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楼主 Author: sobereva
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[综合交流] 简单量子化学问题答疑专帖(旧版,已关帖)

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发表于 Post on 2019-12-13 18:33:29 | 只看该作者 Only view this author
怎么可能连在N上

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-12-13 19:23:41 | 只看该作者 Only view this author
landovie 发表于 2019-12-13 18:07
小白想问下,在Gview里画NH4Cl的结构时,是将氯原子直接连接到氮原子上,还是分别画出铵根和氯原子来呢。。 ...

过于初级的问题不要单独发帖,给你合并了

显然是后者

是否连键根本不影响量化计算,看
谈谈原子间是否成键的判断问题
http://sobereva.com/414http://bbs.keinsci.com/thread-9840-1-1.html
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-12-13 19:25:20 | 只看该作者 Only view this author
lc49452695 发表于 2019-12-13 09:56
请问一下计算结合能时,两个分子优化时的基组和自旋必须完全相同吗?

基组只要和整体一致便可
“自旋必须完全相同”语义不确切
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-12-13 19:26:01 | 只看该作者 Only view this author
zj123_45 发表于 2019-12-11 15:45
老师,我在用multiwfn计算激子耦合时,从优化好的二聚体中得到了单体坐标,在计算激发时出错是我的输入文件 ...

解决SCF不收敛问题的方法
http://sobereva.com/61

自己用文本编辑器编辑
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-12-13 19:27:52 | 只看该作者 Only view this author
ssfm 发表于 2019-12-10 20:55
社长请问此博文(http://sobereva.com/443)内的脚本可以在linux版的Multiwfn中调用吗?如果可以该如何操作 ...

看最新版Multiwfn手册4.A.13节的第9部分

PS:本帖只回复量化问题,Multiwfn相关问题请在本论坛的波函数分析与Multiwfn专版的简单问题答疑专贴里咨询,看本帖1L
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-12-13 19:29:08 | 只看该作者 Only view this author
tongjh 发表于 2019-12-12 20:19
老师您好,您关于分子内氢键计算的博文(http://sobereva.com/522)中提到的第一种基于AIM理论的方法对于使 ...

不适用
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-12-13 19:29:25 | 只看该作者 Only view this author
函数与激情 发表于 2019-12-12 19:41
Sob老师您好,请问我用B3LYP/def2svp方法优化一个含Au原子的体系,那么对于Au原子使用的是def2svp的默认赝 ...


Stuttgart小核赝势
看此文
谈谈赝势基组的选用
http://sobereva.com/373http://bbs.keinsci.com/thread-5625-1-1.html
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-12-13 19:31:34 | 只看该作者 Only view this author
IU1015 发表于 2019-12-12 19:22
老师好,我用高斯优化了约有300-500左右原子(只含有C,H,N,O)的大分子,因为有几种不同的构型,所以想 ...

基组连极化函数都没有,完全不能接受
优化用PM7或PM6带色散校正的版本,或者xtb程序做GFN-xTB。之后算能量用ORCA跑B97-3c

相关信息看
将Gaussian与Grimme的xtb程序联用搜索过渡态、产生IRC、做振动分析
http://sobereva.com/421http://bbs.keinsci.com/thread-10106-1-1.html
大体系弱相互作用计算的解决之道
http://sobereva.com/214
详谈Multiwfn产生ORCA量子化学程序的输入文件的功能
http://sobereva.com/490http://bbs.keinsci.com/thread-13560-1-1.html
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-12-13 19:32:42 | 只看该作者 Only view this author
Finesnow 发表于 2019-12-11 13:15
老师,请问用qst2方法找过渡态正常结束了,想保存最末结构并进行频率计算以及IRC验证一下准确性,但是在保 ...

直接保存gjf文件,即便gview有报错提示也不用管,之后gjf里的关键词改成恰当的即可
如果gview连gjf都不能保存出来,自行从QST2输出文件末尾提取最终的结构手动写成gjf文件格式
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-12-13 19:33:18 | 只看该作者 Only view this author
lufenghxu 发表于 2019-12-11 09:00
老师,多齿配体形成的配位键(例如η3,4.。。。。)有明显的成键特征吗?但是他是一个金属原子核多个碳原 ...


做键级分析,直接就能体现,看
Multiwfn支持的分析化学键的方法一览
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-12-13 19:34:40 | 只看该作者 Only view this author
Rainy723 发表于 2019-12-10 00:29
Sob老师,您好!我是做高分子材料方向的,对计算领域完全是小白,但是课题有这方面的问题需求。想请问一下 ...

微观的话,可以截取树脂的一段模型,用量化程序计算反应过程的机理、热力学量变化、电子结构变化等
考虑动态过程的话,可以用ReaxFF力场跑反应动力学
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-12-13 19:36:33 | 只看该作者 Only view this author
Finale 发表于 2019-12-10 16:36
请问如何使用 gamess 中 $MOFRZ 中的 IFRZ 关键词?
我查看了手册:“an array of MOs in the input $VEC  ...

我没试过此功能。写成IFRZ(1)=11,13,17,18,19 试试
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发表于 Post on 2019-12-13 20:57:09 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2019-12-13 19:23
过于初级的问题不要单独发帖,给你合并了

显然是后者

那么老师,
1.在Gview里分别画出铵根和一个氯原子后,它们之间的距离是不是没有要求,因为是可以进行Opt的?
2.可不可以画出一个NH3和一个HCl,然后进行计算

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-12-13 21:17:27 | 只看该作者 Only view this author
YanLiu 发表于 2019-12-12 10:13
社长好,在计算一个三重态自由基转移氢原子形成丙烯(自由基如图)的时候,在设置了三重态以后,这样的计算 ...

自旋多重度>1的情况本来默认就是U
需要
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发表于 Post on 2019-12-14 14:55:58 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2019-12-13 19:31
基组连极化函数都没有,完全不能接受
优化用PM7或PM6带色散校正的版本,或者xtb程序做GFN-xTB。之后算能 ...

非常感谢老师。老师,我可以用我之前优化好的结构再用PM6或PM6带色散校正的版本继续优化吗,这样会减少优化的时间吗?还是用原始构型进行优化比较合理呢?谢谢老师的耐心解答

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