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楼主 Author: sobereva
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[综合交流] 简单量子化学问题答疑专帖

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2026#
发表于 Post on 2023-8-1 19:09:06 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2023-8-1 17:24
最严格的是配体解离能
也可以用Multiwfn算配体的结合位点的平均局部离子化能、静电势、原子电荷等考察
...

好的好的谢谢老师

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2027#
发表于 Post on 2023-8-2 09:13:47 | 只看该作者 Only view this author
sob老师您好,要是比较C-O键和Si-O键哪个强,该算键级还是算其他什么呀?

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2028#
发表于 Post on 2023-8-2 18:01:14 | 只看该作者 Only view this author
498746012 发表于 2023-8-2 02:13
sob老师您好,要是比较C-O键和Si-O键哪个强,该算键级还是算其他什么呀?

如果是比较均裂的难易,算键能(最好是键解离自由能);如果比较异裂的难易,算异裂的自由能变。键级不能用来比较不同种类的键的强弱
Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员
Google Scholar: https://scholar.google.com/citations?user=XW6C6eQAAAAJ
ORCID: https://orcid.org/0000-0002-4540-8734
主页:http://www.qitcs.qd.sdu.edu.cn/info/1133/1776.htm
GitHub:https://github.com/wzkchem5
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2029#
发表于 Post on 2023-8-3 09:42:09 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2023-8-2 18:01
如果是比较均裂的难易,算键能(最好是键解离自由能);如果比较异裂的难易,算异裂的自由能变。键级不能 ...

老师您好,硅和醋酸的氧之间的成键,算键能是按照均裂来算还是异裂来算呀?

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2030#
发表于 Post on 2023-8-3 19:33:22 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 wzkchem5 于 2023-8-5 10:03 编辑
498746012 发表于 2023-8-3 02:42
老师您好,硅和醋酸的氧之间的成键,算键能是按照均裂来算还是异裂来算呀?

基态的键能默认是按能量最低的解离途径来算的,对于共价键一般是均裂,但也有例外;对于配位键一般是异裂。
但是正如我上一个帖子所说,不是所有比较键的强度的场合,都适合用键能,有时即使均裂比异裂容易,仍然要比异裂能
Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
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发表于 Post on 2023-8-4 08:50:33 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 498746012 于 2023-8-4 08:52 编辑
wzkchem5 发表于 2023-8-3 19:33
基态的键能默认是按能量最低的解离途径来算的,一般是均裂,但也有例外。
但是正如我上一个帖子所说,不 ...

谢谢老师,感觉好复杂呀。老师您说“有时即使均裂比异裂容易,仍然要比异裂能”能不能举个例子呀?

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2032#
发表于 Post on 2023-8-4 16:24:54 | 只看该作者 Only view this author
498746012 发表于 2023-8-4 01:50
谢谢老师,感觉好复杂呀。老师您说“有时即使均裂比异裂容易,仍然要比异裂能”能不能举个例子呀?[/back ...

比如:比较碱性条件下CH3F的C-F键和CH3OH的C-O键哪个更稳定。虽然C-F键和C-O键都是均裂比异裂容易,但是碱性条件下C-F键的断裂是走SN2途径,也就是异裂与新形成一根键的过程耦合起来的反应,可以认为是使得异裂变容易了(但是这个情况下这个反应也不能叫做异裂了,因为不仅断裂键,还生成了键),所以必须比异裂能
Zikuan Wang
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2033#
发表于 Post on 2023-8-4 21:42:13 | 只看该作者 Only view this author
想跟大家请教一下,用高斯做柔性扫描的时候,可以根据最高点电子能量与起始反应物电子能量的差值,预判一下这个过渡态的能垒高低么。

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-8-4 22:07:03 | 只看该作者 Only view this author
吴双 发表于 2023-8-4 21:42
想跟大家请教一下,用高斯做柔性扫描的时候,可以根据最高点电子能量与起始反应物电子能量的差值,预判一下 ...

可靠性很差,偏离过渡态可能很多
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
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2035#
发表于 Post on 2023-8-5 11:10:39 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2023-8-4 16:24
比如:比较碱性条件下CH3F的C-F键和CH3OH的C-O键哪个更稳定。虽然C-F键和C-O键都是均裂比异裂容易,但是 ...

谢谢老师的详细解答

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2036#
发表于 Post on 2023-8-5 14:16:46 | 只看该作者 Only view this author

chu'xu求助各位大神如下错误是什么原因导致[file orca_main/maininp4.cpp, line 11...

