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楼主 Author: sobereva
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[综合交流] 简单量子化学问题答疑专帖(旧版,已关帖)

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发表于 Post on 2018-1-9 15:26:35 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2018-1-9 04:46
单参考通常是基于HF波函数作为参考态波函数,在此之上通过耦合簇、微扰、CI等手段考虑动态相关
多参考则 ...

sob 老师  那HF波函数和casscf波函数有啥区别呢

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发表于 Post on 2018-1-9 16:37:37 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 329678001 于 2018-1-11 20:47 编辑

各位老师,我最近算金属吸附能时,所算的金属的吸附能1000多kcal/mol, sob老师在群里说我这不是计算级别的问题。可是我的建模、基本流程和数据读取也没什么问题啊。下面是我算的吸附能,3个log文件。其中Rh是+3价,POM是-3价  RhPOM是0价的。吸附能是用自由能算的。吸附能=RhPOM-POM-Rh    如果实在不行,这个数据我就不能用了.万分感谢。重新上传了,谢谢社长。

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发表于 Post on 2018-1-9 17:03:40 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2018-1-8 18:22
IRC计算时必须加ultrafine,不要加tight

谢谢老师!
在初猜过渡态建模的时候,根据反应机理只需要适当调整参与反应的原子之间的距离以及角度之类的,不需要执着于GV中键的显示吧

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2018-1-9 17:12:16 | 只看该作者 Only view this author
329678001 发表于 2018-1-9 16:37
各位老师,我最近算金属吸附能时,所算的金属的吸附能1000多kcal/mol, sob老师在群里说我这不是计算级别的 ...

http://bbs.keinsci.com/forum.php?mod=viewthread&tid=7462
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2018-1-9 17:12:29 | 只看该作者 Only view this author
火烈鸟小唐 发表于 2018-1-9 17:03
谢谢老师!
在初猜过渡态建模的时候,根据反应机理只需要适当调整参与反应的原子之间的距离以及角度之类 ...

北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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发表于 Post on 2018-1-10 14:07:18 | 只看该作者 Only view this author
老师,您好!我的体系里有过渡金属离子,在结构优化时需要考虑溶剂效应吗?或者我可以先进行结构优化,然后用优化好的结构考虑溶剂化效应计算单点能?

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发表于 Post on 2018-1-10 14:53:48 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 jingruoyoulan 于 2018-1-10 14:55 编辑

sob老师,您好!正在构建K2O的团簇结构(1)裸簇opt能收敛,表面和内部个别原子位置变形(文件1,Na2O结构和K2O一样),说明裸簇结构应该没有问题吧?(2)添加上背景电荷后(文件2),做opt一步都不能进行,SCF不收敛(文件3),尝试用老师博客《解决SCF不收敛问题的方法》进行解决,折腾了好长时间,但依然没法收敛……认为应该是背景电荷的问题,可不能发现其中的问题,请sob 老师指点,谢谢! 1.gjf (2.45 KB, 下载次数 Times of downloads: 2) 2.gjf (24.3 KB, 下载次数 Times of downloads: 2) 3.gjf (21.68 KB, 下载次数 Times of downloads: 2)

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2018-1-10 14:56:49 | 只看该作者 Only view this author
zzz 发表于 2018-1-10 14:07
老师,您好!我的体系里有过渡金属离子,在结构优化时需要考虑溶剂效应吗?或者我可以先进行结构优化,然后 ...

优化时候就考虑隐式溶剂模型,耗时只会增加15%左右而已
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2018-1-10 15:38:28 | 只看该作者 Only view this author
jingruoyoulan 发表于 2018-1-10 14:53
sob老师,您好!正在构建K2O的团簇结构(1)裸簇opt能收敛,表面和内部个别原子位置变形(文件1,Na2O结构 ...

文件2没看到有背景电荷,文件3倒是有。
先确保不加能跑,然后一点点加上去,反复尝试。一次加太多。出了问题也不容易确定原因。
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发表于 Post on 2018-1-10 15:58:37 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2018-1-10 15:38
文件2没看到有背景电荷,文件3倒是有。
先确保不加能跑,然后一点点加上去,反复尝试。一次加太多。出了 ...

谢谢sob老师,文件2中显示的原子是电荷的位置,已确保不加能跑(文件1做opt能正常结束),加上电荷后SCF计算第一个cycle的MaxDP一直都特别高,一般都是10^4,很难收敛……我一点一点加背景电荷来试着计算

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发表于 Post on 2018-1-10 20:42:29 | 只看该作者 Only view this author

IRC出错

请教个问题,我做的IRC图如下,在下降的过程中出现一个小凸起,然后分子结构就又跑回开始的结构了,过渡态也已经calcall过了,试了stepsize=30也跳不过这个凸起,没办法了,来请教大家。附件有输出文件,谢谢大家啦!

irc.png (33.38 KB, 下载次数 Times of downloads: 9)

irc.png

co-hco-irc-2-calcall-stepsize30.log

166.26 KB, 下载次数 Times of downloads: 5

IRC输出文件

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发表于 Post on 2018-1-10 20:44:26 | 只看该作者 Only view this author

混合溶剂化

采用了乙腈和水1:1混合物作溶剂,但是我只会在gaussian里面设置单一溶剂,请教各位大神混合溶剂怎样设置呀,谢谢大家了

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发表于 Post on 2018-1-10 20:47:30 | 只看该作者 Only view this author
sob老师,计算的S1到S0,S2到S0和S3到S0的振子强度都为0,但是实验上能观测到荧光,这该怎么解释?
还有,T1到S0和T2到S0的振子强度也都为0,实验上能观测到磷光,这该怎么解释?

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发表于 Post on 2018-1-11 00:52:10 | 只看该作者 Only view this author

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发表于 Post on 2018-1-11 00:52:58 | 只看该作者 Only view this author
calcall是说的给IRC用,不是给过渡态优化用。
过渡态用opt=tight优化至收敛

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