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楼主 Author: sobereva
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[综合交流] 简单量子化学问题答疑专帖(旧版,已关帖)

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-8-9 18:25:56 | 只看该作者 Only view this author
终_焉 发表于 2020-8-9 15:52
sob老师,在稀盐酸中,不同质子源(H+、H3O+,HCl)得到的质子化过程ΔG差异非常大(-150、-130、-10 kcal/mol ...

我不知道你具体是怎么算的,算的什么过程,化学表达式是什么。反正至少不能用H+
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
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发表于 Post on 2020-8-9 19:11:17 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2020-8-9 18:24
M06-2X没法用零阻尼,仔细看
DFT-D色散校正的使用
http://sobereva.com/210

好的谢谢社长耐心回答,第一次发帖错误下次改正

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发表于 Post on 2020-8-9 19:56:22 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2020-8-9 18:24
M06-2X没法用零阻尼,仔细看
DFT-D色散校正的使用
http://sobereva.com/210

老师您好,看完您的博文后我用了M062X/defTZVP结合零阻尼校正(可能您刚刚口误,您的博文中写的M062X只能用零阻尼校正不能用BJ阻尼校正)还是一开始就报错,但是我换成了def2TZVP就不报错了,请问您这是什么原因呢??感谢您的耐心回答

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发表于 Post on 2020-8-9 21:22:29 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 终_焉 于 2020-8-10 09:53 编辑
sobereva 发表于 2020-8-9 18:25
我不知道你具体是怎么算的,算的什么过程,化学表达式是什么。反正至少不能用H+

sob老师,算的是下图的过程,质子加成的过程通过柔性扫描确认过不存在过渡态,所以反应的自由能变就用产物的自由能减原料的自由能计算得到。


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发表于 Post on 2020-8-9 22:09:54 | 只看该作者 Only view this author
唯心 发表于 2020-8-9 19:56
老师您好,看完您的博文后我用了M062X/defTZVP结合零阻尼校正(可能您刚刚口误,您的博文中写的M062X只能 ...

高斯中,defTZVP写作TZVP,而def2TZVP一致。

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发表于 Post on 2020-8-9 23:38:29 | 只看该作者 Only view this author

Gaussian L801错误求助:Excessive mixing of frozen core and valence orbitals

基于晶体结构计算td,输入关键内容如下:
#p b3lyp/gen td=(singlets,nstates=20)

分子坐标

O H C N 0
6-31G(d)
****
Pd 0
lanl2dz
****

Pd 0
lanl2dz


出现 Excessive mixing of frozen core and valence orbitals.
Error termination via Lnk1e in /opt/g09/l801.exe

计算的分子体系原子数较多(>500),用td(full)是不使用赝势基组吗?求解惑,或者有什么建议吗?谢谢

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-8-10 04:53:26 | 只看该作者 Only view this author
lp2014 发表于 2020-8-9 23:38
基于晶体结构计算td,输入关键内容如下:
#p b3lyp/gen td=(singlets,nstates=20)

赝势都没读进去,能不报错么
仔细看此文了解怎么正确使用赝势基组
详解Gaussian中混合基组、自定义基组和赝势基组的输入
http://sobereva.com/60
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-8-10 04:54:01 | 只看该作者 Only view this author
终_焉 发表于 2020-8-9 21:22
sob老师,算的是下图的过程,质子加成的过程通过柔性扫描确认过不存在过渡态,所以反应的自由能变就用产 ...

贴图方式不对,仔细看置顶的新社员必读贴了解怎么正确贴图
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唯心 发表于 2020-8-9 19:56
老师您好,看完您的博文后我用了M062X/defTZVP结合零阻尼校正(可能您刚刚口误,您的博文中写的M062X只能 ...

以后提问时候说清楚什么报错,不要说是否报错,别人当然知道你是报错了才问的
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发表于 Post on 2020-8-10 10:43:05 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2020-8-9 04:41
CASSCF计算是基于一套初猜轨道的,不可能把alpha和beta一起都当做初猜轨道。要么把alpha当初猜轨道,要么 ...

谢谢!

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发表于 Post on 2020-8-10 14:32:42 | 只看该作者 Only view this author
用高斯算单重态 三重态 五重态的相同结构铁配合物之间的能量差,得到的结果确实是五重态的铁配合物能量最低,但是各个自旋态之间差将近15-33kcal,这种能量差距如此之大的情况正常吗?

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发表于 Post on 2020-8-10 17:00:00 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 junjiqiangzhe 于 2020-8-10 17:08 编辑

求助一个语法问题,我用molclus调用gaussian 09 D01算单点能,template.gjf内容如下:
#M06-2X/6-311+G(2d,p) em=GD3 scrf=SMD
Template file

0 1
[GEOMETRY]

运行以后总是说语法错误,我查了一下午也没看出来是哪里错了,期间尝试了M06-2X改M062X、依次删掉em=GD3和scrf=SMD等,但是依然是语法错误,请求各位给看看,新手实在搞不定了


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发表于 Post on 2020-8-10 17:07:50 | 只看该作者 Only view this author
junjiqiangzhe 发表于 2020-8-10 17:00
求助一个语法问题,我用molclus调用gaussian算单点能,template.gjf内容如下:
#M06-2X/6-311+G(2d,p) em= ...

#后面要有空格
M062X是对的
不用查一下午,看手册就明白了

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发表于 Post on 2020-8-10 17:10:27 | 只看该作者 Only view this author
thanhtam 发表于 2020-8-10 17:07
#后面要有空格
M062X是对的
不用查一下午,看手册就明白了

谢谢,我尝试了加空格,还是不行

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发表于 Post on 2020-8-10 17:19:56 | 只看该作者 Only view this author
junjiqiangzhe 发表于 2020-8-10 17:10
谢谢,我尝试了加空格,还是不行

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