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楼主 Author: sobereva
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[综合交流] 简单量子化学问题答疑专帖(旧版,已关帖)

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2018-10-13 00:25:32 | 只看该作者 Only view this author
lufenghxu 发表于 2018-10-12 23:35
老师,我在寻找3c-2e轨道的时候输入文件的末尾是这样写的:
$NBO
$END

用Multiwfn的轨道定域化分析,如果本应有3c-2e,直接就会找到对应的轨道
Multiwfn的轨道定域化功能的使用以及与NBO、AdNDP分析的对比
http://sobereva.com/380

或者用Multiwfn的AdNDP搜索
使用AdNDP方法以及ELF/LOL、多中心键级研究多中心键
http://sobereva.com/138
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2018-10-13 00:26:02 | 只看该作者 Only view this author
lijiaqi 发表于 2018-10-12 16:25
老师,你好。我做振动分辨电子光谱计算,其中一直出现Error termination via Lnk1e in /share/apps/g09.D01 ...

提问时候说报错提示,别问lxxx出错
提问Gaussian问题的注意事项;Gaussian FAQ
http://bbs.keinsci.com/forum.php?mod=viewthread&tid=4829
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2018-10-13 00:32:53 | 只看该作者 Only view this author
看7788L的回复。
怎么绘制光谱这里写得极其明白
Gaussian中用TDDFT计算激发态和吸收、荧光、磷光光谱的方法
http://sobereva.com/314

求助帖别发到资源分享版,发帖时候看清楚板块再发,这在论坛首页的公告栏里都已经高亮特别提示了。给你移动了,以后注意
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发表于 Post on 2018-10-13 09:58:00 | 只看该作者 Only view this author
sob老师您好!请教一下:gview中能不能做到只保留某一个氢,而把其他大量的氢删掉的简捷办法,不论是一个一个的删原子或者在文件里删坐标都很费事,因为氢原子太多

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发表于 Post on 2018-10-13 15:25:26 | 只看该作者 Only view this author
老师,CMO轨道和定域轨道之间,CMO和NBO之间有没有关联和对应(组分什么的)关系?

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发表于 Post on 2018-10-13 18:42:18 | 只看该作者 Only view this author
问题一:反应过程中,正则分子轨道之间作用时(比如homo和lumo)是不是除了轨道的相位要匹配,轨道的形状从外观上看也要匹配?否则没有说服力。
问题二:NBO轨道之间的相互作用是不是也可以从问题一中描述的两个方面(相位,形状)描述和解释?

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2018-10-14 00:39:04 | 只看该作者 Only view this author
498746012 发表于 2018-10-13 09:58
sob老师您好!请教一下:gview中能不能做到只保留某一个氢,而把其他大量的氢删掉的简捷办法,不论是一个一 ...

在atom list editor里面先排序,把所有氢排到重原子后头,然后选中除了感兴趣的氢以外的氢,然后删除
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2018-10-14 00:41:31 | 只看该作者 Only view this author
erya123 发表于 2018-10-13 15:25
老师,CMO轨道和定域轨道之间,CMO和NBO之间有没有关联和对应(组分什么的)关系?

都是线性变换关系,CMO可以写为LMO或NBO的线性组合,反之亦然
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2018-10-14 00:44:20 | 只看该作者 Only view this author
lily19830130 发表于 2018-10-13 18:42
问题一:反应过程中,正则分子轨道之间作用时(比如homo和lumo)是不是除了轨道的相位要匹配,轨道的形状从 ...

主要是俩轨道之间的重叠积分得大,形状匹配得合适得话重叠积分才可能比较大

高占据和低占据NBO之间产生明显超共轭要求对应的NBO为基下的Fock矩阵元得大,轨道重叠程度大是这个大的前提
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发表于 Post on 2018-10-14 09:34:03 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2018-10-14 00:39
在atom list editor里面先排序,把所有氢排到重原子后头,然后选中除了感兴趣的氢以外的氢,然后删除

谢谢sob老师耐心的讲解

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发表于 Post on 2018-10-14 16:16:13 | 只看该作者 Only view this author
sob老师,五水合铀酰离子的计算水平是B3LYP/6-311++G**(RLC ECP),PCM溶剂模型。几何结构分析时发现水溶液下的U-OH2键键长比气相下的短,在文章中应该如何解释呀?

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2018-10-15 00:18:31 | 只看该作者 Only view this author
不懂计算 发表于 2018-10-14 16:16
sob老师,五水合铀酰离子的计算水平是B3LYP/6-311++G**(RLC ECP),PCM溶剂模型。几何结构分析时发现水溶液 ...

这个没有什么简单的解释
如果有人死活非要让你解释,试图解释成水环境会使得水和UO2的电子分布被极化,导致水孤对电子更显著(静电势更负)、UO2与水结合的区域静电更正,加强了静电作用
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发表于 Post on 2018-10-15 08:48:49 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2018-10-15 00:18
这个没有什么简单的解释
如果有人死活非要让你解释,试图解释成水环境会使得水和UO2的电子分布被极化, ...

感谢sob老师,谢谢

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发表于 Post on 2018-10-15 08:56:45 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 wfmf1994 于 2018-10-15 08:58 编辑
sobereva 发表于 2018-10-11 22:13
这里说了
在Gaussian中计算IRC的方法和常见问题
http://sobereva.com/400

不好意思,回复错了,如何删除

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发表于 Post on 2018-10-15 08:57:45 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2018-10-11 22:14
算单点用的级别比几何优化高是常规做法,看
浅谈为什么优化和振动分析不需要用大基组
http://sobereva. ...

老师,我的意思是如果对同一个反应有A和B两篇文章 A用的是M06/6-311++G(2d,2p)//B3PW91/6-31G**B用的是M06/6-311++G(2d,2p)//B3LYP/6-31+G**(随便编的,只为了说明情况,不一定合理) 那么这两个得出的势垒可以放在一起比较吗?

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