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楼主 Author: sobereva
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[综合交流] 简单量子化学问题答疑专帖(旧版,已关帖)

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发表于 Post on 2019-12-17 00:11:09 | 只看该作者 Only view this author
老师您好,咨询一下对于Zn—O—H (H2O)体系的频率计算,除却B3LYP-D3 (BJ)之外,还有比较准确的泛函(低于双杂化泛函水平。)可用吗?您在博文中推荐了M06-L(加D3的话和M06-2X一样都应该是零阻尼吗?),但为什么这个meta-GGA泛函的计算结果会比杂化泛函还要好呢?谢谢!

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-12-17 00:46:06 | 只看该作者 Only view this author
wth1219 发表于 2019-12-17 00:11
老师您好,咨询一下对于Zn—O—H (H2O)体系的频率计算,除却B3LYP-D3 (BJ)之外,还有比较准确的泛函(低于 ...

现在对于算过渡金属我并不怎么推荐M06L,在这里我都给去掉了:
简谈量子化学计算中DFT泛函的选择
http://sobereva.com/272http://bbs.keinsci.com/thread-536-1-1.html

要加D3就是零阻尼

过渡金属体系电子相关整体强于有机体系,此时HF成份偏低的或者纯泛函普遍更好
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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发表于 Post on 2019-12-17 08:20:12 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2019-12-17 00:46
现在对于算过渡金属我并不怎么推荐M06L,在这里我都给去掉了:
简谈量子化学计算中DFT泛函的选择
http: ...

谢谢老师讲解!
另外顺带咨询一下,现在G16支持SCAN泛函了吗?

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发表于 Post on 2019-12-17 15:30:45 | 只看该作者 Only view this author
请问一下各位大神,我用Sob老师那个计算反应速率常数的表格 ,根据配分函数计算反应速率常数,其 中要用频率计算隧道校正系数,我算的是过渡态的,有一个虚频,比如-2230,请问算的时候是带入-2230还是2230 ?谢谢!!

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发表于 Post on 2019-12-17 16:29:12 | 只看该作者 Only view this author

溶剂化自由能怎么计算

需要计算溶剂化自由能,请问溶剂化自由能怎么计算,有什么方法比较好,有公式吗?

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-12-17 17:48:11 | 只看该作者 Only view this author
wzy 发表于 2019-12-17 16:29
需要计算溶剂化自由能,请问溶剂化自由能怎么计算,有什么方法比较好,有公式吗?

谈谈隐式溶剂模型下溶解自由能和体系自由能的计算
http://sobereva.com/327http://bbs.keinsci.com/thread-3345-1-1.html
使用Multiwfn预测晶体密度、蒸发焓、沸点、溶解自由能等性质
http://sobereva.com/337http://bbs.keinsci.com/thread-3571-1-1.html
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-12-17 17:48:26 | 只看该作者 Only view this author
Luffy-D-M 发表于 2019-12-17 15:30
请问一下各位大神,我用Sob老师那个计算反应速率常数的表格 ,根据配分函数计算反应速率常数,其 中要用频 ...

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-12-17 17:50:01 | 只看该作者 Only view this author
wth1219 发表于 2019-12-17 08:20
谢谢老师讲解!
另外顺带咨询一下,现在G16支持SCAN泛函了吗?

不支持
一看手册便知
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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发表于 Post on 2019-12-17 20:56:28 | 只看该作者 Only view this author

谢谢老师!!

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发表于 Post on 2019-12-17 22:34:27 | 只看该作者 Only view this author
老师您好,我想尝试用orca的zindo/s来计算一个很大体系的激发态,但是最后报错说The lambda equations have not converged,然后尝试来算小分子,还是这个错误,不知道是哪里出了问题,是我输入文件写少了哪些吗

tyr.inp

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发表于 Post on 2019-12-18 08:18:02 | 只看该作者 Only view this author
sob老师,我用gaussian计算140T的分子筛,用#p wb97xd/6-311+g(2df,2p) nosymm int=(acc2e=12,ultrafine)算单点,20多天了不收敛,有没有加速收敛的办法?

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发表于 Post on 2019-12-18 08:34:29 | 只看该作者 Only view this author
相同的原子数,但是结构不同,有的结构scf20步就收敛了,有的快60步了 还不收敛。什么原因呢 ?

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发表于 Post on 2019-12-18 17:58:16 | 只看该作者 Only view this author
老师,再问一下:用kisthelp看热力学校正时,不用oniom方法的电子能数据与log文件一致;而用oniom方法的电子能数据与log文件不一致,kisthelp上的PE只有个数au。请问是什么原因?

1576662746.png (37.07 KB, 下载次数 Times of downloads: 17)

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1576662824(1).png (20.26 KB, 下载次数 Times of downloads: 9)

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发表于 Post on 2019-12-18 21:06:56 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 lianghuashou 于 2019-12-18 21:10 编辑

sob老师,我最近读到一篇文献,计算了non-adiabatic coupling vs frequency

想请教sob老师,这个non-adiabatic coupling是不是振动分辨的电子光谱,非常感谢


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发表于 Post on 2019-12-18 21:11:24 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 lastzealot 于 2019-12-18 21:39 编辑

Sob老师,我在stuttgart官网上找到了Pu元素的赝势,但是没有MDF,只有MHF和一系列ECPnMWB,如图所示。那么这是不是说压根就没有这个元素对应的SO赝势?
如果是这样的话,MHF是否可用?或者还有没有其他办法?
我已经用molpro在casscf/caspt2理论水平下计算了pu的络合物基态激发态的电子结构,只剩下SOC部分了。我应该怎么做才能在SOC理论水平下把工作完成?

谢谢老师,望不吝赐教。

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