辑

请教下Sob老师,
配位键和离子键,在量子化学中可通过什么特性来进行区分。
例如二茂铁认为是π电子配位化合物,Fe(NO3)2是离子化合物。而Fe(N3)2,如果有的话,如何判断Fe和N3-之间是离子键形式还是配位键形式?

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发表于 Post on 2016-12-27 23:33:04 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2016-12-27 16:47
看你绘制什么函数,单位和你绘制的函数的单位一样
等值面上所有点的数值都是你设的isovalue值

如果是分子轨道呢?对应的是什么函数
谢谢

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2016-12-28 08:26:51 | 只看该作者 Only view this author
lastzealot 发表于 2016-12-27 23:33
如果是分子轨道呢?对应的是什么函数
谢谢

就是轨道波函数
单位a.u.,或者无单位
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2016-12-28 08:27:54 | 只看该作者 Only view this author
alexwpch 发表于 2016-12-27 20:49
请教下Sob老师,
配位键和离子键,在量子化学中可通过什么特性来进行区分。
例如二茂铁认为是π电子配位 ...

用Multiwfn绘制能量密度,原子间区域能量密度为负说明是共价作用(包括配位键)。但这是划分方式之一,并非任何情况都严格合理。

参考
AIM键临界点处电子密度拉普拉斯值符号判断相互作用类型失败原因的图形分析
http://sobereva.com/161
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mars936 发表于 2016-12-27 20:41
各位老师,关于Gussian采用B3LYP/6-31g*优化计算化合物VCD时,是否足够,还是使用更好的泛函和基组会更好! ...

足够
记得考虑频率校正因子
谈谈谐振频率校正因子
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发表于 Post on 2016-12-28 09:01:22 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2016-12-28 08:27
用Multiwfn绘制能量密度,原子间区域能量密度为负说明是共价作用(包括配位键)。但这是划分方式之一,并 ...

也就是说用ELF、LOL的图形体现出来的配位键特征为准,AIM键临界点仅作为参考,是吗?

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发表于 Post on 2016-12-28 10:06:03 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2016-12-28 08:33
足够
记得考虑频率校正因子
谈谈谐振频率校正因子

谢谢sob老师

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alexwpch 发表于 2016-12-28 09:01
也就是说用ELF、LOL的图形体现出来的配位键特征为准,AIM键临界点仅作为参考,是吗?

不是,没理解我的意思
ELF/LOL是用来展现共价作用区域的。能量密度判断是否是共价作用更直接
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发表于 Post on 2016-12-28 19:21:04 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2016-12-28 08:26
就是轨道波函数
单位a.u.,或者无单位

谢谢老师

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