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楼主 Author: sobereva
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[综合交流] 简单量子化学问题答疑专帖(旧版,已关帖)

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发表于 Post on 2019-5-5 13:25:20 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2019-5-5 11:45
Gaussian的安装方法及运行时的相关问题
http://sobereva.com/439(http://bbs.keinsci.com/thread-10814 ...

谢谢老师,我现在已经装好gaussian了,只是想知道远程使用服务器进行gaussian计算任务需要用到的东西,希望能有针对性的学习一下

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发表于 Post on 2019-5-5 13:25:56 | 只看该作者 Only view this author
naoki 发表于 2019-5-5 10:00
Gaussian的安装方法及运行时的相关问题 http://sobereva.com/439(http://bbs.keinsci.com/thread-10814-1- ...

您是用服务器吗,还是自己装了linux系统,有图形界面?

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发表于 Post on 2019-5-5 14:45:36 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2019-5-5 11:46
对应收缩方式。这个对应6s 4p 3d 1f

好的 谢谢老师

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发表于 Post on 2019-5-5 17:51:55 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2019-5-5 11:46
对应收缩方式。这个对应6s 4p 3d 1f

老师  我还是没有明白为什么要对Ir设置这样的收缩方式呢?6s 4p 3d 1f  这个要怎么分析呢?

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-5-6 09:19:01 | 只看该作者 Only view this author
jing-quan63 发表于 2019-5-5 13:25
谢谢老师,我现在已经装好gaussian了,只是想知道远程使用服务器进行gaussian计算任务需要用到的东西,希 ...

没有什么可学的,无非就是ssh登录服务器,运行Gaussian命令而已
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-5-6 09:44:57 | 只看该作者 Only view this author
Yin 发表于 2019-5-5 17:51
老师  我还是没有明白为什么要对Ir设置这样的收缩方式呢?6s 4p 3d 1f  这个要怎么分析呢?

这是我以前的笔记:
使用ANO系列基组(ANO-x、ANO-RCC、ANO-DK3皆是)时候比较特殊,要比如对碳可以这么来写Basis=ano-1 3 2 0 0,代表使用ANO-1基组,使用3s2p0d0f收缩方式。从ANO基组定义可知,对于碳原子,spdf都有定义,原始的收缩方式是7s7p4d3f,自己用ANO-1的时候应当小于等于它。根据ANO基组的思想,同一角动量在收缩时,越往后的重要性越低。从自带基组库里ANO-1的碳的定义部分也可以看到注释
* Contraction range: 3s2p1d   - 4s3p2d1f for SCF                       *
*                    4s3p2d1f - 6s5p3d2f for correlated wavefunctions  *
告诉你对于不同类型计算恰当的收缩形式的范围。
还不懂的话去看看ANO原文或molcas手册里关于ANO的部分,了解了ANO系列基组的构建思想就明白了。
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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发表于 Post on 2019-5-6 10:43:23 | 只看该作者 Only view this author
求问sob老师,我是做化工的,但是也需要做量子化学的内容,最近也在看您发的帖子,我有一个问题。我是做离子液体水溶液吸收酸性气体的,第一步是要先优化我用的有机分子结构,因为我在液相中反应,水分子是参与反应的,所以我想知道我再最初优化有机分子的时候,用不用考虑隐式溶剂模型。我是小白,如有说的不对的地方,还请老师指出。谢谢

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发表于 Post on 2019-5-6 11:03:15 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2019-5-6 09:44
这是我以前的笔记:
还不懂的话去看看ANO原文或molcas手册里关于ANO的部分,了解了ANO系列基组的构建思 ...

谢谢老师~

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发表于 Post on 2019-5-6 11:28:26 | 只看该作者 Only view this author
老师您好,使用BP86泛函进行计算的时候,单重态与三重态的能量差为7.5,结果可信吗?可以考虑是两态反应吗?谢谢老师

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发表于 Post on 2019-5-6 21:15:16 | 只看该作者 Only view this author

如何用高斯计算总能量,生成热,收敛梯度

如何用高斯软件计算得到化合物的能量参数:总能量(Total energy),生成热(Heat of formation),收敛梯度(Convergent gradient)

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发表于 Post on 2019-5-6 23:08:50 | 只看该作者 Only view this author
老师您好!在TDDFT下做势能面扫描(利用您提供的molclus工具生成输入文件,关键字# td=(singlets,nstates=6) wb97xd/6-311g**)输出文件中的“SCF Done:  E(RwB97XD)”和“Total Energy, E(TD-HF/TD-DFT)”是不是分别代表了该构象下基态和激发态的能量值?是否能通过此方法证明某个分子没有荧光是因为S1和S0势能面太过接近(从而导致非辐射跃迁强)的原因?

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发表于 Post on 2019-5-6 23:52:20 | 只看该作者 Only view this author
sob老师您好!打扰您了,您在帖子中讲到orca的安装,如何用后台算orca呀?

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-5-7 07:38:54 | 只看该作者 Only view this author
498746012 发表于 2019-5-6 23:52
sob老师您好!打扰您了,您在帖子中讲到orca的安装,如何用后台算orca呀?

末尾加上&
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-5-7 07:40:10 | 只看该作者 Only view this author
月光下的演绎 发表于 2019-5-6 11:28
老师您好,使用BP86泛函进行计算的时候,单重态与三重态的能量差为7.5,结果可信吗?可以考虑是两态反应吗 ...

光从这么个数值上没法说可不可信,你连单位也没写。只能说可能是正常数值。没有额外的信息也没法判断是不是两态反应(如果你能找到对应的MECP,而且极小点到达MECP能垒不太高,才有可能是两态反应)
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-5-7 07:41:20 | 只看该作者 Only view this author
haos314 发表于 2019-5-6 23:08
老师您好!在TDDFT下做势能面扫描(利用您提供的molclus工具生成输入文件,关键字# td=(singlets,nstates=6 ...


如果能量差很小,而且S1的振子强度数值很小,那么有可能由于S1-S0的内转换是主要退激路径因此导致观测不到荧光
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