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楼主 Author: sobereva
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[综合交流] 简单量子化学问题答疑专帖

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-10-10 21:55:07 | 只看该作者 Only view this author
吴双 发表于 2023-10-9 10:22
各位老师好,我在用高斯计算氧化还原电势的时候遇到了一些问题,想请各位老师帮我解答一下。催化剂LnCr (Ⅲ ...

分清楚自旋密度和自旋布居
谈谈自旋密度、自旋布居以及在Multiwfn中的绘制和计算
http://sobereva.com/353http://bbs.keinsci.com/thread-4422-1-1.html

实际上是几价用此文的方法判断
使用Multiwfn通过LOBA方法计算氧化态
http://sobereva.com/362http://bbs.keinsci.com/thread-5118-1-1.html

一般单电子不会完全定域在单个原子上,不要用过于经典的视角看待量子化学计算
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-10-11 01:25:02 | 只看该作者 Only view this author
chenan 发表于 2023-10-10 20:14
对一个过渡金属,有共轭结构大分子进行结构优化和频率计算以后,看前沿分子轨道看不了。附件中有图片

别把图片当附件上传
干嘛不直接贴图,还得让别人打开压缩包看图
好好看置顶的社员必读贴搞清楚怎么上传图片
照片别不剪切、压缩,上来就试图上传,白浪费服务器空间。所以论坛才阻止试图上传过大的图片

甭用gview就完了,用Multiwfn看轨道效果好得多速度快得多还完全免费
使用Multiwfn观看分子轨道
http://sobereva.com/269http://bbs.keinsci.com/thread-462-1-1.html
使用Multiwfn+VMD快速绘制高质量分子轨道等值面图(含视频演示)
http://sobereva.com/447http://bbs.keinsci.com/thread-11122-1-1.html
用VMD绘制艺术级轨道等值面图的方法(含演示视频)
http://sobereva.com/449http://bbs.keinsci.com/thread-11550-1-1.html
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发表于 Post on 2023-10-11 08:46:01 | 只看该作者 Only view this author
好的,谢谢老师!

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发表于 Post on 2023-10-11 10:31:14 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 吴双 于 2023-10-11 10:33 编辑
sobereva 发表于 2023-10-10 21:55
分清楚自旋密度和自旋布居
谈谈自旋密度、自旋布居以及在Multiwfn中的绘制和计算
http://sobereva.com/ ...

老师 那根据我的计算结果显示,能认为催化剂1失去一个电子的过程中,所有氧原子失去一个电子的相对于Cr失去电子要相对容易么。还是说要优化催化剂结构Cr是3d2的结构(怎么优化才能保证失去的电子完全在Cr上呢?),能量对比一下呢。

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-10-11 10:56:14 | 只看该作者 Only view this author
吴双 发表于 2023-10-11 10:31
老师 那根据我的计算结果显示,能认为催化剂1失去一个电子的过程中,所有氧原子失去一个电子的相对于Cr失 ...

实际中分子失去电子时从哪里失去得多,用Multiwfn画个密度差图,或者对原子电荷求差便知
如果你就是非得要得到某个原子失去特定数目电子的这种人为虚构的电子结构状态的结构和能量,必须用约束性DFT,看
谈谈约束性DFT(CDFT)
http://sobereva.com/271http://bbs.keinsci.com/thread-535-1-1.html
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发表于 Post on 2023-10-11 15:58:54 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2023-10-11 10:56
实际中分子失去电子时从哪里失去得多,用Multiwfn画个密度差图,或者对原子电荷求差便知
如果你就是非得 ...

老师 分子失去电子后,与失去电子之前。原子的自旋布局差值和原子电荷差值有什么关联么。

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发表于 Post on 2023-10-11 16:58:18 | 只看该作者 Only view this author

Gaussian提交任务出现语法错误

本帖最后由 筱婷397 于 2023-10-11 17:10 编辑

提交任务的时候,显示语法错误,反复删减尝试发现删掉“em=gd3bj”之后,可以正常提交运算,请问各位老师这是什么原因呢?是版本问题吗,我用的是G09D01。

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发表于 Post on 2023-10-11 17:22:15 | 只看该作者 Only view this author
吴双 发表于 2023-10-11 08:58
老师 分子失去电子后,与失去电子之前。原子的自旋布局差值和原子电荷差值有什么关联么。

只要知道失去电子之前的电子结构,以及电子是从哪里失去的,就可以同时得到原子的自旋布居(注意是”居“不是”局“)差值和原子电荷差值。但是如果单知道自旋布居差值,而对体系电子结构一无所知的话,是不可能推知原子电荷差值的,反之亦然。从这个角度讲,自旋布居差值和电荷差值没有直接关系,它们都由同一个东西(体系电子结构的变化)决定,但彼此之间并没有直接的因果关系
Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员
Google Scholar: https://scholar.google.com/citations?user=XW6C6eQAAAAJ
ORCID: https://orcid.org/0000-0002-4540-8734
主页:http://www.qitcs.qd.sdu.edu.cn/info/1133/1776.htm
GitHub:https://github.com/wzkchem5
本团队长期招收研究生,有意者可私信联系

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-10-11 17:49:42 | 只看该作者 Only view this author
筱婷397 发表于 2023-10-11 16:58
提交任务的时候,显示语法错误,反复删减尝试发现删掉“em=gd3bj”之后,可以正常提交运算,请问各位老师这 ...

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发表于 Post on 2023-10-11 18:09:11 | 只看该作者 Only view this author

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已上传,麻烦老师看看,谢谢

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发表于 Post on 2023-10-11 19:24:39 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2023-10-11 17:22
只要知道失去电子之前的电子结构,以及电子是从哪里失去的,就可以同时得到原子的自旋布居(注意是”居“ ...

好哒 谢谢老师

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-10-11 19:50:03 | 只看该作者 Only view this author
筱婷397 发表于 2023-10-11 18:09
已上传,麻烦老师看看,谢谢

你明明用的是G09 A.02
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发表于 Post on 2023-10-12 14:44:06 | 只看该作者 Only view this author
各位老师好,请问irc发现过渡态旁边有个高一点的点。需要对这个点重新优化过渡态吗?irc能走通的情况下

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-10-13 04:25:25 | 只看该作者 Only view this author
lurensan 发表于 2023-10-12 14:44
各位老师好,请问irc发现过渡态旁边有个高一点的点。需要对这个点重新优化过渡态吗?irc能走通的情况下

发个IRC的能量-反应坐标变化图看看
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发表于 Post on 2023-10-13 11:17:23 | 只看该作者 Only view this author
各位老师,我看了sob老师http://sobereva.com/176关于芳香性的介绍,仍有一些不太理解的地方,在这里请教一下:
1. 请问芳香性越强是指电子的离域能力越强,还是指构成离域电子的电子密度越大?还是两者对芳香性都有贡献?
2. 共轭效应能影响芳香性吗?例如过渡金属与苯环的d-p共轭。若能,从离域角度,苯环电子能离域到更多的轨道上(金属的d轨道),芳香性增强;从电子密度角度,过渡金属通常为得电子的一方,苯环电子密度减小,芳香性减小。这该如何解释?

先谢谢各位老师了!

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