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楼主 Author: sobereva
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[Multiwfn使用咨询] 简单Multiwfn使用问题和波函数分析问题答疑专贴

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-6-6 00:48:24 | 只看该作者 Only view this author
白浪滔天 发表于 2024-6-6 00:14
老师好,我在使用Multiwfn 3.8 (dev)绘制IR谱图时,依次输入11、1、0后出现以下内容,其中的警告:libpng ...

换个机子
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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发表于 Post on 2024-6-18 09:41:39 | 只看该作者 Only view this author
老师您好,我采用ORCA5.0.3做了TD-DFT计算,但是不知道为什么,打开Multiwfn(3.8 dev 2023 6 4版本)绘制紫外光谱时(拖入out文件,选择11/3回车),一直闪退。想烦请您看一下问题出在哪里,我看Multiwfn3.13.2,绘制UV-Vis光谱时应该不需要额外的关键词。

PhCZ_B3LYP.out

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-6-19 04:55:43 | 只看该作者 Only view this author
cokie 发表于 2024-6-18 09:41
老师您好,我采用ORCA5.0.3做了TD-DFT计算,但是不知道为什么,打开Multiwfn(3.8 dev 2023 6 4版本)绘制 ...

别在恶心的powershell下运行ORCA。下文里搜powershell
OfakeG:使GaussView能够可视化ORCA输出文件的工具
http://sobereva.com/498http://bbs.keinsci.com/thread-13952-1-1.html
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发表于 Post on 2024-7-16 14:27:31 | 只看该作者 Only view this author
sob老师您好,在对S0-S1垂直激发过程,用Multiwfn做电子—空穴分析的时候

请问在gaussian垂直激发任务中加不加“density”关键词(就是激发态非弛豫或弛豫密度分析时),空穴的分布是否都是严格相等呢?

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-7-16 22:20:30 | 只看该作者 Only view this author
cokie 发表于 2024-7-16 14:27
sob老师您好,在对S0-S1垂直激发过程,用Multiwfn做电子—空穴分析的时候

请问在gaussian垂直激发任务中 ...

下文的空穴-电子分布完全不需要density关键词。本来本质上就是基于非弛豫的激发态密度做的分析
使用Multiwfn做空穴-电子分析全面考察电子激发特征
http://sobereva.com/434http://bbs.keinsci.com/thread-10775-1-1.html
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发表于 Post on 2024-7-17 14:22:14 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2024-7-16 22:20
下文的空穴-电子分布完全不需要density关键词。本来本质上就是基于非弛豫的激发态密度做的分析
使用Mult ...

谢谢sob老师的解答

我的问题描述可能不太清楚,主要是想请教sob老师我的理解是否正确:
比如针对S0-S1这个态的垂直激发过程,基于非弛豫的激发态密度做电子-空穴分析、和基于弛豫的激发态密度做电子-空穴分析时,其中有区别的是否只是“电子的分布”?这两种情况“空穴的分布”是否完全一致呢?

先谢过老师!

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-7-23 03:30:58 | 只看该作者 Only view this author
cokie 发表于 2024-7-17 14:22
谢谢sob老师的解答

我的问题描述可能不太清楚,主要是想请教sob老师我的理解是否正确:

Multiwfn的空穴-电子分布没法基于弛豫的激发态密度做
激发态-基态的密度差可以分为弛豫和非弛豫的(但空穴-电子分析模块里给出的密度差只能是非弛豫的),差异下文明确说了
使用Multiwfn做空穴-电子分析全面考察电子激发特征
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cokie + 3 感谢sob老师,我明白了

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发表于 Post on 2024-8-21 11:47:25 | 只看该作者 Only view this author
老师您好,

文献( Macchi, P.; Sironi, A. Chemical Bonding in Transition Metal Carbonyl Clusters: Complementary Analysis of Theoretical and Experimental Electron Densities. Coordination Chemistry Reviews 2003, 238–239, 383–412.)使用了一个参数 electron density integrated over the interatomic surface (IAS) separating atoms A and B来分析金属键,使用Multiwfn做电子密度盆分析的时候没有看到这个选项,请问有什么办法可以计算出该数值?感谢感谢

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-8-21 12:02:17 | 只看该作者 Only view this author
cyan24 发表于 2024-8-21 11:47
老师您好,

文献( Macchi, P.; Sironi, A. Chemical Bonding in Transition Metal Carbonyl Clusters:  ...

