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楼主 Author: sobereva
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[综合交流] 简单量子化学问题答疑专帖

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-10-13 12:47:37 | 只看该作者 Only view this author
wudiazhu 发表于 2023-10-13 11:17
各位老师,我看了sob老师http://sobereva.com/176关于芳香性的介绍,仍有一些不太理解的地方,在这里请教一 ...

此类问题请发到1L提到的波函数分析答疑专贴里
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
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发表于 Post on 2023-10-13 14:26:17 | 只看该作者 Only view this author

[新手求助]多原子分子优化

wB97XD/6-31G*,用该方法机组算过渡金属配合物,113个原子的分子还行,但算139个原子的分子就提示Atomic number out of rang for 6-31G basis set,换了好几个机组都这样,想问下有好的解决方法吗

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发表于 Post on 2023-10-13 14:38:45 | 只看该作者 Only view this author
6-31G*适用于H-Kr范围里的元素
可以去http://www.basissetexchange.org这个网站查看基组的适用范围
Ph.D., Asst. Prof. at UOsaka.
Homepage: wongzit.github.io

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-10-13 15:46:05 | 只看该作者 Only view this author
剑与玫瑰 发表于 2023-10-13 14:26
wB97XD/6-31G*,用该方法机组算过渡金属配合物,113个原子的分子还行,但算139个原子的分子就提示Atomic nu ...

以后发帖时在帖子标题里把问题描述具体,仔细看http://bbs.keinsci.com/thread-9348-1-1.html
不要自己在帖子标题里写[新手求助]

那叫基组

大多数全电子基组只支持前四周期或其中更小的子集
第五周期开始的通常用赝势基组,好好看此文,不要乱试
谈谈赝势基组的选用
http://sobereva.com/373http://bbs.keinsci.com/thread-5625-1-1.html
谈谈学量子化学如何正确地入门
http://sobereva.com/355http://bbs.keinsci.com/thread-4447-1-1.html

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发表于 Post on 2023-10-13 16:06:11 | 只看该作者 Only view this author
wangzhe 发表于 2023-10-13 14:38
6-31G*适用于H-Kr范围里的元素
可以去http://www.basissetexchange.org这个网站查看基组的适用范围

非常感谢

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发表于 Post on 2023-10-13 16:06:41 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2023-10-13 15:46
以后发帖时在帖子标题里把问题描述具体,仔细看http://bbs.keinsci.com/thread-9348-1-1.html
不要自己 ...

谢谢老师解答

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发表于 Post on 2023-10-13 17:09:13 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2023-10-13 12:47
此类问题请发到1L提到的波函数分析答疑专贴里

好的,抱歉老师,已重新发送

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发表于 Post on 2023-10-13 20:39:28 | 只看该作者 Only view this author
卢老师和各位老师好,最近要学习有关NMR的理论计算,请问有没有比较适合初学者学习的书籍或视频推荐
KimariYB, Postgraduate, XiaMen University
School of Electronic Science and Engineering (National Model Microelectronics College)
Research interests: theoretical and computational chemistry and machine learning

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-10-13 20:43:28 | 只看该作者 Only view this author
kimariyb 发表于 2023-10-13 20:39
卢老师和各位老师好,最近要学习有关NMR的理论计算,请问有没有比较适合初学者学习的书籍或视频推荐

北京科音初级量子化学培训班(http://www.keinsci.com/workshop/KEQC_content.html)里面有NMR的背景知识介绍和详细的计算方法,北京科音基础量子化学培训班(http://www.keinsci.com/workshop/KBQC_content.html)里对这个主题讲得深入全面得多
如果是固体的NMR,北京科音CP2K第一性原理计算培训班(http://www.keinsci.com/workshop/KFP_content.html)里有专门的计算讲解。
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
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发表于 Post on 2023-10-15 15:36:02 | 只看该作者 Only view this author
各位老师我想问一下理论计算有没有什么方法来评估自由基的寿命呢?在做自由基活化降解我想评估一下双氧水产生的羟基自由基的寿命

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发表于 Post on 2023-10-15 20:30:38 | 只看该作者 Only view this author
KCM@SHU 发表于 2023-10-15 08:36
各位老师我想问一下理论计算有没有什么方法来评估自由基的寿命呢?在做自由基活化降解我想评估一下双氧水产 ...

列举出这个自由基的所有可能的消耗途径,分别计算速率常数,然后求解动力学方程得到寿命
例:假如这个自由基有两个分解途径,都是单分子分解反应,速率常数分别是1×10^8 s-1和4×10^8 s-1,则平均寿命为1/(1×10^8+4×10^8) s = 2×10^-9 s。如果消耗途径里有二级反应,或者有其他试剂参与的反应,可能需要更加复杂的计算,由基本的动力学知识不难知道怎么算
Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员
Google Scholar: https://scholar.google.com/citations?user=XW6C6eQAAAAJ
ORCID: https://orcid.org/0000-0002-4540-8734
主页:http://www.qitcs.qd.sdu.edu.cn/info/1133/1776.htm
GitHub:https://github.com/wzkchem5
本团队长期招收研究生,有意者可私信联系

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发表于 Post on 2023-10-16 08:56:22 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2023-10-15 20:30
列举出这个自由基的所有可能的消耗途径,分别计算速率常数,然后求解动力学方程得到寿命
例:假如这个自 ...

好的,谢谢老师

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发表于 Post on 2023-10-16 19:16:11 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 498746012 于 2023-10-16 19:19 编辑

老师您好,我从金属内嵌富勒烯的计算文章中把各个团簇转动异构体的结构用givew打开,感觉金属团簇周围有个大球Ih对称性,无法区分这些异构体的差别,眼花缭乱的,该怎么区分这些异构体呀?是不是要把两个结构重叠起来,看哪些发生改变吗?

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发表于 Post on 2023-10-16 21:02:44 | 只看该作者 Only view this author
sobereva老师,能否较为详细地介绍一下ANO(Atomic Natural Orbital)基组?之前看了您写的《谈谈量子化学中基组的选择》,受益匪浅,但是ANO基组介绍的较少。
最近看到介绍molcas的caspt2的ppt(https://molcas.org/VV/CASPT2_theory.pdf),讲到了ANO基组是CASPT2的较好选择,请问为什么呢?ANO基组在CASPT2计算中的优势是什么?能否减少入侵态的问题?一般的几何优化和单点能计算时应该选多大的ANO基组?谢谢!

屏幕截图 2023-10-16 205748.jpg (368.9 KB, 下载次数 Times of downloads: 13)

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发表于 Post on 2023-10-16 23:35:14 | 只看该作者 Only view this author
498746012 发表于 2023-10-16 12:16
老师您好,我从金属内嵌富勒烯的计算文章中把各个团簇转动异构体的结构用givew打开,感觉金属团簇周围有个 ...

对,可以用VMD等软件做结构的align
Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员
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ORCID: https://orcid.org/0000-0002-4540-8734
主页:http://www.qitcs.qd.sdu.edu.cn/info/1133/1776.htm
GitHub:https://github.com/wzkchem5
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