简单量子化学问题答疑专帖（旧版，已关帖）

sobereva · 发表于 Post on 2019-5-17 01:03:52

lily19830130 发表于 2019-5-16 22:22
老师，态密度分析时，两个组分结构对复合物的轨道都有贡献，能说明什么问题？还是仅仅是组分。如果都有贡献 ...

有共同贡献什么也说明不了，下文中介绍OPDOS的时候专门说了这个点
使用Multiwfn绘制态密度(DOS)图考察电子结构
http://sobereva.com/482（http://bbs.keinsci.com/thread-13242-1-1.html）

sobereva · 发表于 Post on 2019-5-17 01:04:49

白雪少年发表于 2019-5-16 08:06
不好意思，老师，是我的表述有问题。我的意思是激发态和计算基态时处理能量的方式方法是不是一致的（比如 ...

激发态和基态计算用的泛函、基组可以不同

处理能量的方式相同

lufenghxu · 发表于 Post on 2019-5-17 10:07:44

老师，relative energy 指的是gaussian 里面的哪个能量值？是不是从gaussview里面的result里面的能量值？

sobereva · 发表于 Post on 2019-5-17 18:21:40

lufenghxu 发表于 2019-5-17 10:07
老师，relative energy 指的是gaussian 里面的哪个能量值？是不是从gaussview里面的result里面的能量值？

没上下文没法说
不要用gaussview去读能量相关的数据，往往都是错的。数据一律自己从输出文件里读

不懂计算 · 发表于 Post on 2019-5-17 20:17:11

sobereva 发表于 2019-5-17 01:03
导出每一帧的图像，用ffmpeg合并成无限循环的gif

好的谢谢老师，我捣鼓发现 GV下可以设置循环次数的

kibZHF · 发表于 Post on 2019-5-17 21:22:00

在用gaussian 09 计算时出错，提示信息有两个，l101.exe已停止工作和 severe error message # 2070
The processing of the last link ended abnormally. All processing has been aborted.
运行文件如下：
Entering Link 1 = d:\guassian\l1.exe PID=    1452.

Copyright (c) 1988,1990,1992,1993,1995,1998,2003,2009, Gaussian, Inc.
               All Rights Reserved.

This is part of the Gaussian(R) 09 program.  It is based on
the Gaussian(R) 03 system (copyright 2003, Gaussian, Inc.),
the Gaussian(R) 98 system (copyright 1998, Gaussian, Inc.),
the Gaussian(R) 94 system (copyright 1995, Gaussian, Inc.),
the Gaussian 92(TM) system (copyright 1992, Gaussian, Inc.),
the Gaussian 90(TM) system (copyright 1990, Gaussian, Inc.),
the Gaussian 88(TM) system (copyright 1988, Gaussian, Inc.),
the Gaussian 86(TM) system (copyright 1986, Carnegie Mellon
University), and the Gaussian 82(TM) system (copyright 1983,
Carnegie Mellon University). Gaussian is a federally registered
trademark of Gaussian, Inc.

This software contains proprietary and confidential information,
including trade secrets, belonging to Gaussian, Inc.

This software is provided under written license and may be
used, copied, transmitted, or stored only in accord with that
written license.

The following legend is applicable only to US Government
contracts under FAR:

                  RESTRICTED RIGHTS LEGEND

Use, reproduction and disclosure by the US Government is
subject to restrictions as set forth in subparagraphs (a)
and (c) of the Commercial Computer Software - Restricted
Rights clause in FAR 52.227-19.

Gaussian, Inc.
340 Quinnipiac St., Bldg. 40, Wallingford CT 06492

---------------------------------------------------------------
Warning -- This program may not be used in any manner that
competes with the business of Gaussian, Inc. or will provide
assistance to any competitor of Gaussian, Inc.  The licensee
of this program is prohibited from giving any competitor of
Gaussian, Inc. access to this program.  By using this program,
the user acknowledges that Gaussian, Inc. is engaged in the
business of creating and licensing software in the field of
computational chemistry and represents and warrants to the
licensee that it is not a competitor of Gaussian, Inc. and that
it will not use this program in any manner prohibited above.
---------------------------------------------------------------

Cite this work as:
Gaussian 09, Revision A.02,
M. J. Frisch, G. W. Trucks, H. B. Schlegel, G. E. Scuseria,
M. A. Robb, J. R. Cheeseman, G. Scalmani, V. Barone, B. Mennucci,
G. A. Petersson, H. Nakatsuji, M. Caricato, X. Li, H. P. Hratchian,
A. F. Izmaylov, J. Bloino, G. Zheng, J. L. Sonnenberg, M. Hada,
M. Ehara, K. Toyota, R. Fukuda, J. Hasegawa, M. Ishida, T. Nakajima,
Y. Honda, O. Kitao, H. Nakai, T. Vreven, J. A. Montgomery, Jr.,
J. E. Peralta, F. Ogliaro, M. Bearpark, J. J. Heyd, E. Brothers,
K. N. Kudin, V. N. Staroverov, R. Kobayashi, J. Normand,
K. Raghavachari, A. Rendell, J. C. Burant, S. S. Iyengar, J. Tomasi,
M. Cossi, N. Rega, J. M. Millam, M. Klene, J. E. Knox, J. B. Cross,
V. Bakken, C. Adamo, J. Jaramillo, R. Gomperts, R. E. Stratmann,
O. Yazyev, A. J. Austin, R. Cammi, C. Pomelli, J. W. Ochterski,
R. L. Martin, K. Morokuma, V. G. Zakrzewski, G. A. Voth,
P. Salvador, J. J. Dannenberg, S. Dapprich, A. D. Daniels,
O. Farkas, J. B. Foresman, J. V. Ortiz, J. Cioslowski,
and D. J. Fox, Gaussian, Inc., Wallingford CT, 2009.

