Materials Studio 7.0至2017版本常见使用方法，数据分析长期答疑贴

sobereva

zhangj 发表于 2015-11-1 18:15
老师，还有一个问题就是我模拟金属氧化物表面吸附有机分子的体系，我发现动力学模拟一段时间以后分子都跑到 ...

这种情况相当于分子吸附到了金属氧化物板的下放了。下方和上方表面的原子排布有没有什么差异？如果由于什么原因，板的下方更容易吸附分子，可能倒是会有这情况。

zhangj

sobereva 发表于 2015-11-2 07:08
这种情况相当于分子吸附到了金属氧化物板的下放了。下方和上方表面的原子排布有没有什么差异？如果由于什 ...

明白老师的意思了，谢谢老师！

jiewei

lastzealot 发表于 2015-10-31 12:23
老师，我用高斯优化完了一个结构，然后想用MS画一下结构图，想用虚线表示配位键，但是不知道如何来画虚线。 ...

当然可以咯， 在画键的那个地方啊。

jiewei

EITian 发表于 2015-10-4 18:45
各位老师节日快乐！我这里有个小问题，就是想参考前人的文章构建一个V2O5二聚体的模型，但是一直没有构造出 ...

它这个只是一个示意图，最左和最右的V原子属于下一个V2O5重复单元的原子

卒之爱

我想用MS计算无机物的键能，比如TiO2，想算Ti-O键能，但是优化结果没有该项数据，我是依据总的能量推导吗？

海门恶霸

请问如何去构建一个g-c3n4的模型，是直接画，还是用创建晶体的方法去做，哪个简单一点，搞了半天都没搞成。还有如何把他变成单层的模型？请求老师帮助

hopedream

想构建范德华力结合材料，分子动力学模拟溶剂分子和层状结构材料的作用.如图, C:\Users\hopedream\Desktop\figure1.jpg但是几何优化后，层的结构就散架了C:\Users\hopedream\Desktop\figure 2.jpg.如何材料不散架了。我用constraint，但是不能几何优化。还望各位赐教。万分感谢

hopedream

我理想中的情况，和我实际作出来的情况(没加溶剂分子，是想提前看看，因为我用笔记本算的)，如图所示。最后一个图是没优化前的图。

来巡老和山

老师我想咨询个问题：我将vasp计算出的contcar，通过vesta转为cif文件然后将其导入ms中，发现晶胞上顶面的原子全部消失是怎么回事。？该怎么解决。谢谢老师啦！

PhoenixYeti

老师，请问MS的并行计算效率如何？还有，在windows和linux下速度有没有较大区别？

zyj19831206

PhoenixYeti 发表于 2017-1-10 19:03
老师，请问MS的并行计算效率如何？还有，在windows和linux下速度有没有较大区别？

linux并行效率应该比win厉害吧，MS本身的dmol3我感觉比gaussian快一些，因此可以用作预优化。

PhoenixYeti

zyj19831206 发表于 2017-1-10 21:35
linux并行效率应该比win厉害吧，MS本身的dmol3我感觉比gaussian快一些，因此可以用作预优化。

谢谢。我主要使用CASTEP，不太清楚对硬件要求如何

zyj19831206

PhoenixYeti 发表于 2017-1-11 14:49
谢谢。我主要使用CASTEP，不太清楚对硬件要求如何

CASTEP使用平面波，对硬件要求应该比dmol3更加高。

jiewei

卒之爱 发表于 2016-5-12 22:16
我想用MS计算无机物的键能，比如TiO2，想算Ti-O键能，但是优化结果没有该项数据，我是依据总的能量推导吗？

键能肯定优化不能得到啊

jiewei

海门恶霸 发表于 2016-10-6 13:57
请问如何去构建一个g-c3n4的模型，是直接画，还是用创建晶体的方法去做，哪个简单一点，搞了半天都没搞成。 ...

找到CIF文件导入MS即可。
如果没有CIF，利用文献中给出的坐标和晶格参数，先根据晶格参数构建晶格，然后依次输入原子坐标即可。
特定单曾，按照你的需求删除其他原子即可。 如果是XXX面， 直接cleave surface即可。