本帖最后由 tangmeng 于 2023-8-5 14:18 编辑

初学者求助各位大神如下错误是什么原因导致[file orca_main/maininp4.cpp, line 11068]:
输入文件如下
! B3LYP/G TZVP RIJCOSX def2/J miniprint tightSCF grid4 gridx4 pal4
%tddft
nroots 5
dosoc true
tda false
printlevel 3
end
* xyz 0 1
C                  0.00000000    0.00000000   -0.52513500
H                  0.00000000    0.93987900   -1.11261300
H                  0.00000000   -0.93987900   -1.11261300
O                  0.00000000    0.00000000    0.67200400
*
下面是输入的格式

PS C:\Users\30630\Desktop\1\2>  orca .\1.inp > 1.out
[file orca_main/maininp4.cpp, line 11068]:

PS C:\Users\30630\Desktop\1\2>

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2037#
发表于 Post on 2023-8-5 14:24:24 | 只看该作者 Only view this author
你是不是要重新编辑一下帖子,标题要改,报错内容给得也太抠了,得至少10行吧(但不要太慷慨地把整个文件内容复制粘贴上来)。另外,你用哪一个版本的ORCA呢?
自动做多参考态计算的程序MOKIT

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-8-5 17:00:29 | 只看该作者 Only view this author
tangmeng 发表于 2023-8-5 14:16
初学者求助各位大神如下错误是什么原因导致[file orca_main/maininp4.cpp, line 11068]:
输入文件如下
!  ...

如果用的ORCA 5,不能用 grid4 gridx4,仔细看
谈谈ORCA 5.0的新特性和改变
http://sobereva.com/604http://bbs.keinsci.com/thread-23917-1-1.html


并行计算必须写ORCA绝对路径,此文明确说了
量子化学程序ORCA的安装方法
http://sobereva.com/451http://bbs.keinsci.com/thread-11697-1-1.html


以后帖子标题不得用汉语拼音,否则直接删帖+扣分处理
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2039#
发表于 Post on 2023-8-5 23:36:27 | 只看该作者 Only view this author

Gaussian运行求助

各位老师帮我看看,为啥我的这个文件无法运行,直接就报错了,代码如下


%chk=ILMOH4.chk
%nprocshared=24
%mem=8GB
#p B3LYPD3/DEF2TZVP OPT FREQ

Title Card Required

0 1
C                 -2.46222100   -0.29256500   -0.52134600
C                 -3.97881900   -0.29687000   -0.41013700
O                 -1.94487300   -0.64804100   -1.60093700
O                 -1.82447000    0.08028200    0.50508000
H                 -4.27283100   -1.06511700    0.30636900
H                 -4.31912900    0.65976300   -0.01471400
H                 -4.44102400   -0.49881900   -1.37274700
N                  1.81944700   -0.86607300   -0.87464200
C                  0.77891600   -0.05599600   -1.03116000
N                  1.12524600    1.14772100   -0.59331100
C                  2.85290500   -0.16731400   -0.29957900
C                  2.41834100    1.10284400   -0.12714200
C                  1.74438100   -2.30941700   -1.02784000
C                  0.20499900    2.28441600   -0.50224600
C                 -0.03480800    2.67425400    0.94456400
H                 -0.23177700   -0.33930500   -1.38304600
H                  3.79232400   -0.63121600   -0.05964900
H                  2.91164700    1.96659400    0.27993100
H                  2.66373400   -2.67750500   -1.47765700
H                  1.58268600   -2.74890400   -0.04496900
H                  0.89804900   -2.54131200   -1.66933300
H                 -0.72247100    1.95507400   -0.96697600
H                  0.62657500    3.10524300   -1.08391900
H                  0.88903800    2.98839200    1.43209100
H                 -0.46648300    1.82866100    1.47696900
H                 -0.73796000    3.50574500    0.98086800
C                  0.03684100   -1.25311200    2.89155000
O                  0.32288700   -1.05617000    1.52871700
H                  0.93374000   -1.63710400    3.37984400
H                 -0.24921500   -0.31882200    3.38653700
H                 -0.77198200   -1.97605700    3.03811300
H                 -0.48933400   -0.67285100    1.10510200

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2040#
发表于 Post on 2023-8-6 00:04:47 | 只看该作者 Only view this author
Gaussian 里没有直接 B3LYPD3 的泛函,这里应该写成 #p B3LYP/DEF2TZVP em=GD3BJ OPT FREQ

本版积分规则 Credits rule

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