******************************************
Gaussian 09:  IA32W-G09RevA.02 11-Jun-2009
            17-May-2006
******************************************
%nprocshared=4
Will use up to 4 processors via shared memory.
%chk=cinnamosim-opt.chk
%mem=1024MW
----------------------------------------------------------------------
# opt freq b3lyp/6-31g(d) scrf=(cpcm,solvent=methanol) geom=connectivi
ty
----------------------------------------------------------------------
1/14=-1,18=20,19=15,26=3,38=1,57=2/1,3;
2/9=110,12=2,17=6,18=5,40=1/2;
3/5=1,6=6,7=1,11=2,16=1,25=1,30=1,70=2101,71=1,72=3,74=-5/1,2,3;
4//1;
5/5=2,38=5,53=3/2;
6/7=2,8=2,9=2,10=2,28=1/1;
7//1,2,3,16;
1/14=-1,18=20,19=15/3(2);
2/9=110/2;
99//99;
2/9=110/2;
3/5=1,6=6,7=1,11=2,16=1,25=1,30=1,70=2105,71=1,72=3,74=-5/1,2,3;
4/5=5,16=3/1;
5/5=2,38=5,53=3/2;
7//1,2,3,16;
1/14=-1,18=20,19=15/3(-5);
2/9=110/2;
6/7=2,8=2,9=2,10=2,19=2,28=1/1;
99/9=1/99;

sobereva · 发表于 Post on 2019-5-17 22:34:29

kibZHF 发表于 2019-5-17 21:22
在用gaussian 09 计算时出错，提示信息有两个，l101.exe已停止工作和 severe error message # 2070
The p ...

%mem给得太大
仔细看此文了解基本的使用注意事项
Gaussian的安装方法及运行时的相关问题
http://sobereva.com/439（http://bbs.keinsci.com/thread-10814-1-1.html）

kibZHF · 发表于 Post on 2019-5-17 22:54:49

感谢！！！确实是这个，我调成%mem=80MW之后可以正常运行。不过运行了1个小时还没算完，电脑4核4GB内存，不知道最好设置成多大

sobereva · 发表于 Post on 2019-5-18 00:21:24

kibZHF 发表于 2019-5-17 22:54
感谢！！！确实是这个，我调成%mem=80MW之后可以正常运行。不过运行了1个小时还没算完，电脑4核4GB内存，不 ...

文中已经说了，win32bit版Gaussian对可用内存限制级大。仔细看文章

bria6677 · 发表于 Post on 2019-5-18 19:54:31

老师好，计算TDDFT出来的振子强度为0.0000指的就是零，还是后面还有值只是被舍去，如果还有值有指令可以让它多输出几位吗?

白雪少年 · 发表于 Post on 2019-5-18 20:49:58

sobereva 发表于 2019-5-17 01:04
激发态和基态计算用的泛函、基组可以不同

处理能量的方式相同

好的，谢谢sob老师

sobereva · 发表于 Post on 2019-5-19 00:28:55

bria6677 发表于 2019-5-18 19:54
老师好，计算TDDFT出来的振子强度为0.0000指的就是零，还是后面还有值只是被舍去，如果还有值有指令可以 ...

都有可能
输出更多的也没实际意义，毕竟已经非常小了
非要获得更后面的数值，你可以用Multiwfn计算跃迁偶极矩，此时输出的位数更多，如果还是为0，就可以认为是精确为0了

dingniu2 · 发表于 Post on 2019-5-19 06:54:28

请问老师IRC过程续算restart问题（1）续算输入文件需要在电荷/自旋多重度下面写坐标吗？（2）如果不需要写坐标，那么命令行为IRC(restart,maxpoint=15) b3lyp/genecp，坐标后的赝势基组在什么位置写？谢谢老师！

梵墨 · 发表于 Post on 2019-5-19 13:55:11

请教一个有关优化问题：
用的Gaussian 09 E01 版本
优化原子包括C H O N P Ce 一共122个原子
计算级别 BP86 def2svp 并按照sob老师博文自定义了部分基组计算8个小时一个点还没有出来
第一次计算有镧系元素的体系，这种情况正常么？

梵墨 · 发表于 Post on 2019-5-19 14:22:39

补充：加了D3色散校正

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