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楼主 Author: sobereva
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[综合交流] 简单量子化学问题答疑专帖(旧版,已关帖)

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发表于 Post on 2019-7-13 09:34:17 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2019-7-13 05:24
没有这种冻结方法。顶多是把其它原子用背景电荷(或其它方式如片段有效势)表示使之不参与激发

明白了, 谢谢!

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发表于 Post on 2019-7-13 11:10:04 | 只看该作者 Only view this author
老师,您好!请问:
为什么结构优化完成后,.out文件分子中某一对原子之间没有键,而在.chk文件中这对原子之间却有单键相连呢?

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发表于 Post on 2019-7-13 11:16:12 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2019-7-13 05:14
显然用m062x。没事别加弥散
仔细看
简谈量子化学计算中DFT泛函的选择

sob老师,过渡态计算的初猜结构这样我需要加弥散吗?加的话只给重原子加还是重原子和H都加。真的搞不懂!谢谢老师!

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过渡态初猜结构

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发表于 Post on 2019-7-13 11:25:03 | 只看该作者 Only view this author
老师,您好!请问:
如何从安装包中看出是不是G09W D.01 Linux版本的安装包呢?

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发表于 Post on 2019-7-13 15:47:36 | 只看该作者 Only view this author
sob老师 我在看一篇关于RuO+/CH4体系的文献,对文章计算势能面选择的基组有点疑惑,文章使用的基组如下图,其在优化结构时使用了赝势基组(对Ru)def2-tzvp(考虑相对论效应),但用CCSD(T,ful)进一步计算能量时却用的是全电子基组cc-pVTZ-DK,不考虑相对论效应,请问csob老师,这篇文章这样选是否有问题  我按照老师中级班中的教材选用的方法和基组(CCSD(T)/cc-pVTZ-PP//B3LYP/def2tzvp)得到的势能面与图中差异较大。谢谢老师

1563002957(1).jpg (334.13 KB, 下载次数 Times of downloads: 47)

1563002957(1).jpg

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-7-14 01:24:58 | 只看该作者 Only view this author
yangjianfeng 发表于 2019-7-13 15:47
sob老师 我在看一篇关于RuO+/CH4体系的文献,对文章计算势能面选择的基组有点疑惑,文章使用的基组如下图, ...

用cc-pVTZ-DK的时候如果不用相对论哈密顿,结果根本没法接受。如果文中对于相对论哈密顿根本只字未提,作者一定在理论知识上水平较低,因此才犯这样的低级错误(估计是想用全电子基组,但是又不懂什么叫全电子相对论计算)。
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-7-14 01:26:47 | 只看该作者 Only view this author
CayJ 发表于 2019-7-13 11:25
老师,您好!请问:
如何从安装包中看出是不是G09W D.01 Linux版本的安装包呢?

你的问题莫名其妙。W指的是Windows版,不可能是Linux版
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-7-14 01:27:28 | 只看该作者 Only view this author
zxxzyxy 发表于 2019-7-13 11:16
sob老师,过渡态计算的初猜结构这样我需要加弥散吗?加的话只给重原子加还是重原子和H都加。真的搞不懂! ...

不需要,有3-zeta档次的基组就够了

这里写得很明确
谈谈弥散函数和“月份”基组
http://sobereva.com/119
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-7-14 01:27:55 | 只看该作者 Only view this author
CayJ 发表于 2019-7-13 11:10
老师,您好!请问:
为什么结构优化完成后,.out文件分子中某一对原子之间没有键,而在.chk文件中这对原子 ...

gview判断规则的事。不要关心这个。仔细看
谈谈原子间是否成键的判断问题
http://sobereva.com/414http://bbs.keinsci.com/thread-9840-1-1.html
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发表于 Post on 2019-7-14 09:54:03 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2019-7-14 01:24
用cc-pVTZ-DK的时候如果不用相对论哈密顿,结果根本没法接受。如果文中对于相对论哈密顿根本只字未提,作 ...

sob老师  刚又仔细看了下这文章,黄色处算不算提了相对论哈密顿,其它地方没有相关的描述了

1563069101(1).png (98.27 KB, 下载次数 Times of downloads: 38)

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发表于 Post on 2019-7-14 23:57:36 | 只看该作者 Only view this author
sob老师您好!请教一下def2-TZVPP和def2-TZVP的区别是什么?

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-7-15 00:56:44 | 只看该作者 Only view this author
498746012 发表于 2019-7-14 23:57
sob老师您好!请教一下def2-TZVPP和def2-TZVP的区别是什么?

对氢以及某些元素(特别是过渡金属),前者极化函数更多
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-7-15 00:58:07 | 只看该作者 Only view this author
yangjianfeng 发表于 2019-7-14 09:54
sob老师  刚又仔细看了下这文章,黄色处算不算提了相对论哈密顿,其它地方没有相关的描述了

这里没说清楚。感觉作者对相对论计算了解甚少,否则描述起来不会这么不专业,很可能作者以为用个全电子基组而且还是带-DK的就是相对论计算了。
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发表于 Post on 2019-7-15 09:38:26 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 dali 于 2019-7-15 12:30 编辑

Sob老师,请问计算多个氢气分子在一个材料上的吸附作用时,当这个材料吸附了四个氢气分子,其中一个氢气的吸附距离和其它的相比略远,如何得知该氢气分子与材料的吸附强度?

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发表于 Post on 2019-7-15 10:28:48 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2019-7-15 00:56
对氢以及某些元素(特别是过渡金属),前者极化函数更多

谢谢sob老师

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