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楼主 Author: sobereva
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[综合交流] 简单量子化学问题答疑专帖(旧版,已关帖)

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发表于 Post on 2020-10-17 15:06:53 | 只看该作者 Only view this author

多谢老师

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发表于 Post on 2020-10-17 15:39:50 | 只看该作者 Only view this author
sob 老师 请问我在算气态自由能时,如果用热力学组合方法CBS-apno算气相吉布斯自由能之后还需要加上B3LYP/6-311G*做的吉布斯能修正吗?

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发表于 Post on 2020-10-17 15:58:26 | 只看该作者 Only view this author
请问老师  对于构象权重平均的红外光谱  可以做PED分析吗   我看到论坛里的VEDA4程序可以对fch文件做PED分析   但是经过构象权重平均的红外怎么做PED分析呢

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发表于 Post on 2020-10-17 16:18:25 | 只看该作者 Only view this author

使用b3pw91/6-31g(d)进行结构优化合理吗?会不会被审稿人质疑?

使用b3pw91/6-31g(d)进行结构优化合理吗?会不会被审稿人质疑?有一个过渡态使用b3lyp/6-31g(d)实在是找不到了,现在全部换成了b3pw91/6-31g(d),如果审稿人质疑怎么回复比较合适?

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-10-17 17:41:27 | 只看该作者 Only view this author
星斗如盘 发表于 2020-10-17 16:18
使用b3pw91/6-31g(d)进行结构优化合理吗?会不会被审稿人质疑?有一个过渡态使用b3lyp/6-31g(d)实在是找不 ...

B3LYP和B3PW91半斤八两
B3LYP不成功的情况,绝大多数情况B3PW91也不会成功。还不如用明显更好的泛函,诸如对有机体系用M06-2X
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-10-17 17:41:51 | 只看该作者 Only view this author
wangchunchun 发表于 2020-10-17 15:58
请问老师  对于构象权重平均的红外光谱  可以做PED分析吗   我看到论坛里的VEDA4程序可以对fch文件做PED分 ...

你只能对不同构象算的振动模式分别做PED
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-10-17 17:42:29 | 只看该作者 Only view this author
din5g 发表于 2020-10-17 15:39
sob 老师 请问我在算气态自由能时,如果用热力学组合方法CBS-apno算气相吉布斯自由能之后还需要加上B3LYP/6 ...

显然不需要
先弄懂什么叫热力学组合方法
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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发表于 Post on 2020-10-17 18:23:59 | 只看该作者 Only view this author
各位老师好,请教两个问题
1.卢老师的博文《振动分辨的电子光谱的计算》http://sobereva.com/223中提到的S0态优化和振动分析为什么要加NoSymmetry呢?
2.这篇博文提到对于G16某些地方不是最好的方法,主要指的是应该用TD-DFT代替CIS(同时DFT代替HF)么?
谢谢!

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发表于 Post on 2020-10-17 19:25:59 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2020-10-17 09:41
3和5都找。
对于粗糙的研究,3重态过渡态和5重态过渡态取较低的那个就行了;
对于精细的研究,还需要找 ...

谢谢老师

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发表于 Post on 2020-10-17 20:47:35 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2020-10-17 17:41
B3LYP和B3PW91半斤八两
B3LYP不成功的情况,绝大多数情况B3PW91也不会成功。还不如用明显更好的泛函,诸 ...

虽然难以理解,但是b3pw91确实找到了所有的过渡态,所以现在想换成b3pw91,就怕审稿人问为什么不用最常用的b3lyp。。。

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发表于 Post on 2020-10-17 21:08:31 | 只看该作者 Only view this author
sob老师 H2气态在标况下的吉布斯自由能取多少?哪篇文献里有准确数据?

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-10-18 06:49:43 | 只看该作者 Only view this author
din5g 发表于 2020-10-17 21:08
sob老师 H2气态在标况下的吉布斯自由能取多少?哪篇文献里有准确数据?

http://webbook.nist.gov/chemistry/里面查查
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-10-18 06:52:24 | 只看该作者 Only view this author
snljty 发表于 2020-10-17 18:23
各位老师好,请教两个问题
1.卢老师的博文《振动分辨的电子光谱的计算》http://sobereva.com/223中提到的S ...

1 不加估计也可以,具体忘了。反正Gaussian开发者的Vibrationally-resolved electronic spectra in GAUSSIAN 09文档里是加了的,但没说明原因。
2 一方面是泛函,另一方面G16对这部分代码做了极大的修改
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-10-18 06:53:40 | 只看该作者 Only view this author
星斗如盘 发表于 2020-10-17 20:47
虽然难以理解,但是b3pw91确实找到了所有的过渡态,所以现在想换成b3pw91,就怕审稿人问为什么不用最常用 ...

没有具体体系信息我没法判断
没有明显理由证明B3PW91就比B3LYP合理,说不定本来就没有过渡态、B3PW91给的过渡态还是虚假的。这年头比这俩泛函找过渡态可靠性高的泛函有的是诸如M06-2X、wB97XD、MN15等,起码你得拿一个内行接受的可靠度更高的泛函也找过渡态才有说服力。
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发表于 Post on 2020-10-18 07:27:55 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2020-10-18 06:52
1 不加估计也可以,具体忘了。反正Gaussian开发者的Vibrationally-resolved electronic spectra in GAUSS ...

谢谢老师!

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