计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
楼主 Author: sobereva
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[综合交流] 简单量子化学问题答疑专帖(旧版,已关帖)

   关闭 [复制链接 Copy URL]

6万

帖子

99

威望

6万

eV
积分
129295

管理员

公社社长

10741#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-3-30 08:47:01 | 只看该作者 Only view this author
沉醉不知归路 发表于 2020-3-29 14:02
各位老师同学们好,想请教一个问题,用sob老师的表格计算反应速率常数时, △G(过渡态-反应物)是哪行的数 ...

这是量化计算最基本的常识性问题
仔细看此文末尾的例子
谈谈隐式溶剂模型下溶解自由能和体系自由能的计算
http://sobereva.com/327http://bbs.keinsci.com/thread-3345-1-1.html
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

6万

帖子

99

威望

6万

eV
积分
129295

管理员

公社社长

10742#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-3-30 08:49:13 | 只看该作者 Only view this author
sirical 发表于 2020-3-29 23:12
Sob老师你好,在计算结构时遇到了一个问题,我在找过渡态解固定优化时所获得的结构显示是正常结束的,用Gau ...

上传压缩后的输出文件
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

6万

帖子

99

威望

6万

eV
积分
129295

管理员

公社社长

10743#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-3-30 08:50:43 | 只看该作者 Only view this author
白雪少年 发表于 2020-3-28 17:32
用TD-DFT优化物质本身时可以得到波长和振子强度。想问一下老师,用TD-DFT计算A光解为B和C的反应的时候,如 ...

什么叫默认值?这明明是算出来才知道的结果
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

6万

帖子

99

威望

6万

eV
积分
129295

管理员

公社社长

10744#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-3-30 08:57:31 | 只看该作者 Only view this author
lkylky 发表于 2020-3-28 23:31
我的本子配置是Intel(R) Core(TM) i3-2328M CPU @ 2.20GHz 2.20 GHz :8.00 GB (7.85 GB可用)64位操作系统, ...

“带Ag前面的算法不大行”语义不明
把问题交代清楚
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

6万

帖子

99

威望

6万

eV
积分
129295

管理员

公社社长

10745#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-3-30 08:57:53 | 只看该作者 Only view this author
Austim 发表于 2020-3-28 15:36
老师好,计算一个放热反应的IRC,发现IRC曲线上产物比反应物能量高,请问这个合理吗?计算得到的反应焓是正 ...

焓变正常即可
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

6万

帖子

99

威望

6万

eV
积分
129295

管理员

公社社长

10746#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-3-30 08:58:35 | 只看该作者 Only view this author
Q-Chembio-llg 发表于 2020-3-28 10:37
谢谢SOB老师,不过不知道是不是我安装的gview6有问题,每次打开out文件时直接就是图像了,四周也没有看到 ...

仔细看幻灯片和打开文件时的界面,绝对不可能没这个选项,和安装毫无关系
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

6万

帖子

99

威望

6万

eV
积分
129295

管理员

公社社长

10747#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-3-30 09:01:17 | 只看该作者 Only view this author
登登 发表于 2020-3-28 08:54
对不起,重新上传了图片

谢谢老师回复,审稿人的问题全部是“My primary concern with this manuscrip ...

看此文了解相关知识Acc. Chem. Res. , 33, 139 (2000)
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

29

帖子

0

威望

197

eV
积分
226

Level 3 能力者

10748#
发表于 Post on 2020-3-30 09:17:51 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2020-3-30 08:49
上传压缩后的输出文件

已经上传,希望能得到Sob老师的帮助,谢谢Sob老师

TS10-rv.rar

1.07 MB, 下载次数 Times of downloads: 2

156

帖子

0

威望

649

eV
积分
805

Level 4 (黑子)

10749#
发表于 Post on 2020-3-30 16:43:08 | 只看该作者 Only view this author
想请教Sob老师一个简单的问题。GaussView 6.0中怎么标记两个原子之间的距离啊?如果不行的话有没有别的可视化软件有这种功能呢?因为我想标记出来之后截图放到论文里。谢谢老师!

6万

帖子

99

威望

6万

eV
积分
129295

管理员

公社社长

10750#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-3-31 02:45:40 | 只看该作者 Only view this author
Q-Chembio-llg 发表于 2020-3-30 16:43
想请教Sob老师一个简单的问题。GaussView 6.0中怎么标记两个原子之间的距离啊?如果不行的话有没有别的可视 ...

没法标记,只能自己在ppt或者作图软件里标上
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

6万

帖子

99

威望

6万

eV
积分
129295

管理员

公社社长

10751#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-3-31 02:47:30 | 只看该作者 Only view this author
sirical 发表于 2020-3-30 09:17
已经上传,希望能得到Sob老师的帮助,谢谢Sob老师

做了振动分析(加freq)关键词才行
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

3

帖子

0

威望

95

eV
积分
98

Level 2 能力者

10752#
发表于 Post on 2020-3-31 07:09:22 | 只看该作者 Only view this author
请教一下sob老师,最近在算一些离子对化合物,一直不太清楚构建模型的时候,相应阳离子/阴离子的位置应该怎么处理 才能确保得到合理的最低能量结构.

156

帖子

0

威望

649

eV
积分
805

Level 4 (黑子)

10753#
发表于 Post on 2020-3-31 09:42:58 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2020-3-31 02:45
没法标记,只能自己在ppt或者作图软件里标上

好的谢谢sob老师!

1184

帖子

5

威望

2877

eV
积分
4161

Level 6 (一方通行)

10754#
发表于 Post on 2020-3-31 10:12:21 | 只看该作者 Only view this author
sirical 发表于 2020-3-30 09:17
已经上传,希望能得到Sob老师的帮助,谢谢Sob老师

1.IOp(1/8)=N有Opt=MaxStep=N这个关键词,没必要用IOp。另外这个只是改变一开始的步长,后面会自动调整导致设置无效。一般这个关键词都要配合Opt=NoTrustUpdate,不自动更新置信半径,来用的。
2.GFInput做什么...想看基组和赝势定义开个Guess=Only的单点文件不就好了,输出文件多了一堆东西。
3.虽然这种DFT还是小任务无所谓,但是一般来说,14核只给8G内存实在太抠门了。
至于算频率不加freq关键词这种事...

评分 Rate

参与人数
Participants 1
eV +2 收起 理由
Reason
sobereva + 2

查看全部评分 View all ratings

38

帖子

0

威望

547

eV
积分
585

Level 4 (黑子)

10755#
发表于 Post on 2020-3-31 13:23:52 | 只看该作者 Only view this author
请问要计算气体吸附在固体表面的反应路径,类似于反应 A+B——C,第一步该如何计算,是搜索过渡态还是进行结构优化?以及,反应物有两个,自旋多重度该如何设置?

本版积分规则 Credits rule

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2026-8-31 05:33 , Processed in 0.269032 second(s), 25 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list