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楼主 Author: sobereva
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[综合交流] 简单量子化学问题答疑专帖(旧版,已关帖)

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发表于 Post on 2021-6-1 22:15:22 | 只看该作者 Only view this author
orca中DLPNO−CCSD(T)//TightPNO/cc-pV(T+Q)Z计算设置,基组如何自定义,没有查到cc-pV(T+Q)Z基组。

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发表于 Post on 2021-6-1 22:49:56 | 只看该作者 Only view this author
第一次用orca计算,想请教老师们一个小问题。只进行了一次计算,产生了十几个文件,想问下,怎么样能只保留out文件和gbw文件,其他的不输出呀?

202106012248421067..png (27.34 KB, 下载次数 Times of downloads: 7)

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发表于 Post on 2021-6-1 22:52:42 | 只看该作者 Only view this author
sxh3231796 发表于 2021-6-1 22:49
第一次用orca计算,想请教老师们一个小问题。只进行了一次计算,产生了十几个文件,想问下,怎么样能只保留 ...

这是没算完或者中途死掉了吧,正常结束的ORCA任务会自动删除.tmp文件的

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发表于 Post on 2021-6-1 22:53:11 | 只看该作者 Only view this author
hzfish 发表于 2021-6-1 15:15
orca中DLPNO−CCSD(T)//TightPNO/cc-pV(T+Q)Z计算设置,基组如何自定义,没有查到cc-pV(T+Q)Z基组。

这个意思应该是分别做cc-pVTZ和cc-pVQZ计算,然后做基组外推。不是用一个叫做cc-pV(T+Q)Z的基组做单个计算。
Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员
Google Scholar: https://scholar.google.com/citations?user=XW6C6eQAAAAJ
ORCID: https://orcid.org/0000-0002-4540-8734
主页:http://www.qitcs.qd.sdu.edu.cn/info/1133/1776.htm
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发表于 Post on 2021-6-1 22:56:40 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 wzkchem5 于 2021-6-1 18:38 编辑
sxh3231796 发表于 2021-6-1 15:49
第一次用orca计算,想请教老师们一个小问题。只进行了一次计算,产生了十几个文件,想问下,怎么样能只保留 ...

这些文件是计算需要的临时文件,所以必须输出。如果任务正常结束,那些tmp文件会被自动删掉,但是还是会保留一些其他的文件,比如opt文件不会被自动删掉。
如果任务已经结束了,但是tmp文件还是没有删掉,你可以手动删掉,并且检查一下计算是不是报错了。如果你希望任务在还没有结束的时候也不要有这些文件,那你只能写一个脚本,把输入文件拷到另一个地方,在那里跑,再只把你需要的输出文件拷回来,剩下的文件删掉。
Zikuan Wang
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发表于 Post on 2021-6-1 23:23:51 | 只看该作者 Only view this author
对于含有单电子的体系,在进行轨道分析的时候,使用alpha轨道来解释呢?还是用beta轨道来解释呢?或者两者都需要权衡?
例如,对于金属簇,alpha轨道分析满足幻术,但是beta轨道不满足,那这个簇是否满足幻术呢?

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发表于 Post on 2021-6-2 00:23:42 | 只看该作者 Only view this author
Scarlett-ww 发表于 2021-6-1 16:23
对于含有单电子的体系,在进行轨道分析的时候,使用alpha轨道来解释呢?还是用beta轨道来解释呢?或者两者 ...

这种情况说明这个金属簇容易得到电子使beta电子满足幻数,但是不容易失去电子。
如果一定需要一个yes/no的答案,说这个簇整体是否满足幻数,不允许“alpha电子满足,beta电子不满足”这种答案,那我就不太清楚了。
Zikuan Wang
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发表于 Post on 2021-6-2 00:58:31 | 只看该作者 Only view this author
RAL 发表于 2021-6-1 22:52
这是没算完或者中途死掉了吧,正常结束的ORCA任务会自动删除.tmp文件的

是的,还没有算完,问得太急了

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发表于 Post on 2021-6-2 00:58:43 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2021-6-1 22:56
这些文件是计算需要的临时文件,所以必须输出。如果任务正常结束,那些tmp文件会被自动删掉,但是还是会 ...

谢谢老师

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-6-2 05:38:32 | 只看该作者 Only view this author
Scarlett-ww 发表于 2021-6-1 23:23
对于含有单电子的体系,在进行轨道分析的时候,使用alpha轨道来解释呢?还是用beta轨道来解释呢?或者两者 ...

看拿轨道具体分析什么
很多情况如果想靠一套轨道分析,可以做UKS计算后再做双正交化,来便于讨论
用于非限制性开壳层波函数的双正交化方法的原理与应用
http://sobereva.com/448http://bbs.keinsci.com/thread-11377-1-1.html
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-6-2 05:39:24 | 只看该作者 Only view this author
hzfish 发表于 2021-6-1 22:15
orca中DLPNO−CCSD(T)//TightPNO/cc-pV(T+Q)Z计算设置,基组如何自定义,没有查到cc-pV(T+Q)Z基组。

ORCA直接就支持利用Dunning基组靠TZ->QZ档次做外推
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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wzkchem5 发表于 2021-6-2 00:23
这种情况说明这个金属簇容易得到电子使beta电子满足幻数,但是不容易失去电子。
如果一定需要一个yes/no ...

好的,谢谢您

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发表于 Post on 2021-6-2 09:29:08 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2021-6-2 05:38
看拿轨道具体分析什么
很多情况如果想靠一套轨道分析,可以做UKS计算后再做双正交化,来便于讨论
用于 ...

谢谢Sob老师,我试试

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发表于 Post on 2021-6-2 11:16:32 | 只看该作者 Only view this author
老师你好,我想计算草酸晶体中分子之间的间距和形成的孔洞大小,可以用gaussian模拟计算吗?有相关的文献可以参照吗?能介绍一些文献吗?

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发表于 Post on 2021-6-3 04:16:01 | 只看该作者 Only view this author
ycl1111 发表于 2021-6-2 11:16
老师你好,我想计算草酸晶体中分子之间的间距和形成的孔洞大小,可以用gaussian模拟计算吗?有相关的文献可 ...

晶体文件直接用Multiwfn就能算

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