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楼主 Author: sobereva
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[综合交流] 简单量子化学问题答疑专帖(旧版,已关帖)

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发表于 Post on 2021-6-6 09:22:44 | 只看该作者 Only view this author
Gaussian中SCF=Fermi和ORCA中%SCF Smear Temp  xxxx END两者功能是一样的吗?xxxx表示温度,单位K。
如果ORCA中%SCF Searm Temp 10000 END,在Gaussian中实现同样的功能该如何设置?
谢谢!

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发表于 Post on 2021-6-6 14:59:33 | 只看该作者 Only view this author
hzfish 发表于 2021-6-6 02:22
Gaussian中SCF=Fermi和ORCA中%SCF Smear Temp  xxxx END两者功能是一样的吗?xxxx表示温度,单位K。
如果O ...

不一样,高斯的SCF=Fermi的温度用户好像不能控制,而且接近收敛时温度会自动设为0。ORCA允许一直保持非零温度直至收敛
Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员
Google Scholar: https://scholar.google.com/citations?user=XW6C6eQAAAAJ
ORCID: https://orcid.org/0000-0002-4540-8734
主页:http://www.qitcs.qd.sdu.edu.cn/info/1133/1776.htm
GitHub:https://github.com/wzkchem5
本团队长期招收研究生,有意者可私信联系

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发表于 Post on 2021-6-6 20:30:14 | 只看该作者 Only view this author

单点能计算问题的咨询

各位大佬大家好,首先祝大家科研和工作顺利,感谢大家百忙之中解答小弟的疑惑。
想请教一下关于单点能计算的问题,目前已完成溶剂A中溶质B的单点能计算,想在现有体系中加入溶质C后计算溶质B单点能,是否可以选择将A+C溶液定义为一种溶剂去计算B的单点能?有没有比较好的方法?有劳教一下在Gaussian和Gauss View中的操作,万分感谢!

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发表于 Post on 2021-6-6 23:59:47 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2021-6-5 09:59
你把二聚体的结构保存成任何Multiwfn可以读取坐标的格式,比如xyz、mol、pdb等等,就可以用Multiwfn产生D ...

sob老师,计算SOC不是需要激发态结构的文件吗,但是从单晶里拉出来的二聚体的结构用Gaussian优化激发态结构吼感觉形变的厉害应该怎么办...

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-6-7 08:38:28 | 只看该作者 Only view this author
wutong233 发表于 2021-6-6 20:30
各位大佬大家好,首先祝大家科研和工作顺利,感谢大家百忙之中解答小弟的疑惑。
想请教一下关于单点能计算 ...

普通学术问题求助帖不得发到“资源分享”板块,给你移动了,下次发错直接删帖+记违规处理
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-6-7 08:38:55 | 只看该作者 Only view this author
落雁 发表于 2021-6-6 23:59
sob老师,计算SOC不是需要激发态结构的文件吗,但是从单晶里拉出来的二聚体的结构用Gaussian优化激发态结 ...

对任何结构都可以计算SOC,看具体问题
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-6-7 08:39:39 | 只看该作者 Only view this author
wutong233 发表于 2021-6-6 20:30
各位大佬大家好,首先祝大家科研和工作顺利,感谢大家百忙之中解答小弟的疑惑。
想请教一下关于单点能计算 ...

看此文里混合溶剂的设置
谈谈隐式溶剂模型下溶解自由能和体系自由能的计算
http://sobereva.com/327http://bbs.keinsci.com/thread-3345-1-1.html
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发表于 Post on 2021-6-7 19:13:03 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2021-6-7 08:39
看此文里混合溶剂的设置
谈谈隐式溶剂模型下溶解自由能和体系自由能的计算
http://sobereva.com/327(h ...

好的,谢谢老师,操作不当给您添麻烦了

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发表于 Post on 2021-6-8 11:41:43 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2021-6-7 08:38
对任何结构都可以计算SOC,看具体问题

好的,谢谢老师

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发表于 Post on 2021-6-8 17:26:43 | 只看该作者 Only view this author
sob老师好,《使用Multiwfn观看分子轨道》一文中提到”选中"Show+Sel.isosur#2"复选框,那么在轨道列表中点击两个轨道,就可以让两条轨道都显示出来。“
我想请问VMD里也能实现这种操作吗?同时展示两条轨道

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-6-15 19:05:27 | 只看该作者 Only view this author
落雁 发表于 2021-6-8 17:26
sob老师好,《使用Multiwfn观看分子轨道》一文中提到”选中"Show+Sel.isosur#2"复选框,那么在轨道列表中点 ...

可以
分别载入两个轨道的cube文件,都设置成等值面绘制方式
也可以让Multiwfn产生一个含有两个轨道的cube文件,设置绘图时,分别选择不同的轨道
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发表于 Post on 2021-6-15 19:56:46 | 只看该作者 Only view this author
sob老师您好,对于计算化学专业的学生,如果要学习一门比较实用的编程语言,您最推荐哪一种呢?

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发表于 Post on 2021-6-16 08:33:30 | 只看该作者 Only view this author
老师你好,我想要研究加入B物质后对A物质在水中解离的抑制效果,不知道能不能用能量分解或者是电离能来分析,或者是还有什么方法能够分析抑制解离

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-6-16 10:15:13 | 只看该作者 Only view this author
498746012 发表于 2021-6-15 19:56
sob老师您好,对于计算化学专业的学生,如果要学习一门比较实用的编程语言,您最推荐哪一种呢?

我个人强烈推荐Fortran。我写的几乎所有计算化学相关的大大小小的程序(http://www.keinsci.com/research/research_program.html)全是用的Fortran

但如果你要写的程序不是计算量很大的程序,学Python也可以
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-6-16 10:16:19 | 只看该作者 Only view this author
reddy 发表于 2021-6-16 08:33
老师你好,我想要研究加入B物质后对A物质在水中解离的抑制效果,不知道能不能用能量分解或者是电离能来分析 ...

电离能和解离是两码事
你的描述太抽象,不给具体信息没法说
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