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楼主 Author: sobereva
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[综合交流] 简单量子化学问题答疑专帖(旧版,已关帖)

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发表于 Post on 2019-5-28 20:17:00 | 只看该作者 Only view this author
嗯嗯,多谢卢老师指点,~~

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-5-29 05:43:35 | 只看该作者 Only view this author
delbert 发表于 2019-5-28 19:29
请问用高斯软件算了结果要发表,用的盗版软件,文章里面能写吗》

不能
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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发表于 Post on 2019-5-29 08:53:40 | 只看该作者 Only view this author
delbert 发表于 2019-5-28 19:29
请问用高斯软件算了结果要发表,用的盗版软件,文章里面能写吗》

这个发文章被高斯发现就完蛋了...

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9034#
发表于 Post on 2019-5-29 09:01:40 | 只看该作者 Only view this author
delbert 发表于 2019-5-28 19:29
请问用高斯软件算了结果要发表,用的盗版软件,文章里面能写吗》

用orca重新算一遍,就可以发了

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发表于 Post on 2019-5-29 15:36:35 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2019-5-28 18:36
仔细看
详谈使用Gaussian做势能面扫描
http://sobereva.com/474(http://bbs.keinsci.com/thread-12660 ...

社长,按照您说的,我把角度和扫描角度都写成小数,刚性扫描也是成功的,但是转动的却只是两个碳原子,不是整个基团,输入和输出文件上传至附件了,想麻烦您给看看,谢谢社长!

tpa-ppi-oh-scan.gjf

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tpa-ppi-oh-scan.log

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发表于 Post on 2019-5-29 17:22:32 | 只看该作者 Only view this author
卢老师 请问一下:
Gauss量化.out文件中有几个小问题:
1. Gauss程序计算时,标定的IOP顺序就是程序调用模块运行的顺序么?
2. 体系的对称性是不是通过距离矩阵Distance matrix  判断的?
3. 高斯在计算前会进行基函数线性组合来满足体系对称型基函数构造,后面就使用这个有对称性的基函数进行自洽场计算么?
4. The electronic state is 1-A',  这个 1-A'是 指 最高占据的那个轨道对称性,还是所有占据轨道对称性直积,还是所有轨道对称性直积 ?
5. 有时计算结果的第一个空轨道的能量就是正数值,不是说正数值代表不准确么,这对于算激发态或者能隙来讲,空轨道是正能量可以参与计算么?

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-5-30 08:56:05 | 只看该作者 Only view this author
zhangwei2713 发表于 2019-5-29 15:36
社长,按照您说的,我把角度和扫描角度都写成小数,刚性扫描也是成功的,但是转动的却只是两个碳原子,不 ...

仔细把帖子看了
我给出链接的目的就是让你看的,不是摆设
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-5-30 08:57:46 | 只看该作者 Only view this author
Scienceme 发表于 2019-5-29 17:22
卢老师 请问一下:
Gauss量化.out文件中有几个小问题:
1. Gauss程序计算时,标定的IOP顺序就是程序调用模 ...

不要简写Gauss
1 看
Gaussian的Link、IOp与非标准计算路径
http://sobereva.com/57

2 不是

3 线性组合基函数只是输出文件里有,实际计算不用

4 占据轨道的直积

5 可正可负
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发表于 Post on 2019-5-30 09:17:05 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2019-5-30 08:57
不要简写Gauss
1 看
Gaussian的Link、IOp与非标准计算路径

嗯嗯,多谢卢老师指点~

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发表于 Post on 2019-5-30 17:04:12 | 只看该作者 Only view this author
sob老师,看了一篇涉及系间窜越几率计算的文章,有个问题,如图,利用Landau-Zener模型计算得到A,B的值,此文献上A=0.0316 B=0.0611,为什么就能说交叉点附近的ISC可能性高,是不是有一个大家默认的A,B值(这个值大概为多少呢),就能认为容易发生系间窜越,谢谢sob老师

1559206490(1).jpg (189.91 KB, 下载次数 Times of downloads: 42)

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发表于 Post on 2019-5-30 18:44:36 | 只看该作者 Only view this author
【1002无报错退出问题】
老师们好!我在用一台电脑进行Gaussian计算的时候,有的时候会出现没有报错但是停止计算的情况(在其他电脑上可以正常结束),打开 .log 文件之后如下图所示,而且在有问题的电脑上有的文件可以正常算完,感到很奇怪,之前考虑过是不是程序问题重装之后仍旧存在,希望老师指教!

1002error.png (65.67 KB, 下载次数 Times of downloads: 16)

1002error.png

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-5-31 07:07:55 | 只看该作者 Only view this author
teao 发表于 2019-5-30 18:44
【1002无报错退出问题】
老师们好!我在用一台电脑进行Gaussian计算的时候,有的时候会出现没有报错但是停 ...

程序bug或者程序和当前软件硬环境兼容性问题
换个版本,或者拿其它机子跑

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-5-31 07:08:29 | 只看该作者 Only view this author
yangjianfeng 发表于 2019-5-30 17:04
sob老师,看了一篇涉及系间窜越几率计算的文章,有个问题,如图,利用Landau-Zener模型计算得到A,B的值,此 ...

我不了解
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发表于 Post on 2019-5-31 20:33:46 | 只看该作者 Only view this author
Sob老师您好,我有一个小问题。这一步过程的能垒是14.1kcal还是6.7kcal呢?

Q]U590N[@IQHK0}R[@1(E(W.png (9.86 KB, 下载次数 Times of downloads: 13)

Q]U590N[@IQHK0}R[@1(E(W.png

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-6-1 08:58:52 | 只看该作者 Only view this author
sirical 发表于 2019-5-31 20:33
Sob老师您好,我有一个小问题。这一步过程的能垒是14.1kcal还是6.7kcal呢?

对于基元过程有俩能垒
如果说整体,14.1
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