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楼主 Author: sobereva
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[Multiwfn使用咨询] 简单Multiwfn使用问题和波函数分析问题答疑专贴

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发表于 Post on 2025-2-1 01:36:04 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 2877321934 于 2025-2-1 06:47 编辑
sobereva 发表于 2025-1-24 13:14
把那三个分量实际算出来,然后用类似下文提到的通过Multiwfn令偶极矩方向平行于某个笛卡尔轴的功能旋转体 ...

追问老师一个问题,我已按照博文中使用Multiwfn将fchk文件的偶极矩调整至跟X轴方向一致,并已经做了三能级模型分析,但是我并没有对log文件进行调整,突然意识到log文件是不是也有必要调整到偶极矩跟X轴方向一致呢?我觉得应该是有必要的,因为我尝试将调整后的fchk文件和未经调整的log文件丢进Multiwfn产生SOS.txt文件,内容跟未经调整的fchk文件和未经调整的log文件丢进Multiwfn产生的SOS.txt文件内容是一模一样的。是否需要把调整好的fchk文件结构保存为gjf文件,加上nosymm关键词后保持跟之前一致的计算级别重新算一次,用得到的fchk文件和log文件来进行三能级模型分析呢?
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2025-2-1 16:04:50 | 只看该作者 Only view this author
2877321934 发表于 2025-1-31 18:29
请问老师,倘若第一和第二激发态的振子强度算出来分别为0.4559,1.1068,此时用Multiwfn对第一超极化率做双 ...

你可以算下这两个态对计算的属性的实际贡献(不仅取决于f),如果相差悬殊就可以用双能级,否则得用下文的三能级分析
使用Multiwfn对第一超极化率做双能级和三能级模型分析
http://sobereva.com/512http://bbs.keinsci.com/thread-14501-1-1.html
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2025-2-1 16:29:44 | 只看该作者 Only view this author
2877321934 发表于 2025-2-1 01:36
追问老师一个问题,我已按照博文中使用Multiwfn将fchk文件的偶极矩调整至跟X轴方向一致,并已经做了三能 ...

需要用调整后的坐标结合nosymm重算一次
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发表于 Post on 2025-2-1 22:00:18 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 2877321934 于 2025-2-1 23:05 编辑
sobereva 发表于 2025-2-1 16:04
你可以算下这两个态对计算的属性的实际贡献(不仅取决于f),如果相差悬殊就可以用双能级,否则得用下文 ...

谢谢老师的解答,不过有点不太理解,请问您的意思是分别将两个态当作关键态进行双能级模型分析,看其是否相差悬殊吗?
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2025-2-2 17:48:26 | 只看该作者 Only view this author
2877321934 发表于 2025-2-1 22:00
谢谢老师的解答,不过有点不太理解,请问您的意思是分别将两个态当作关键态进行双能级模型分析,看其是否 ...

北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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发表于 Post on 2025-2-4 06:48:32 | 只看该作者 Only view this author
请问老师一个问题,众所周知,片段对跃迁偶极矩的贡献往往是有原点依赖性的,倘若我要对比两个分子的片段偶极矩贡献情况,同时我这两个分子的朝向不能调整,因为要用于双能级模型分析,请问此时应当如何调整原点位置,以使得这两个分子的朝向不变,但是原点的选取有一定一致性原则,以使这两个分子的片段偶极矩情况具有可比性呢?
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2025-2-4 14:52:11 | 只看该作者 Only view this author
2877321934 发表于 2025-2-4 06:48
请问老师一个问题,众所周知,片段对跃迁偶极矩的贡献往往是有原点依赖性的,倘若我要对比两个分子的片段偶 ...

片段内的跃迁密度积分值不为0时片段对跃迁偶极矩的贡献有对原点的依赖性,这无论怎么选择原点都无法避免,也没法令两个片段的贡献严格可比。
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sobereva 发表于 2025-2-4 14:52
片段内的跃迁密度积分值不为0时片段对跃迁偶极矩的贡献有对原点的依赖性,这无论怎么选择原点都无法避免 ...

好的,谢谢老师的回复,只能凑合着定性比较看看了。
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发表于 Post on 2025-2-9 10:51:07 | 只看该作者 Only view this author
请问老师,我在参考您的博文http://sobereva.com/432用Multiwfn做LOL-pi的填色图,这个分子我感兴趣的那一部分的原子是共平面,除此之外还有两条侧链不感兴趣,我的操作步骤如下,载入fchk文件后,先输入100,再输入22检测pi轨道,再输入-1: Orbitals are in localized form (e.g. LMO, NBO),再输入0 Detect pi orbitals and then set occupation numbers,再输入2  //把pi轨道以外的轨道占据数清零,接着就跟您博文里的这个例子操作一模一样
唯独不同的是,我的投影平面我是用三个原子确定一个平面的,即我感兴趣的共平面的原子中随便选了3个原子序号。但是,最后绘制出来的图没有包含所有我感兴趣的部分,仅有一小部分,还有一部分没在图中作出的位置也具有共轭特征,但是没在图里显示,请问老师,如何手动调整作图范围,使分子更多的部分在图中被作出来呢?
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2025-2-10 03:16:40 | 只看该作者 Only view this author
2877321934 发表于 2025-2-9 10:51
请问老师,我在参考您的博文http://sobereva.com/432用Multiwfn做LOL-pi的填色图,这个分子我感兴趣的那一 ...

没具体信息(体系结构、选择的原子、等值面图)没法判断
弄清楚作图平面是怎么定义的,照着等值面图一看就知道怎么回事。LOL-pi在分子局部平面上有节面,如果选的是这个局部平面上的三个原子定义作图平面注定什么也显示不出来
作图平面的选择在下文4.2节有详细的说明
Multiwfn FAQ
http://sobereva.com/452
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发表于 Post on 2025-2-25 18:34:13 | 只看该作者 Only view this author
sob老师您好,用Gaussian进行单点计算保存波函数为fchk,然后用multiwfn转成mkl文件,报错 Error: Some basis functions are Cartesian type, however, ORCA only supports spherical-harmonic basis functions, Press ENTER button to return 该如何解决呀?体系将近200原子,有金属Ir.

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发表于 Post on 2025-2-26 09:39:57 | 只看该作者 Only view this author
498746012 发表于 2025-2-25 18:34
sob老师您好,用Gaussian进行单点计算保存波函数为fchk,然后用multiwfn转成mkl文件,报错 Error: Some bas ...

这个问题不需要专门问卢老师,Gaussian带着上次的chk重新跑一次单点能计算,关键词加上5D 7F Guess=Read这三个即可,用新的chk转成fch,然后再做你提到的操作。

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发表于 Post on 2025-2-26 09:55:47 | 只看该作者 Only view this author
snljty2 发表于 2025-2-26 09:39
这个问题不需要专门问卢老师,Gaussian带着上次的chk重新跑一次单点能计算,关键词加上5D 7F Guess=Read ...

老师您好,我没有读chk文件,只是加了5d重新算了单点,生成的chk转成fchk,用multiwfn转mkl还是同样的错误

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发表于 Post on 2025-2-26 10:04:30 | 只看该作者 Only view this author
498746012 发表于 2025-2-26 09:55
老师您好,我没有读chk文件,只是加了5d重新算了单点,生成的chk转成fchk,用multiwfn转mkl还是同样的错 ...

1. 对于某些元素某些基组,除了5D关键词,7F也要加。2. 检查Multiwfn的settings.ini文件里面iloadasCart= 后面的参数是什么,以及启动Multiwfn有没有读settings.ini。

本版积分规则 Credits rule

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