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楼主 Author: sobereva
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[综合交流] 简单量子化学问题答疑专帖(旧版,已关帖)

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发表于 Post on 2021-10-27 15:51:07 | 只看该作者 Only view this author
Jameslzy 发表于 2021-10-27 08:13
Sob老师好,我在做IRC的时候出现了中间突然有一点掉到下面去,然后两边走的长度也很短。看您的帖子里面说这 ...

不要只看结尾,也得往上看。再者不排除是gaussview和高斯版本不兼容
Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员
Google Scholar: https://scholar.google.com/citations?user=XW6C6eQAAAAJ
ORCID: https://orcid.org/0000-0002-4540-8734
主页:http://www.qitcs.qd.sdu.edu.cn/info/1133/1776.htm
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本团队长期招收研究生,有意者可私信联系

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发表于 Post on 2021-10-27 15:55:27 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2021-10-27 13:03
优化和单点级别都明显不妥
仔细看
简谈量子化学计算中DFT泛函的选择

老师,您好,由于几何优化已经做完,那我的单点能计算在PBE0-D3(BJ)/ma-def2-TZVP级别下进行,可以吗

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发表于 Post on 2021-10-27 16:11:33 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2021-10-27 15:51
不要只看结尾,也得往上看。再者不排除是gaussview和高斯版本不兼容

好的收到,谢谢老师解答,我再仔细查一下

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发表于 Post on 2021-10-27 16:23:31 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2021-10-27 15:49
以下假设你研究的是从S1出发的ISC。如果是从其他态出发的ISC,请自行举一反三
如何知道该画哪些能级:单 ...

谢谢老师

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-10-28 10:52:00 | 只看该作者 Only view this author
化小白 发表于 2021-10-27 15:55
老师,您好,由于几何优化已经做完,那我的单点能计算在PBE0-D3(BJ)/ma-def2-TZVP级别下进行,可以吗

可以
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
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思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
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发表于 Post on 2021-10-28 11:11:16 | 只看该作者 Only view this author
老师你好,我想要计算过渡金属配合物(A)吸附小分子(B)的的吸附能。但是由于过渡金属上同时还存在两个配位水,小分子B跟水之间有相互作用,因此单独对A和AB进行结构优化时配位水的构象有较大差异,这种情况下算出来的吸附能有意义吗?A的能量可以用结构优化后AB的结构扣掉B直接计算单点能来代替吗?感谢老师
既笨又菜,轻喷。
http://doc.liuyaoze.com

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发表于 Post on 2021-10-28 11:13:02 | 只看该作者 Only view this author
老师您好,我刚学GAMESS,请问在GAMESS输出结果中出现
WARNING: EIGENVECTOR ROUTINE -EINVIT- DID NOT CONVERGE FOR VECTOR     9
NORM =  4.18E-03 PERFORMANCE INDEX =  1.20E+01
A HALT WILL OCCUR IF THE PERF.IND. EXCEEDS 100.0
这是代表什么意思

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发表于 Post on 2021-10-28 11:42:04 | 只看该作者 Only view this author

好的,谢谢老师

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-10-28 12:25:48 | 只看该作者 Only view this author
jackffff 发表于 2021-10-28 11:13
老师您好,我刚学GAMESS,请问在GAMESS输出结果中出现
WARNING: EIGENVECTOR ROUTINE -EINVIT- DID NOT C ...

单独发帖,选GAMESS-US分类,输出文件压缩后上传
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-10-28 12:27:48 | 只看该作者 Only view this author
独舞的印迹 发表于 2021-10-28 11:11
老师你好,我想要计算过渡金属配合物(A)吸附小分子(B)的的吸附能。但是由于过渡金属上同时还存在两个配位水 ...


不能

算A的时候用A最稳定的结构算能量
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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发表于 Post on 2021-10-28 19:53:39 | 只看该作者 Only view this author
我的irc正常结束了 查看out文件是这样的
左右各走了20步 但是我用gauss view打开out文件 IRC/path是灰色的 没办法查看
也无法查看每一帧是什么情况
我应该怎么解决 谢谢

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发表于 Post on 2021-10-28 20:13:04 | 只看该作者 Only view this author
新手求助,想做这个催化剂的结构优化,但是试了sob老师在博文里提到的基本方法,都没法收敛.想问一下,是我的初始结构有什么问题吗?要怎么调一下呢?

BAF.com

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发表于 Post on 2021-10-28 20:33:41 | 只看该作者 Only view this author
Gaussian16A 03调用NBO7运行一直不结束,输出文件一直停留在Replace BD/BD* pair(s) in Lewis set by LP/LP using directed NBO search,其他类似体系运行则没问题,应该怎么处理

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发表于 Post on 2021-10-28 21:00:28 | 只看该作者 Only view this author
sxh3231796 发表于 2021-10-28 13:13
新手求助,想做这个催化剂的结构优化,但是试了sob老师在博文里提到的基本方法,都没法收敛.想问一下,是我的初 ...

建议你好好查查BArF4到底是啥,这里的Ar不是氩的意思,而是芳基的意思。
但凡有初中化学知识也知道Ar不可能成6根键,哪怕成两根键、生成ArF2都已经很困难了
Zikuan Wang
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-10-29 06:54:27 | 只看该作者 Only view this author
zzxxcc 发表于 2021-10-28 19:53
我的irc正常结束了 查看out文件是这样的
左右各走了20步 但是我用gauss view打开out文件 IRC/path是灰色的 ...

贴这些图还不如直接上传压缩后的out文件
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