计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
楼主 Author: sobereva
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[综合交流] 简单量子化学问题答疑专帖(旧版,已关帖)

   关闭 [复制链接 Copy URL]

164

帖子

0

威望

1991

eV
积分
2155

Level 5 (御坂)

11536#
发表于 Post on 2020-8-11 19:28:42 | 只看该作者 Only view this author
论坛上有人讨论过,先搜索

6万

帖子

99

威望

6万

eV
积分
125151

管理员

公社社长

11537#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-8-12 07:34:37 | 只看该作者 Only view this author
CXDALE 发表于 2020-8-11 19:02
请教各位老师,如何计算开环过程中的键解离能?我现在想计算图中C7-O1键断裂的BDE,该如何操作?谢谢!

提问前先用论坛首页google框搜索,诸如“开环 解离能”,一搜就能找到相关帖子比如http://bbs.keinsci.com/thread-18738-1-1.html
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

6万

帖子

99

威望

6万

eV
积分
125151

管理员

公社社长

11538#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-8-12 07:35:38 | 只看该作者 Only view this author
蒋小乐 发表于 2020-8-11 18:47
老师,你好,我用molclus做氧化铝的团簇,在优化两个氧化铝分子形成的团簇时,运行isomer.exe后,得到的其 ...

没有叫做isomer.exe的程序
说明考虑的初猜数目太少,该得到的没得到,也可能genmer的设置不当,诸如用的是范德华半径而不是共价半径,导致初始结构AlO彼此离得太远
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

22

帖子

0

威望

225

eV
积分
247

Level 3 能力者

11539#
发表于 Post on 2020-8-12 09:15:30 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2020-8-12 07:35
没有叫做isomer.exe的程序
说明考虑的初猜数目太少,该得到的没得到,也可能genmer的设置不当,诸如用的 ...

好的谢谢老师,是isostat.exe,我写错了;我根据您的建议再试试。

16

帖子

0

威望

65

eV
积分
81

Level 2 能力者

11540#
发表于 Post on 2020-8-13 10:43:43 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2020-8-12 07:34
提问前先用论坛首页google框搜索,诸如“开环 解离能”,一搜就能找到相关帖子比如http://bbs.keinsci.co ...

好的,谢谢老师,下次注意

16

帖子

0

威望

65

eV
积分
81

Level 2 能力者

11541#
发表于 Post on 2020-8-13 10:44:14 | 只看该作者 Only view this author
thanhtam 发表于 2020-8-11 19:28
论坛上有人讨论过,先搜索

好的 谢谢

75

帖子

0

威望

632

eV
积分
707

Level 4 (黑子)

11542#
发表于 Post on 2020-8-13 15:17:55 | 只看该作者 Only view this author
老师好!用B3LYP/6-31G*做“opt freq scale=ZPE校正因子”计算得到ZPE,这个ZPE从哪读取?

17

帖子

0

威望

617

eV
积分
634

Level 4 (黑子)

11543#
发表于 Post on 2020-8-14 08:25:41 | 只看该作者 Only view this author
请问老师,用二氧化钛分子去吸附污染物的时候,这时候用b3lyp还是M062X优化更合适,是根据污染物还是吸附剂来确定优化方法的呢?谢谢老师

1665

帖子

5

威望

4788

eV
积分
6553

Level 6 (一方通行)

喵星人

11544#
发表于 Post on 2020-8-14 09:12:44 | 只看该作者 Only view this author
白雪少年 发表于 2020-8-14 08:25
请问老师,用二氧化钛分子去吸附污染物的时候,这时候用b3lyp还是M062X优化更合适,是根据污染物还是吸附剂 ...

B3LYP,你可以参考这个文献
Chem. Eur. J. 2020, 26, 2666
跟你做的东西差不多,用Gaussian算的,M062X不应该用于过渡金属参与的反应

评分 Rate

参与人数
Participants 1
eV +2 收起 理由
Reason
白雪少年 + 2 谢谢

查看全部评分 View all ratings

6万

帖子

99

威望

6万

eV
积分
125151

管理员

公社社长

11545#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-8-14 09:47:17 | 只看该作者 Only view this author
白雪少年 发表于 2020-8-14 08:25
请问老师,用二氧化钛分子去吸附污染物的时候,这时候用b3lyp还是M062X优化更合适,是根据污染物还是吸附剂 ...

这里说了,含过渡金属的体系一般不要用M06-2X,特别是过渡金属直接参与反应的情况
简谈量子化学计算中DFT泛函的选择
http://sobereva.com/272http://bbs.keinsci.com/thread-536-1-1.html

评分 Rate

参与人数
Participants 1
eV +2 收起 理由
Reason
白雪少年 + 2 赞!

查看全部评分 View all ratings

北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

6万

帖子

99

威望

6万

eV
积分
125151

管理员

公社社长

11546#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-8-14 09:48:05 | 只看该作者 Only view this author
CayJ 发表于 2020-8-13 15:17
老师好!用B3LYP/6-31G*做“opt freq scale=ZPE校正因子”计算得到ZPE,这个ZPE从哪读取?

已经没必要这么做了,用Shermo获得热力学量省事
使用Shermo结合量子化学程序方便地计算分子的各种热力学数据
http://sobereva.com/552http://bbs.keinsci.com/thread-17494-1-1.html

校正因子来源
谈谈谐振频率校正因子
http://sobereva.com/221
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

110

帖子

0

威望

1133

eV
积分
1243

Level 4 (黑子)

11547#
发表于 Post on 2020-8-14 14:44:57 | 只看该作者 Only view this author

【求助】计算出来T1能级为负

请问,做TDDFT计算出来的的T1态能级数值为负是什么情况,如何解释呢?

6万

帖子

99

威望

6万

eV
积分
125151

管理员

公社社长

11548#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-8-14 14:53:27 | 只看该作者 Only view this author
anlancx 发表于 2020-8-14 14:44
请问,做TDDFT计算出来的的T1态能级数值为负是什么情况,如何解释呢?

论坛首页google框搜索 激发能 负值
老生常谈的问题
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

110

帖子

0

威望

1133

eV
积分
1243

Level 4 (黑子)

11549#
发表于 Post on 2020-8-15 16:45:11 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2020-8-14 14:53
论坛首页google框搜索 激发能 负值
老生常谈的问题

老师您好,我看了相关的帖子,知道大致流程是用stable=opt找出真正的基态波函数,然后做激发态计算的时候写guess=read。这里我还有个疑问,就是做激发态计算的时候guess=read,read的是哪个文件呢?是上一步做stable=opt的chk文件吗?

6万

帖子

99

威望

6万

eV
积分
125151

管理员

公社社长

11550#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-8-16 09:41:47 | 只看该作者 Only view this author
anlancx 发表于 2020-8-15 16:45
老师您好,我看了相关的帖子,知道大致流程是用stable=opt找出真正的基态波函数,然后做激发态计算的时候 ...

北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

本版积分规则 Credits rule

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2026-2-23 08:53 , Processed in 0.206538 second(s), 24 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list