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楼主 Author: sobereva
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[综合交流] 简单量子化学问题答疑专帖(旧版,已关帖)

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发表于 Post on 2021-6-16 19:43:08 | 只看该作者 Only view this author
sxh3231796 发表于 2021-6-16 12:06
倒数第二行的意思是就是说高斯没法正常调用优化命令的意思吗?因为我的命令行是可以常规调用的高斯软件的 ...

你的高斯输入文件是结构优化的输入文件吗?
倒数第二行说的是这个输入文件不是做结构优化的,不是不能正常用高斯调用。
Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员
Google Scholar: https://scholar.google.com/citations?user=XW6C6eQAAAAJ
ORCID: https://orcid.org/0000-0002-4540-8734
主页:http://www.qitcs.qd.sdu.edu.cn/info/1133/1776.htm
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发表于 Post on 2021-6-16 20:28:04 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2021-6-16 19:43
你的高斯输入文件是结构优化的输入文件吗?
倒数第二行说的是这个输入文件不是做结构优化的,不是不能正 ...

我就是直接用的压缩文件里gentor自动生成的示范文件,在我的电脑上用windows版本的高斯是可以正常进行的,但是在超算上就不行了,就不知道是什么原因

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发表于 Post on 2021-6-16 21:11:21 | 只看该作者 Only view this author
sxh3231796 发表于 2021-6-16 13:28
我就是直接用的压缩文件里gentor自动生成的示范文件,在我的电脑上用windows版本的高斯是可以正常进行的 ...

在这个超算上面直接调用高斯跑你的这个输入文件,可以跑通吗?
Zikuan Wang
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发表于 Post on 2021-6-16 21:31:07 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2021-6-16 21:11
在这个超算上面直接调用高斯跑你的这个输入文件,可以跑通吗?

刚试了一下,是可以的,就不知道还有哪出了问题

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发表于 Post on 2021-6-16 22:43:31 | 只看该作者 Only view this author
sxh3231796 发表于 2021-6-16 14:31
刚试了一下,是可以的,就不知道还有哪出了问题

我发现问题了。。。你看看报错信息的倒数第3行,就知道问题出在哪里了
Zikuan Wang
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-6-17 11:35:12 | 只看该作者 Only view this author

补充一句,现代Fortran(2003及之后版本)在面向对象编程方面做了极大的扩展,诸如CP2K等如今都是用现代Fortran写的,许多对Fortran的传统看法不适合现代Fortran。

如果以后要改行开发应用程序,确实Python、C++会好不少,但对于写科学计算程序本身,Fortran在我来看友好得多,有其它语言无可取代的优势
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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发表于 Post on 2021-6-17 14:43:37 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2021-6-16 14:43
是不是这个分子本来是比较高的对称性(至少有一个三重轴),或者很接近高对称性,被你指定(或者程序自动 ...

谢谢老师

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发表于 Post on 2021-6-17 15:08:30 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2021-6-17 04:35
补充一句,现代Fortran(2003及之后版本)在面向对象编程方面做了极大的扩展,诸如CP2K等如今都是用现代F ...

没错,不过我还是觉得C++仍然比Fortran领先,毕竟Fortran在往前跑的时候,C++也没停止脚步。。。
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发表于 Post on 2021-6-17 16:51:44 | 只看该作者 Only view this author
请问一下大家,Shermo软件可以在win7平台上使用吗?发现会闪退

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发表于 Post on 2021-6-17 16:57:46 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2021-6-16 22:43
我发现问题了。。。你看看报错信息的倒数第3行,就知道问题出在哪里了

老师,一般这种药怎么改呢?我改成g16可以运行,但会变成无法在超算中心运行,我把命令改成下图还是不行,而且多了新的报错。

202106171657418331..png (36.99 KB, 下载次数 Times of downloads: 10)

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发表于 Post on 2021-6-17 17:10:17 | 只看该作者 Only view this author
sxh3231796 发表于 2021-6-17 09:57
老师,一般这种药怎么改呢?我改成g16可以运行,但会变成无法在超算中心运行,我把命令改成下图还是不行 ...

molclus调用高斯的命令是"ta7" < gau.gjf > gau.out
你看看这和你平时调用高斯的命令有什么区别?ta7你是在哪里输入的?
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发表于 Post on 2021-6-17 17:14:05 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2021-6-17 17:10
molclus调用高斯的命令是"ta7" < gau.gjf > gau.out
你看看这和你平时调用高斯的命令有什么区别?ta7你 ...

我一般调用的高斯命令是ta7 ch4 对于.com格式的输入文件.之前就直接在slurm界面里输入就行

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发表于 Post on 2021-6-17 17:48:53 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2021-6-17 11:35
补充一句,现代Fortran(2003及之后版本)在面向对象编程方面做了极大的扩展,诸如CP2K等如今都是用现代F ...

谢谢老师

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发表于 Post on 2021-6-17 17:51:25 | 只看该作者 Only view this author
sxh3231796 发表于 2021-6-17 10:14
我一般调用的高斯命令是ta7 ch4 对于.com格式的输入文件.之前就直接在slurm界面里输入就行

这个ta7是一个脚本?这个脚本调用g16?还是说你把g16可执行文件重命名成了ta7?
Zikuan Wang
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发表于 Post on 2021-6-17 18:41:10 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2021-6-17 17:51
这个ta7是一个脚本?这个脚本调用g16?还是说你把g16可执行文件重命名成了ta7?

是的,就是我发在上面的一个脚本。

202106171841047570..png (14.76 KB, 下载次数 Times of downloads: 5)

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