Multiwfn不支持盆间面积分
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发表于 Post on 2024-8-21 12:54:36 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2024-8-21 12:02
Multiwfn不支持盆间面积分

明白,请问老师有推荐的软件吗

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发表于 Post on 2024-8-30 12:13:57 | 只看该作者 Only view this author
卢老师好,请问如果我想考察一系列含 N 的芳杂环对一个 Ir 金属配合物的亲核能力,可以采用什么方法。可不可以类似于考察价层电子密度,将 pi 轨道归零,计算 N 的 sigma 电子
KimariYB, Postgraduate, XiaMen University
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-8-31 06:05:01 | 只看该作者 Only view this author
kimariyb 发表于 2024-8-30 12:13
卢老师好,请问如果我想考察一系列含 N 的芳杂环对一个 Ir 金属配合物的亲核能力,可以采用什么方法。可不 ...

算N附近的静电势极小点(主要由孤对电子导致和贡献)的静电势数值,越负说明越亲核,参考下文
使用Multiwfn对静电势和范德华势做拓扑分析精确得到极小点位置和数值
http://sobereva.com/645http://bbs.keinsci.com/thread-30769-1-1.html
也可以算原子电荷,但原理上上面的方法更好,因为更具体到作用位点上
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发表于 Post on 2024-9-19 17:51:33 | 只看该作者 Only view this author

大佬请问一下这个一直报错




我自己手动输入200 3 180-181 2 1能出来,但是用这个就txt文件就报错,手动输入可以出来cue文件,放入VMD,改了路径,也不出orb

202409191745196650..png (83.65 KB, 下载次数 Times of downloads: 16)

202409191745196650..png

202409191745086849..png (83.65 KB, 下载次数 Times of downloads: 13)

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-9-20 05:59:43 | 只看该作者 Only view this author
ZYYYYC 发表于 2024-9-19 17:51
我自己手动输入200 3 180-181 2 1能出来,但是用这个就txt文件就报错,手动输入可以出来cue文件,放 ...

以后发帖别用“大佬请问一下这个一直报错”这种标题,仔细看http://bbs.keinsci.com/thread-9348-1-1.html

仔细阅读下文搞清楚命令行方式运行的逻辑,根据原理排查。命令行下运行看提示,甭写pause
详谈Multiwfn的命令行方式运行和批量运行的方法
http://sobereva.com/612http://bbs.keinsci.com/thread-24929-1-1.html

“cue文件”什么鬼

不要用“也不出orb”这种含糊不明的描述
仔细看
在网上求助计算化学问题的时候必须把问题描述得详细、具体、准确、清楚
http://sobereva.com/620http://bbs.keinsci.com/thread-25787-1-1.html

哪能就写一个showorb.vmd,source上哪去了?仔细一个字一个字看下文,该说的全都说得清清楚楚,甚至连视频都给了
使用Multiwfn+VMD快速绘制高质量分子轨道等值面图(含视频演示)
http://sobereva.com/447http://bbs.keinsci.com/thread-11122-1-1.html
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发表于 Post on 2024-9-20 11:13:20 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2024-8-31 06:05
算N附近的静电势极小点(主要由孤对电子导致和贡献)的静电势数值,越负说明越亲核,参考下文
使用Multi ...

卢老师,如果我还想定量分析 N 原子位点的空间位阻,有没有什么好的方法呢
KimariYB, Postgraduate, XiaMen University
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