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楼主 Author: sobereva
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[综合交流] 简单量子化学问题答疑专帖(旧版,已关帖)

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秦都王城守卫教头

11986#
发表于 Post on 2020-11-8 11:37:14 | 只看该作者 Only view this author
自己玩可以,要发文章就去买呗
用心去观察这纷纷扰扰的红尘

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11987#
发表于 Post on 2020-11-8 18:10:21 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2020-11-8 10:10
即使在windows下也不一定需要gv,只要你有其他的方式可以画初始分子结构

好的,谢谢

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11988#
发表于 Post on 2020-11-9 12:59:36 | 只看该作者 Only view this author

建立B18H22的分子模型

本帖最后由 初学gaussian 于 2020-11-9 13:11 编辑

我先是建立了模型,但是保存之后再打开就这样了。然后再次连接键,保存之后还是有的键会消失.我先问问,为什么会出现这样的情况,求大佬告知

6_`F27~9_Y%WO{JMOH6}48G.png (40.26 KB, 下载次数 Times of downloads: 6)

6_`F27~9_Y%WO{JMOH6}48G.png

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11989#
发表于 Post on 2020-11-9 15:44:24 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 mlzhao 于 2020-11-9 15:45 编辑

想请教一下大家和老师,对于属于化学吸附范畴且吸附能都普遍在200到400 kJ/mol的强相互作用的碳体系来说,都可以用什么分析方法来体现或者验证这种强度的吸附性能。

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11990#
发表于 Post on 2020-11-9 16:13:51 | 只看该作者 Only view this author
mlzhao 发表于 2020-11-9 15:44
想请教一下大家和老师,对于属于化学吸附范畴且吸附能都普遍在200到400 kJ/mol的强相互作用的碳体系来说, ...

你指的是验证是否能吸附,还是计算吸附能具体是多少,还是分析这种吸附作用的化学本质(键级,键的离子性等等)?
Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员
Google Scholar: https://scholar.google.com/citations?user=XW6C6eQAAAAJ
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主页:http://www.qitcs.qd.sdu.edu.cn/info/1133/1776.htm
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-11-9 19:17:04 | 只看该作者 Only view this author
初学gaussian 发表于 2020-11-9 12:59
我先是建立了模型,但是保存之后再打开就这样了。然后再次连接键,保存之后还是有的键会消失.我先问问,为 ...

贴图方式不对,其他人看不到。重新编辑帖子并仔细看置顶的新社员必读贴了解怎么正确贴图,此问题在这里还特意强调了:http://bbs.keinsci.com/thread-18961-1-1.html

量化相关问题不要发到分子模拟版,这次给你移动了,以后直接删帖
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-11-9 19:23:31 | 只看该作者 Only view this author
mlzhao 发表于 2020-11-9 15:44
想请教一下大家和老师,对于属于化学吸附范畴且吸附能都普遍在200到400 kJ/mol的强相互作用的碳体系来说, ...

吸附能量子化学直接就能很容易地计算

吸附作用的本质可以通过Multiwfn等程序做分析得到
Multiwfn支持的分析化学键的方法一览
http://sobereva.com/471http://bbs.keinsci.com/thread-12488-1-1.html

另外也可以做从头算分子动力学研究吸附的动态过程
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发表于 Post on 2020-11-9 21:44:38 | 只看该作者 Only view this author

多环芳烃的结构优化用什么理论级别比较好?

我有几个体系,每个体系都是含有十几个芳环(有苯环和杂环),有的芳环并联,有的串联,这种刚柔并济的体系,用什么级别优化比较好?不想太费时(最好是一周内能搞定),但也不想弄得太糙

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发表于 Post on 2020-11-9 22:03:57 | 只看该作者 Only view this author
wb97xd def2svp

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-11-10 02:28:19 | 只看该作者 Only view this author
算一算 发表于 2020-11-9 21:44
我有几个体系,每个体系都是含有十几个芳环(有苯环和杂环),有的芳环并联,有的串联,这种刚柔并济的体系 ...

谈谈量子化学研究中什么时候用B3LYP泛函优化几何结构是适当的
http://sobereva.com/557http://bbs.keinsci.com/thread-17899-1-1.html
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发表于 Post on 2020-11-10 08:31:48 | 只看该作者 Only view this author
初学gaussian 发表于 2020-11-9 12:59
我先是建立了模型,但是保存之后再打开就这样了。然后再次连接键,保存之后还是有的键会消失.我先问问,为 ...

首先,你确定只有键连信息变了,原子坐标没变是吗?
这个原子坐标看起来太奇怪了
Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
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ORCID: https://orcid.org/0000-0002-4540-8734
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11997#
发表于 Post on 2020-11-10 17:29:04 | 只看该作者 Only view this author

单点能计算时所用的结构

大家好,本人高斯新手,有两个问题想要请教一下:

1. 如果我在较小基组下对一个大分子完成了几何优化+频率计算,显示无虚频。然后想利用优化好的分子进行大基组下的单点能计算,那么我怎么才能利用上刚才优化好的结构呢。
是利用gview打开优化后的out文件然后另存为gjf文件直接修改基组,还是说要在新的gjf文件中利用guess=read读取优化时的check文件。

2. 如果我想用geom=check或者geom=allcheck或者guess=read等读取chk文件的关键词,那么在gjf文件里第一行是否就是写上所需要读取的chk文件位置,这样是不是就无法在保留原有chk文件的基础上生成新的chk文件了,而必须覆盖掉读取的chk文件。

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11998#
发表于 Post on 2020-11-10 18:19:56 | 只看该作者 Only view this author
1 最后一帧另存为或者geom=allcheck都行
2 %oldchk可以读取旧chk并且不覆盖

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11999#
发表于 Post on 2020-11-10 19:13:48 | 只看该作者 Only view this author
biogon 发表于 2020-11-10 18:19
1 最后一帧另存为或者geom=allcheck都行
2 %oldchk可以读取旧chk并且不覆盖

谢谢

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12000#
发表于 Post on 2020-11-10 20:23:51 | 只看该作者 Only view this author
老师您好,想要对一系列的分子相对准确地计算其HOMO,LUMO能量并作对比,双杂化泛函和CCSD(T)的计算结果会比普通泛函来得准确吗?是不是泛函HF成分对这个计算任务的结果影响还挺大的?

本版积分规则 Credits rule

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