简单Multiwfn使用问题和波函数分析问题答疑专贴

ABetaCarw · 发表于 Post on 2019-5-6 14:46:48

社长大人，限制性开壳层的SOMO轨道图形按原理来说是和电子自旋密度图应该是一样的吗？突发奇想的一个想法不太敢确定。

sobereva · 发表于 Post on 2019-5-7 08:28:07

ABetaCarw 发表于 2019-5-6 14:46
社长大人，限制性开壳层的SOMO轨道图形按原理来说是和电子自旋密度图应该是一样的吗？突发奇想的一个想 ...

所有SOMO轨道波函数求平方加和得到的函数就是这个RO波函数对应的自旋密度

freq · 发表于 Post on 2019-5-7 11:00:20

sob老师，您好，想请教您一下，我在做NTO分析生成新的fch文件后重新载入fch文件时出现闪退，用程序调用Multiwfn时出现如图的错误，请老师帮我看一下哪里出错了。

sobereva · 发表于 Post on 2019-5-8 09:53:38

freq 发表于 2019-5-7 11:00
sob老师，您好，想请教您一下，我在做NTO分析生成新的fch文件后重新载入fch文件时出现闪退，用程序调用Mult ...

光从这上看不出来
最好把你做NTO分析的步骤贴上来，输入文件全都压缩后传上来（超过5MB传到网盘），并且注明你的Multiwfn的更新日期（程序启动时显示了）

lufenghxu · 发表于 Post on 2019-5-9 15:02:28

本帖最后由 lufenghxu 于 2019-5-9 21:35 编辑

老师，文献中标亮的部分进行了Charge transfer的分析，请问MULTIWFN可以吗？我的理解是fragment molecule的homo在complex molecule orbital中对占据轨道各个组分乘以2，求和，既是HOMO轨道电子分布的变化值。不知道这样理解对不。我试过另一篇文献，数值比较接近。不知道对不？

sobereva · 发表于 Post on 2019-5-10 10:34:46

lufenghxu 发表于 2019-5-9 15:02
老师，文献中标亮的部分进行了Charge transfer的分析，请问MULTIWFN可以吗？我的理解是fragment molecule的 ...

大概扫了一眼，本质上就是算轨道成分而已，Multiwfn在这方面是所有程序里最强大、最灵活的。见
谈谈轨道成份的计算方法
http://sobereva.com/131
或手册4.8节的例子。

顺带一提，某个轨道上某个原子的布居数，等于这个原子对这个轨道贡献量乘上轨道占据数。

erya123 · 发表于 Post on 2019-5-14 09:03:22

老师，该文献中的Electron density difference (EDD) maps，是不是反馈π键的相互作用图，但是名称又不是。看起来有点糊涂。multiwfn可以做吗？

sobereva · 发表于 Post on 2019-5-14 20:36:05

erya123 发表于 2019-5-14 09:03
老师，该文献中的Electron density difference (EDD) maps，是不是反馈π键的相互作用图，但是名称又不是。 ...

这需要用ETS-NOCV方法，不是普通的密度差图
以后Multiwfn可能支持，目前不行。非要用的话可以暂时考虑ORCA做ETS-NOCV

erya123 · 发表于 Post on 2019-5-16 00:03:11

老师，绘制DOS,TDOS图的时候，生成的DOS_line.txt的文件里面每一列（行）都指的是什么信息，放到origin里面的曲线好奇怪啊。

erya123 · 发表于 Post on 2019-5-16 00:05:43

sobereva 发表于 2019-5-14 20:36
这需要用ETS-NOCV方法，不是普通的密度差图
以后Multiwfn可能支持，目前不行。非要用的话可以暂时考虑OR ...

老师，这好像和平常的反馈π键轨道图不一样啊。看不懂啊

sobereva · 发表于 Post on 2019-5-16 00:24:00

erya123 发表于 2019-5-16 00:03
老师，绘制DOS,TDOS图的时候，生成的DOS_line.txt的文件里面每一列（行）都指的是什么信息，放到origin里面 ...

屏幕上都提示得超级清楚，仔细看屏幕提示

另见
使用Multiwfn绘制态密度(DOS)图考察电子结构
http://sobereva.com/482（http://bbs.keinsci.com/thread-13242-1-1.html）

erya123 · 发表于 Post on 2019-5-16 08:45:29

sobereva 发表于 2019-5-16 00:24
屏幕上都提示得超级清楚，仔细看屏幕提示

另见

谢谢老师！

QuantumHan · 发表于 Post on 2019-5-21 18:03:29

请问老师，最近绘制自旋密度等值面图，这个用英文翻译成the atomic spin populations of contour map还是the contour map of spin density，亦或是应该怎么翻译呢？谢谢老师的解答。

sobereva · 发表于 Post on 2019-5-22 03:13:23

QuantumHan 发表于 2019-5-21 18:03
请问老师，最近绘制自旋密度等值面图，这个用英文翻译成the atomic spin populations of contour map还是th ...

“the atomic spin populations of contour map”这从原理上是错的。自旋布居是每个片段一个数值，而不是一个函数
contour map更多指的是平面等值线图

应当写成isosurface map of spin density

孟不获 · 发表于 Post on 2019-5-26 16:50:28

老师好，按照手册内容在ubuntu18上安装了Multiwfn，在使用终端启动时，出现如下提示：
Multiwfn: error while loading shared libraries: libXm.so.4: cannot open shared object file: No such file or directory
计算机小白，还请指点。
另外，在使用orca4.1.2linux x86-64 shared openmpi313时，想利用orca_2mkl将.gbw文件转换为.molden.input文件时，系统提示在gbw文件中找不到轨道，以前在windows环境下一直是成功的。

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