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楼主 Author: sobereva
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[综合交流] 简单量子化学问题答疑专帖(旧版,已关帖)

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发表于 Post on 2018-7-2 18:41:55 | 只看该作者 Only view this author
大家下午好!请问计算锌卟啉体系(含C,H,O,N,B,F,Zn等七种元素)时,对Zn采用哪种赝势合适呢?可否不用赝势,对所有元素(C,H,O,N,B,F,Zn)都采用b3lyp/6-31g(d)呢?

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发表于 Post on 2018-7-2 21:04:54 | 只看该作者 Only view this author
请问Sob老师,记得群里之前有讨论过,就是过渡态走IRC,末端结构还是自己设想的“极小点”结构。结果拿出这个点继续优化,就是另外一个不同的结构了。是否说明这个过渡态不合理呢?但是振动趋势是正确的呢。
自己决定自己的DNA

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2018-7-2 22:07:55 | 只看该作者 Only view this author
安衎然 发表于 2018-7-2 18:41
大家下午好!请问计算锌卟啉体系(含C,H,O,N,B,F,Zn等七种元素)时,对Zn采用哪种赝势合适呢?可否不 ...

谈谈赝势基组的选用
http://sobereva.com/373
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2018-7-2 22:08:47 | 只看该作者 Only view this author
QuantumHan 发表于 2018-7-2 21:04
请问Sob老师,记得群里之前有讨论过,就是过渡态走IRC,末端结构还是自己设想的“极小点”结构。结果拿出这 ...

不能说明,必须先排除其他因素
优化时候减小步长上限,用recalc/calcal在优化过程中l给更好的Hessian矩阵再试
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2018-7-2 22:09:14 | 只看该作者 Only view this author
jackie 发表于 2018-7-2 17:14
请问一下,分子力场中有关键长和键角项中的力常数参数是根据什么得来的?


有不同获得方法,比如向量化扫描的势能曲线拟合来获得,或者利用计算或实验的振动频率来获得
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2018-7-2 22:11:41 | 只看该作者 Only view this author
不懂计算 发表于 2018-7-2 14:32
sob老师好,复合物分子由3种分子构成,其中1个分子的铀酰离子,2个分子的B,3个分子的C。在铀原子的赤道平 ...

还得考虑溶剂化作用能的影响。
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发表于 Post on 2018-7-2 22:24:02 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2018-7-2 22:11
还得考虑溶剂化作用能的影响。

sob老师,溶剂化作用能要怎么算呀?  我算的时候,在气相和水溶液的结合能 公式都是用的同一个

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发表于 Post on 2018-7-2 22:28:27 | 只看该作者 Only view this author
#7082 的提问太啰嗦,简化后再次提问,请老师知道一下
为了确定CuFeO2的自旋多重度
使用b3lyp/def2tzvp 和 PBE/6-311G**分别优化不同自旋多重度的CuFeO2。
两套计算 给出的能量大小的规律 有矛盾,该取信哪个?
单体的自旋多重度和多个单体组成的团簇的的自旋多重度之间有什么联系吗?(我是遇到自旋多重度问题就跪的那种小白)
恍惚月余,深谙人与人之间的差距。以后还应努力学习,才能与强者比肩。

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2018-7-2 23:03:42 | 只看该作者 Only view this author
ABetaCarw 发表于 2018-7-2 13:17
老师好,我在计算CuFeO2这种物质负载在C3N4上面的性质,需要找到负载的这个CuFeO2对原本的C3N4的电子结构的 ...

1 根据基本化学知识以及B3LYP的数据,应当用六重态。也可以考虑用B3LYP*,对过渡金属体系给出的不同自旋多重度的能级顺序比B3LYP更可靠一些
2 先当做单重态来算,并且做波函数稳定性测试看看是否稳定。不稳定的话考虑尝试对称破缺计算以及其它自旋多重度,看看能否得到更低能量,或者用stable=opt看看找出来的波函数对应什么状态
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2018-7-2 23:04:06 | 只看该作者 Only view this author
不懂计算 发表于 2018-7-2 22:24
sob老师,溶剂化作用能要怎么算呀?  我算的时候,在气相和水溶液的结合能 公式都是用的同一个

谈谈隐式溶剂模型下溶解自由能和体系自由能的计算
http://sobereva.com/327
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发表于 Post on 2018-7-3 10:48:04 | 只看该作者 Only view this author
老师好,XPS 表征发现,CuFeO2在与C3N4材料复合后,里面的Cu、Fe的结合能的峰位置发生了负向偏移,做哪类计算可以探索一下偏移的原因?
在论坛内检索,老师对于有计算XPS需求的同学都建议计算绘制DOS。
1 请问还有什么其他途径可以进行相关的研究 就是研究偏移的原因。
2 DOS图做完后还可以做什么深入的波函数分析吗?
Multiwfn 功能多到让我有点懵。
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发表于 Post on 2018-7-3 11:01:56 | 只看该作者 Only view this author
请教大家两个问题:
1、超胞的带隙总是比单胞小,有人说是带隙折叠,那有什么方法如设置K点使二者一致吗?
2、castep计算过渡态金属时要加U,单胞和超胞的U值一样吗?
谢谢!

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发表于 Post on 2018-7-3 12:23:51 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2018-7-2 22:09
有不同获得方法,比如向量化扫描的势能曲线拟合来获得,或者利用计算或实验的振动频率来获得

具体怎么获得的有没有哪篇文献或者书籍参考一下?

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2018-7-3 14:26:53 | 只看该作者 Only view this author
hgkjqx 发表于 2018-7-3 11:01
请教大家两个问题:
1、超胞的带隙总是比单胞小,有人说是带隙折叠,那有什么方法如设置K点使二者一致吗? ...

这属于第一性原理问题,请到第一性原理版块发帖
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2018-7-3 14:27:37 | 只看该作者 Only view this author
jackie 发表于 2018-7-3 12:23
具体怎么获得的有没有哪篇文献或者书籍参考一下?


多找些力场原文和拟合力场参数的程序的文章看
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