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楼主 Author: sobereva
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[Multiwfn使用咨询] 简单Multiwfn使用问题和波函数分析问题答疑专贴

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-9-28 10:12:13 | 只看该作者 Only view this author
Gzh_NJ 发表于 2022-9-27 20:13
卢老师您好,请问我在绘制Hirshfled Surface图时出现了以下情况,整个表面都是红色,显示整体表面的电子密 ...

估计是操作步骤问题
建议你先重复一遍Multiwfn手册里的例子熟悉流程
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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发表于 Post on 2022-9-28 11:04:37 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2022-9-28 10:12
估计是操作步骤问题
建议你先重复一遍Multiwfn手册里的例子熟悉流程

谢谢卢老师,已经解决。是我最开始基于分子晶体cif文件抠出分子团簇结构时候跟您视频操作不一致,我的abc当时都选定的是3,刚刚换成4就做出来了。
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发表于 Post on 2022-9-30 22:01:06 | 只看该作者 Only view this author
sob老师,我用Multiwfn生成cp2k激发态的输入文件时,如果选PBE0—ADMM时,在&PROPERTIES部分,在总是拉下一句END,如下:
&PROPERTIES
    &TDDFPT #TDDFT calculation
      NSTATES  200
      RKS_TRIPLETS .F. #If calculating triplet rather than singlet excited states
      CONVERGENCE [eV] 1E-4 #Convergence criterion of all excitation energies
      MIN_AMPLITUDE 0.01 #The smallest excitation amplitude to print
#     RESTART .T. #If restarting TDDFT calculation. If true, WFN_RESTART_FILE_NAME should be set to previous .tdwfn file
#     WFN_RESTART_FILE_NAME TiO2-2O-TD-RESTART.tdwfn
      &XC
        &XC_GRID
          XC_DERIV SPLINE2_SMOOTH #The method used to compute the derivatives
        &END XC_GRID
        &XC_FUNCTIONAL PBE0
        &END XC_FUNCTIONAL           #本句会拉下
      &END XC
    &END TDDFPT
  &END PROPERTIES
&END FORCE_EVAL

非常感谢sob老师开发的Multiwfn  

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-10-2 04:42:15 | 只看该作者 Only view this author
reid 发表于 2022-9-30 22:01
sob老师,我用Multiwfn生成cp2k激发态的输入文件时,如果选PBE0—ADMM时,在&PROPERTIES部分,在总是拉下一 ...

我已更新了Multiwfn官网上最新版本修正了此问题
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发表于 Post on 2022-10-2 21:55:08 | 只看该作者 Only view this author
谢谢sob老师

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发表于 Post on 2022-10-4 10:49:17 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 329678001 于 2022-10-4 10:55 编辑

各位老师,请教一下,我做前线分子轨道时候这个金属和氧原子(箭头指向)有个明显的反键,为何我做定域化轨道分析的时候这个反键轨道没有了呢?如果这个定域化轨道不能分析反键轨道,那反键轨道应该用什么来分析呀?

定域化分子轨道.png (28.56 KB, 下载次数 Times of downloads: 25)

定域化分子轨道.png

前线分子轨道.png (254.76 KB, 下载次数 Times of downloads: 25)

前线分子轨道.png

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-10-5 18:09:31 | 只看该作者 Only view this author
329678001 发表于 2022-10-4 10:49
各位老师,请教一下,我做前线分子轨道时候这个金属和氧原子(箭头指向)有个明显的反键,为何我做定域化轨 ...

未必真的有反键作用
你可以尝试用NAdO来分析这两个原子间的相互作用,看
使用键级密度(BOD)和自然适应性轨道(NAdO)图形化研究化学键
http://sobereva.com/535http://bbs.keinsci.com/thread-16453-1-1.html
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发表于 Post on 2022-10-16 20:53:08 | 只看该作者 Only view this author
请问各位老师,有做过轨道正交化后再作CDA分析吗?有无操作流程分享一下?

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-10-17 00:31:20 | 只看该作者 Only view this author
护卫天使 发表于 2022-10-16 20:53
请问各位老师,有做过轨道正交化后再作CDA分析吗?有无操作流程分享一下?

如果你是指下文的双正交化,做完双正交化(且要求计算轨道能量)之后导出波函数文件。之后作为输入文件照常做CDA
用于非限制性开壳层波函数的双正交化方法的原理与应用
http://sobereva.com/448http://bbs.keinsci.com/thread-11377-1-1.html
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发表于 Post on 2022-10-19 14:21:24 | 只看该作者 Only view this author
今天看到Sob老师写的Multiwfn提供分子描述符的博文,突然想起来传统的很多分子描述符计算工具似乎也能计算一些基于量化的信息,比如HOMO-LOMO...,想请教老师,这种量化的信息是怎么计算出来的,他们难道内置了QM计算策略?这类软件可计算的量化信息多吗?

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-10-19 18:23:58 | 只看该作者 Only view this author
wanghaoyu 发表于 2022-10-19 14:21
今天看到Sob老师写的Multiwfn提供分子描述符的博文,突然想起来传统的很多分子描述符计算工具似乎也能计算 ...

是LUMO不是LOMO
看具体程序介绍。有的工具可能只是基于非常简单原始的一些半经验方法得到的,或者用一些经验关系估计的
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发表于 Post on 2022-10-28 21:41:02 | 只看该作者 Only view this author
老师好,我对Ni-O键(O来自water)作AIM拓扑分析,得到了数据如下:ρ(r)=0.0745        V(r)=-0.1263        ▽2ρ(r)=0.4001        H(r)=-0.0131        Eta index=        0.1878. 看博文可以通过▽2ρ(r)<0,H(r)<0,Eta index>1判断共价作用。这里的数据该如何分析?

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-10-29 04:33:43 | 只看该作者 Only view this author
护卫天使 发表于 2022-10-28 21:41
老师好,我对Ni-O键(O来自water)作AIM拓扑分析,得到了数据如下:ρ(r)=0.0745        V(r)=-0.1263        ▽2ρ(r)=0. ...

按这里说的判断


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发表于 Post on 2022-11-8 18:17:20 | 只看该作者 Only view this author
老师您好,我拜读了您AtXn⋯H2O/H2S络合物的这篇文章,请问文中所提及的NBO,SDD的讨论方法能否能够用于复合物[有机物和碱土金属]中碱土金属与溶剂[[弱相互作用结合]去讨论溶液环境对与复合物形成的影响嘛?

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发表于 Post on 2022-11-8 18:58:30 | 只看该作者 Only view this author
老师好,请问对于Ni(h2)6和Co(h2o)6两种配合物,定义了两个片段分别为:金属、水配体。理论级别是pbe0/def2-svp. CDA电荷分析转移量显示配体向Ni转移的多一点,对于ETS-NOCV分析,Ni配合物的总的轨道相互作用能反而比Co配合物低,请问这是否正常?而用pbe0/def2-tzvp级别时,是Ni配合物轨道相互作用大一些,但此时电荷分解的back donation项全是负数。同类化合物,电荷转移量与轨道相互能是否有相关线性关系?

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