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楼主 Author: sobereva
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[综合交流] 简单量子化学问题答疑专帖(旧版,已关帖)

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-4-3 05:00:35 | 只看该作者 Only view this author
498746012 发表于 2019-4-3 00:17
sob老师您好!高斯中LANL2TZ(f)这个基组是不是要从EMSL中拷贝呀

北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-4-3 05:00:43 | 只看该作者 Only view this author
小小范 发表于 2019-4-2 20:25
请问SDD是自带弥散的吗?

不带
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-4-3 05:01:05 | 只看该作者 Only view this author
刘小英雄steven 发表于 2019-4-2 20:14
嗯嗯,谢谢老师的解释。另一个问题,配分函数Q是否和温度T有关呢?对于一个特定的基元反应来说,Qts/QaQb ...

关系太大了,你从配分函数公式里就能明显看出来
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发表于 Post on 2019-4-3 09:32:42 | 只看该作者 Only view this author
sob老师您好!双自由基guess=mix关键词在ORCA用什么替代呢

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发表于 Post on 2019-4-3 09:39:10 | 只看该作者 Only view this author

谢谢sob老师

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-4-3 10:27:10 | 只看该作者 Only view this author
haha 发表于 2019-4-3 09:32
sob老师您好!双自由基guess=mix关键词在ORCA用什么替代呢

我以前的笔记
这是计算自旋极化单重态的C4H8双自由基例子。rotate {15, 16, 45}代表把16、17号(orca从0开始算序号)轨道均等地混合(45度)。如果90度就代表交换两个轨道,如果180度就代表相位反转。还可以rotate { MO1, MO2, Angle, Operator1, Operator2 },这里operator1、operator2设的是MO1和MO2的自旋类型,0代表alpha,1代表beta
! UKS B3LYP/G SVP noautostart
%scf
rotate {15, 16, 45} end
end
* xyz 0 1
C                 -0.74400100    1.78566400    0.00000000
H                 -0.60282700    2.33865300    0.92499500
H                 -0.60282700    2.33865300   -0.92499500
C                 -0.74400100    0.30988100    0.00000000
H                 -1.25452600   -0.08746700    0.88463900
H                 -1.25452600   -0.08746700   -0.88463900
C                  0.74400100   -0.30988100    0.00000000
H                  1.25452600    0.08746700   -0.88463900
H                  1.25452600    0.08746700    0.88463900
C                  0.74400100   -1.78566400    0.00000000
H                  0.60282700   -2.33865300   -0.92499500
H                  0.60282700   -2.33865300    0.92499500
*
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发表于 Post on 2019-4-3 21:12:49 | 只看该作者 Only view this author
社长,有个分子有光致顺反异构的情况。我是不是可以通过优化激发态的某种构型 看看最终是不是优化出近似另一种构型,来确定?比如基态下是顺式,然后TD opt,发现优化出反式构型。这样证明是可以光致顺反异构?
如果这个想法比较可笑 还请社长提示一些研究方法,或者相关文献
恍惚月余,深谙人与人之间的差距。以后还应努力学习,才能与强者比肩。

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发表于 Post on 2019-4-3 22:38:20 | 只看该作者 Only view this author

那请问sob老师,计算EuSin 带一个负电荷的单点能,基组是要选SDD吧,那要加弥散吗?

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-4-4 06:21:34 | 只看该作者 Only view this author
小小范 发表于 2019-4-3 22:38
那请问sob老师,计算EuSin 带一个负电荷的单点能,基组是要选SDD吧,那要加弥散吗?

Eu用SDD,或者更好的def2-TZVP
需要加弥散
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-4-4 06:38:29 | 只看该作者 Only view this author
ABetaCarw 发表于 2019-4-3 21:12
社长,有个分子有光致顺反异构的情况。我是不是可以通过优化激发态的某种构型 看看最终是不是优化出近似另 ...

可以
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发表于 Post on 2019-4-4 10:11:21 | 只看该作者 Only view this author
老师 你好
我在你的帖子中看到NTO没有LUMO、HOMO的概念,所以不能用HOMO,LUMO来描述。
刚才在一篇文献中看到作业在做NTO分析的时候,把两个轨道定义为HONTO (highest occipied natural transition orbital) 和LUNTO (Lowest unoccupied natural transition orbital),请问这样的描述可行吗?

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发表于 Post on 2019-4-4 12:52:41 | 只看该作者 Only view this author

https://pubs.acs.org.ccindex.cn/doi/suppl/10.1021/ja038327y
社长好,我在 上面那个文章里面发现 作者做了在S0 S1 T1下的势能面扫描。
S0应该就是 正常基态扫描就好了。T1也好办,直接设置自旋多重度为3 就好了。S1该怎么办 自旋多重度设为1 然后关键词里面写TD?
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-4-4 14:39:18 | 只看该作者 Only view this author
Yin 发表于 2019-4-4 10:11
老师 你好
我在你的帖子中看到NTO没有LUMO、HOMO的概念,所以不能用HOMO,LUMO来描述。
刚才在一篇文献中 ...

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-4-4 14:40:22 | 只看该作者 Only view this author
ABetaCarw 发表于 2019-4-4 12:52
https://pubs.acs.org.ccindex.cn/doi/suppl/10.1021/ja038327y
社长好,我在 上面那个文章里面发现 作 ...

y
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发表于 Post on 2019-4-6 20:24:54 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 lufenghxu 于 2019-4-6 22:35 编辑

老师问一个能垒的老问题。如下图所示,黑色的能垒图中能垒差比蓝色的路径要小,但是反应物的能量却比较大,在蓝色路径的上面。蓝色的反应物能量比较小,但是要说能垒的话第二步比较大。我的问题是,一哪个反应路径比较容易进行。二如何说明蓝色路径容易进行呢?

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