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楼主 Author: sobereva
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[综合交流] 简单量子化学问题答疑专帖(旧版,已关帖)

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-5-13 00:08:08 | 只看该作者 Only view this author
dingniu2 发表于 2019-5-12 12:10
谢谢老师,如果在做TS时关键词为 opt(TS,calcfc,noeigen) freq,有这个freq关键词也不行吗?

此时最后chk里的Hessian就是当前结构的精确Hessian
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-5-13 00:12:02 | 只看该作者 Only view this author
erya123 发表于 2019-5-12 11:32
老师,gaussian能不能给出分子的term symber 和electronic configuration,例如1σ22σ21π41π4,1Σ+

计算双原子分子时Gaussian可以给出轨道是sigma还是pi的信息,在输出不可约表示的那部分
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发表于 Post on 2019-5-13 12:10:33 | 只看该作者 Only view this author
老师 你好,我想使用molclus程序调用Gaussian计算相互作用能,请问如何添加BSSE色散校正在模板文件里?本人添加了关键词counterpoise=2, 并在.xyz文件中标注出原子片段。但是进行计算就闪退,如何解决(体系32个原子)

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发表于 Post on 2019-5-13 12:28:55 | 只看该作者 Only view this author
请问Sob老师,想用CCSD(T)/cc-pVTZ和CCSD(T)/cc-pVQZ外推到CCSD(T)/CBS,CCSD(T)/cc-pVTZ单点能是用Gaussian程序做的,CCSD(T)/cc-pVQZ耗时太久了,体系13个原子。考虑想用ORCA程序CCSD(T)-F12计算CCSD(T)/cc-pVQZ级别的单点能。这样换程序计算的话合适吗?
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发表于 Post on 2019-5-13 12:32:26 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2019-5-13 00:08
此时最后chk里的Hessian就是当前结构的精确Hessian

多谢老师,这时将TS.chk另存为成IRC.chk,在IRC输入文件中写 Geom=chk IRC(readfc)就可以了,结果与写IRC=calcfc是一样的还能节省时间,是吗?

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-5-13 13:06:06 | 只看该作者 Only view this author
842655799 发表于 2019-5-13 12:10
老师 你好,我想使用molclus程序调用Gaussian计算相互作用能,请问如何添加BSSE色散校正在模板文件里?本人 ...

molclus调用时不支持counterpoise关键词,这不属于标准能量计算任务
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-5-13 13:07:03 | 只看该作者 Only view this author
dingniu2 发表于 2019-5-13 12:32
多谢老师,这时将TS.chk另存为成IRC.chk,在IRC输入文件中写 Geom=chk IRC(readfc)就可以了,结果与写IRC ...

应该是IRC=rcfc。用readfc可能运行不了

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-5-13 13:07:41 | 只看该作者 Only view this author
QuantumHan 发表于 2019-5-13 12:28
请问Sob老师,想用CCSD(T)/cc-pVTZ和CCSD(T)/cc-pVQZ外推到CCSD(T)/CBS,CCSD(T)/cc-pVTZ单点能是用Gaussia ...

不合适
CCSD(T)-F12没法严格得到对应于CCSD(T)/cc-pVQZ的能量
CCSD(T)/cc-pVQZ直接算不动你就借助MP2来外推。或者通过DLPNO-CCSD(T)来外推
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发表于 Post on 2019-5-13 13:32:26 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2019-5-13 13:07
不合适
CCSD(T)-F12没法严格得到对应于CCSD(T)/cc-pVQZ的能量
CCSD(T)/cc-pVQZ直接算不动你就借助MP2来 ...

多亏了Sob老师,茅塞顿开。
就是这样吧:E(CCSD(T)/cc-pVQZ) ≈ E(MP2/cc-pVQZ) - E(MP2/cc-pVDZ) + E(CCSD(T)/cc-pVDZ)
自己决定自己的DNA

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发表于 Post on 2019-5-13 13:37:56 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2019-5-13 13:07
不合适
CCSD(T)-F12没法严格得到对应于CCSD(T)/cc-pVQZ的能量
CCSD(T)/cc-pVQZ直接算不动你就借助MP2来 ...

还有个疑问,1、CCSD(T)/cc-pVTZ没有外推,直接计算得到。CCSD(T)/cc-pVQZ是外推得到的能量。再最终外推到CCSD(T)/CBS,这样是可行的吧?
2、CCSD(T)/cc-pVTZ的能量不外推可以吗?
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发表于 Post on 2019-5-13 13:41:00 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2019-5-13 13:06
molclus调用时不支持counterpoise关键词,这不属于标准能量计算任务

谢谢老师 那我是不是应该把坐标拿出来进行相互作用能计算 那原子连接怎么填写?

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发表于 Post on 2019-5-13 21:53:48 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2019-5-13 00:12
计算双原子分子时Gaussian可以给出轨道是sigma还是pi的信息,在输出不可约表示的那部分

老师,我计算的双原子分子其中一个的orbital symmetries 如下:Orbital symmetries:
     Orbital symmetries:
       Occupied  (SG) (SG) (SG) (PI) (PI) (SG) (PI) (PI) (PI) (PI)
                 (SG) (DLTA) (DLTA) (PI) (PI) (DLTA) (DLTA) (SG)
The electronic state is 1-SG。
是不是可以说电子组态是π2δ4σ2,表示为1Σ。
另一个例子是单原子,结果如下,Orbital symmetries:
       Occupied  (SG) (SG) (PI) (PI) (SG) (SG) (PI) (PI) (PI) (PI)
                 (?A) (?A) (SG) (PI) (PI) (?A) (SG)
Unable to determine electronic state:  an orbital has unidentified symmetry.
不知道里面的问号是什么意思?最后说对称性没有确定,怎么回事?

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发表于 Post on 2019-5-13 22:55:10 | 只看该作者 Only view this author
sob老师您好,这是一个可能有点蠢的问题……
请问如何看Windows上的Gaussian16是32位还是64位以及是否支持并行?
版本信息似乎只找到了这个:EM64W-G16RevA.03。非常感谢您!

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-5-14 03:29:13 | 只看该作者 Only view this author
DoorBell 发表于 2019-5-13 22:55
sob老师您好,这是一个可能有点蠢的问题……
请问如何看Windows上的Gaussian16是32位还是64位以及是否支持 ...

写着64显然是64bit的
你试一下能并行就能并行
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-5-14 03:29:43 | 只看该作者 Only view this author
842655799 发表于 2019-5-13 13:41
谢谢老师 那我是不是应该把坐标拿出来进行相互作用能计算 那原子连接怎么填写?

counterpoise哪有原子链接的事?这只看坐标。连接关系根本不影响结果
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