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楼主 Author: sobereva
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[综合交流] 简单量子化学问题答疑专帖(旧版,已关帖)

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发表于 Post on 2017-11-11 14:28:01 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2017-11-10 21:40
用范德华半径,或者稍微小一点的数值

谢谢

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发表于 Post on 2017-11-11 14:35:42 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2017-11-10 21:38
没读入赝势

用genecp

嗯,我用gen并没有给赝势基组下定义,感谢sob老师解答,我以为我用的def-tzvp不用赝势基组的定义呢。
看了sob 老师的博文http://sobereva.com/188
才知道从第五周期及以后赝势必须得考虑的,我再仔细读一读,感谢老师!!

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发表于 Post on 2017-11-11 17:00:54 | 只看该作者 Only view this author
老师,请问一下:我在计算体系的时候写的是PBEPBE/6-311+G(d)方法基组,那我在计算方法讨论时应该写PBEPBE方法,还是PBE方法呢?师兄说我一定要写成PBE/6-311+G(d)计算水平,可是我查文献,好多都是写成PBEPBE/6-311+G(d)的。sob老师,哪种写法是正确的呢?

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发表于 Post on 2017-11-11 17:16:02 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2017-11-11 12:43
重叠大就静电相互作用大呗
我不知道SAPT-EDA是什么。EDA通常用来指代源自morokuma思想的能量分解方法, ...

谢谢社长!
我这里SAPT-EDA就是使用SAPT方法进行能量分解,我自己随便这么写的,表达并不专业。

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2017-11-11 18:55:07 | 只看该作者 Only view this author
1188542uu 发表于 2017-11-11 17:00
老师,请问一下:我在计算体系的时候写的是PBEPBE/6-311+G(d)方法基组,那我在计算方法讨论时应该写PBEPBE ...

写成PBE
高斯里才写PBEPBE
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
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Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
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发表于 Post on 2017-11-11 20:04:10 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2017-11-11 18:55
写成PBE
高斯里才写PBEPBE

谢谢老师

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发表于 Post on 2017-11-12 09:28:33 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2017-11-10 17:54
对于最新版本,如果Bond order matrix for all electrons后面的结果大小合乎化学直觉,用这个

好的,谢谢sob老师

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发表于 Post on 2017-11-12 09:31:24 | 只看该作者 Only view this author
请问用Gaussian能否计算超额光谱?谢谢。

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2017-11-12 10:01:07 | 只看该作者 Only view this author
whtu 发表于 2017-11-12 09:31
请问用Gaussian能否计算超额光谱?谢谢。

看了下定义,量化计算可能能对此给出一定有用的信息,但准确计算应该还不行。
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发表于 Post on 2017-11-12 15:05:31 | 只看该作者 Only view this author
sob老师,请问一下,我要用chelpg电荷分析一个带一个正电荷的体系。其中涉及了Ti原子,需要定义半径,上次你给我答复是用范德华半径,或者略小于范德华半径,我在计算的过程中,发现Ti的范德华半径为1.87,我再1.87-1.80区间尝试,发现所得到的电荷值并不完全一致,那么我在写论文的时候需要指明我计算的chelpg是在多大的半径下算的么?因为这几天查文献,没有找到给半径的,所以希望sob老师能帮助我解答一下。我列出r1.87,r=1.85,r=1.8时所得的结果:
r=1.87
Charges from ESP fit, RMS=   0.00390 RRMS=   0.02592:
ESP charges:
               1
     1  Ti   0.661677
     2  Cl   0.084343
     3  Cl   0.084343
     4  Cl   0.084868
     5  Cl   0.084770
Sum of ESP charges =   1.00000

r=1.85
Charges from ESP fit, RMS=   0.00393 RRMS=   0.02612:
ESP charges:
               1
     1  Ti   0.665483
     2  Cl   0.083464
     3  Cl   0.083464
     4  Cl   0.083702
     5  Cl   0.083887
Sum of ESP charges =   1.00000

r=1.80
Charges from ESP fit, RMS=   0.00403 RRMS=   0.02679:
ESP charges:
               1
     1  Ti   0.678082
     2  Cl   0.080549
     3  Cl   0.080549
     4  Cl   0.080405
     5  Cl   0.080416
Sum of ESP charges =   1.00000

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发表于 Post on 2017-11-12 18:54:53 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 steven 于 2017-11-12 19:31 编辑

sob老师,问个比较具体的没想通的问题。假设有个单分子反应  A----B ,平衡时K=[B]/[A]=1/2。 如果我现在在一个空的容器里投料3份A,给与适当反应条件,达到平衡时组成应该是1份B两份A,这样一直保持平衡。  
但按照反应速率来考虑,如可以算个反应半衰期得到t,即t时A只剩下一半,而且可以计算出A剩下任意浓度时候对应的t。
但是达到平衡时[B]/[A]=1/2这个状态应该一直保持下去呀,所以应该永远没有A只剩下一半的时候。
那么是不是不能随便计算反应半衰期什么的,而是需要先考察反应的平衡情况?
怎么理解呢老师?

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2017-11-12 23:28:17 | 只看该作者 Only view this author
niubaotian85 发表于 2017-11-12 15:05
sob老师,请问一下,我要用chelpg电荷分析一个带一个正电荷的体系。其中涉及了Ti原子,需要定义半径,上次 ...


半径直接影响计算结果,最好指明
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2017-11-12 23:30:32 | 只看该作者 Only view this author
steven 发表于 2017-11-12 18:54
sob老师,问个比较具体的没想通的问题。假设有个单分子反应  A----B ,平衡时K=/[A]=1/2。 如果我现在在一 ...


计算半衰期的时候,并不考虑A,B间的热力学平衡,认为A成为B后就不再可能变为A
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发表于 Post on 2017-11-13 00:53:51 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2017-11-12 23:30
计算半衰期的时候,并不考虑A,B间的热力学平衡,认为A成为B后就不再可能变为A

那就是说对于一个实际根本无法反应到一半的反应,计算出速率常数然后强行算一个半衰期t,是仅有理论意义的?

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2017-11-13 12:04:25 | 只看该作者 Only view this author
steven 发表于 2017-11-13 00:53
那就是说对于一个实际根本无法反应到一半的反应,计算出速率常数然后强行算一个半衰期t,是仅有理论意义 ...

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