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楼主 Author: sobereva
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[综合交流] 简单量子化学问题答疑专帖(旧版,已关帖)

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2018-10-15 09:40:02 | 只看该作者 Only view this author
wfmf1994 发表于 2018-10-15 08:57
老师,我的意思是如果对同一个反应有A和B两篇文章 A用的是M06/6-311++G(2d,2p)//B3PW91/6-31G**B用的是M0 ...

不能
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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发表于 Post on 2018-10-15 11:07:10 | 只看该作者 Only view this author

明白了,就是必须优化和单点能计算都在同一水平下才可以相互比较。 谢谢老师

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发表于 Post on 2018-10-15 14:18:49 | 只看该作者 Only view this author
sob老师,下午好,我有个问题,在计算无能垒反应时,比如N2--N+N,先扫描NN键,然后用扫描的结果取点计算吉布斯自由能,得到的结果会出现悬崖(如图),目前计算用m062x/cc-pvdz,也换过b3lyp,ccsd,mp2,但是结果都是一样的。这是哪里出了问题呢?

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发表于 Post on 2018-10-15 18:51:02 | 只看该作者 Only view this author
老师,您好,我想请教一下,Gauss在使用的时候命令行,#后加一个字母P,有什么作用?

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2018-10-16 01:20:46 | 只看该作者 Only view this author
zhousn 发表于 2018-10-15 18:51
老师,您好,我想请教一下,Gauss在使用的时候命令行,#后加一个字母P,有什么作用?

以较详细的方式输出信息
默认情况下一些不太重要的信息是不输出的
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2018-10-16 01:23:22 | 只看该作者 Only view this author
huyongxin 发表于 2018-10-15 14:18
sob老师,下午好,我有个问题,在计算无能垒反应时,比如N2--N+N,先扫描NN键,然后用扫描的结果取点计算吉 ...

这种问题绝对不能这么算

用DFT或者常见的单参考方法,必须得按照对称破缺方式算(除非是极高级别电子相关方法诸如CCSDT,或者专门为共价键解离曲线而生的特殊方法诸如TCCSD、CR-CCSD(T)等),看
谈谈片段组合波函数与自旋极化单重态
http://sobereva.com/82

要么用CASSCF或者多参考方法诸如CASPT2
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发表于 Post on 2018-10-16 08:26:52 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2018-10-16 01:20
以较详细的方式输出信息
默认情况下一些不太重要的信息是不输出的

谢谢老师

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发表于 Post on 2018-10-16 09:01:24 | 只看该作者 Only view this author
想求教Sob老师关于M06-2X/6-311++(3df,3dp)与RI-CC2/aug-cc-pV(T+d)Z 的计算耗时对比。查找过相关文献后,无果后才来跟帖。导师急于询问结果,所以现在投算体系不能及时得到结果(我们研究大气分子团簇内的弱相互作用,一般在20-50原子间),希望老师予以帮助

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2018-10-16 09:36:17 | 只看该作者 Only view this author
devilove 发表于 2018-10-16 09:01
想求教Sob老师关于M06-2X/6-311++(3df,3dp)与RI-CC2/aug-cc-pV(T+d)Z 的计算耗时对比。查找过相关文献后, ...

用CC2算弱相互作用是搞笑,又贵又烂
6-311++(3df,3dp)给DFT用也是搞笑,瞎耽误工夫

仔细看下文了解弱相互作用基本常识和级别的选择,看完了该用什么心里自然就有数了
谈谈“计算时是否需要加DFT-D3色散校正?”
http://sobereva.com/413
DFT-D色散校正的使用
http://sobereva.com/210
乱谈DFT-D
http://sobereva.com/83
大体系弱相互作用计算的解决之道
http://sobereva.com/214
谈谈量子化学中基组的选择
http://sobereva.com/336
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发表于 Post on 2018-10-16 09:47:46 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2018-10-16 09:36
用CC2算弱相互作用是搞笑,又贵又烂
6-311++(3df,3dp)给DFT用也是搞笑,瞎耽误工夫

非常感谢老师,会细心拜读这些帖子的

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发表于 Post on 2018-10-16 10:21:50 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2018-10-16 01:20
以较详细的方式输出信息
默认情况下一些不太重要的信息是不输出的

谢谢sob老师,我会仔细看看。

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发表于 Post on 2018-10-17 08:49:34 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2018-10-13 00:32
看7788L的回复。
怎么绘制光谱这里写得极其明白
Gaussian中用TDDFT计算激发态和吸收、荧光、磷光光谱的方 ...

谢谢老师

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发表于 Post on 2018-10-17 12:05:40 | 只看该作者 Only view this author
老师,我用高斯结构优化选了TS以后为什么会出现L1的错误

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发表于 Post on 2018-10-17 12:34:07 | 只看该作者 Only view this author
请问老师,绘制分子表面静点势分布和绘制静点势填色等值面图有什么不同呢
自己决定自己的DNA

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Level 4 (黑子)

7815#
发表于 Post on 2018-10-17 22:30:29 | 只看该作者 Only view this author

Gaussian优化结构报错

各位老师好,在优化一个带两个负电荷的结构时,自旋多重度为4,输入文件如下:

%chk=1.chk
%nprocshared=14
%mem=30GB
# b3lyp/cc-pvdz opt

20180829

-2 4

报错结果如下:
Annihilation of the first spin contaminant:
S**2 before annihilation     3.7748,   after     3.7501
Convergence failure -- run terminated.
Error termination via Lnk1e in /gpfs/soft/g09/g09D/l502.exe at Wed Oct 17 20:35:56 2018.
Job cpu time:       0 days  0 hours  5 minutes  6.5 seconds.
File lengths (MBytes):  RWF=     10 Int=      0 D2E=      0 Chk=      1 Scr=      1

请问各位老师该如何解决?

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