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楼主 Author: sobereva
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[综合交流] 简单量子化学问题答疑专帖(旧版,已关帖)

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2017-11-10 21:40:52 | 只看该作者 Only view this author
niubaotian85 发表于 2017-11-10 18:04
sob老师,Ti原子的半径写多少合适呢?在哪里能找到呢?

用范德华半径,或者稍微小一点的数值
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2017-11-10 21:42:16 | 只看该作者 Only view this author
lastzealot 发表于 2017-11-10 21:29
说错了,不好意思。

我重新发。

DZ未必是靠两个收缩型基函数来描述每个原子轨道,诸如6-31G,其中的1就是未收缩的基函数
你的问题描述得不够清楚。建议看论坛里基组入门资料小合集
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发表于 Post on 2017-11-10 22:07:08 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2017-11-10 21:39
可以
什么基组取决于要求的精度
lanl08、lanl08(d)、SDD、def2-SVP/TZVP等都可以用

感谢sob老师

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发表于 Post on 2017-11-10 22:31:42 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2017-11-10 21:40
CASSCF本身就是变分过程,即便初态轨道排布对应激发态,照样可以收敛到基态

哦,懂了,看来casscf在guess=alter关键词作用下,只是把关心的轨道放在活性空间中,不影响最终的结果。
谢谢老师

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发表于 Post on 2017-11-10 22:32:46 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2017-11-10 21:42
DZ未必是靠两个收缩型基函数来描述每个原子轨道,诸如6-31G,其中的1就是未收缩的基函数
你的问题描述得 ...

谢谢老师

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发表于 Post on 2017-11-10 22:37:39 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2017-11-9 22:06
这得结合基本化学知识。理论计算通常是把问题、模型、条件化简到最容易计算模拟的情况,现实情况和模拟用 ...

谢谢sob老师。

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发表于 Post on 2017-11-10 23:28:45 | 只看该作者 Only view this author
请问老师PBE、MP2可以用D3校正吗?从哪可以查到哪些可以用,哪些不可以呢,谢谢各位老师

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2017-11-11 00:13:49 | 只看该作者 Only view this author
圣人惠 发表于 2017-11-10 23:28
请问老师PBE、MP2可以用D3校正吗?从哪可以查到哪些可以用,哪些不可以呢,谢谢各位老师

所有泛函原理上都可以用,几乎所有常见的泛函都有对应的DFT-D3参数
后HF没有DFT-D校正这一说
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发表于 Post on 2017-11-11 10:19:24 | 只看该作者 Only view this author
LMO-EDA中静电成份的论述如下图,其中electron-electron charge penetration和nucleus-electron charge penetration这两种表达从物理图像上如何理解。
谢谢!



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发表于 Post on 2017-11-11 10:57:05 | 只看该作者 Only view this author
Sob老师:对一天然产物做ECD计算,我在构象分析中,用“opt freq B3LYP/def2svp scrf=(solvent=methanol)”做几何优化和频率分析,然后以“B3LYP/def2TZVP scrf=(solvent=methanol)"做单点计算,据此二步计算结果计算出了各构象的相对能量Delta E和Delta G。现其中一位审稿人说:”Calculation cannot be running in MeOH. It is the calculations which apply the solvation model with the dielectric constant representing MeOH.“
我不太明白该条意见的i意思是我在此二步不该考虑溶剂效应还是用的溶剂模型不合适?亦或需计算溶剂化能?

先谢了!

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2017-11-11 11:56:33 | 只看该作者 Only view this author
hzfish 发表于 2017-11-11 10:19
LMO-EDA中静电成份的论述如下图,其中electron-electron charge penetration和nucleus-electron charge pen ...

这个用词有点怪
你就理解为是两个H的电子分布范围比较接近,静电互斥明显,同时原子核与对方的电子密度分布也比较近,因此也有强静电吸引就完了
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wxy 发表于 2017-11-11 10:57
Sob老师:对一天然产物做ECD计算,我在构象分析中,用“opt freq B3LYP/def2svp scrf=(solvent=methanol)” ...

审稿人莫名其妙,你的计算是绝对没有问题的。如果甲醇就是你实际的溶剂,随便找一些用隐式溶剂模型计算ECD的文献堵回去
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发表于 Post on 2017-11-11 12:17:30 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2017-11-11 11:56
这个用词有点怪
你就理解为是两个H的电子分布范围比较接近,静电互斥明显,同时原子核与对方的电子密度 ...

谢谢社长!
还有文献把静电成份和电子云重叠联系起,该如何理解呢?


还有一个问题:SAPT-EDA中大小的诱导成份说明共价大,如何理解?


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 楼主 Author| 发表于 Post on 2017-11-11 12:43:58 | 只看该作者 Only view this author
hzfish 发表于 2017-11-11 12:17
谢谢社长!
还有文献把静电成份和电子云重叠联系起,该如何理解呢?

重叠大就静电相互作用大呗
我不知道SAPT-EDA是什么。EDA通常用来指代源自morokuma思想的能量分解方法,和SAPT思路差异极大。
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发表于 Post on 2017-11-11 13:44:13 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2017-11-11 11:57
审稿人莫名其妙,你的计算是绝对没有问题的。如果甲醇就是你实际的溶剂,随便找一些用隐式溶剂模型计算EC ...

谢谢Sob老师!我一直是这样做的,以前从没有人提过类似问题。Sob老师说没问题我放心了。

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