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楼主 Author: sobereva
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[综合交流] 简单量子化学问题答疑专帖

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-4-17 04:06:38 | 只看该作者 Only view this author
moiumuio 发表于 2024-4-17 00:39
Hi prof.
If there is existence of other anions (like cyanide CN-) and the impact of Iodine anion  ...

Use ma- version only for the fragments with very rich negative charge, such as CN-. However, if this region is not of interest, ignoring diffuse functions is still acceptable.
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-4-17 05:12:30 | 只看该作者 Only view this author
爱白熊的鱼 发表于 2024-4-16 20:49
第一次用高斯进行DFT仿真,想咨询一下chk转formchk出现Permission denied错误,应该怎么处理?谢谢~

不要用“仿真”这个词,仔细看
计算化学中的一些常见不良写法和用词
http://sobereva.com/298http://bbs.keinsci.com/thread-1358-1-1.html

那叫chk转fch
仔细看此文里跟formchk有关部分
详谈Multiwfn支持的输入文件类型、产生方法以及相互转换
http://sobereva.com/379http://bbs.keinsci.com/thread-6020-1-1.html

还弄不明白的话,把终端的截图发出来
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发表于 Post on 2024-4-17 10:26:37 | 只看该作者 Only view this author
各位老师好,请问对于一个分子A,我想计算其受光激发并发生电荷分离(Charge Separation)后的复合物: (A+A-)的吉布斯自由能,用E_(A+A-) - E_(A+) -  E_(A-) 是否大于0来判断这种准分子形成是否可以自发进行,在常用的量化程序中(例如Gaussian、ORCA等)应该如何实现呢?(主要是不知道E_(A+A-)该怎么计算)

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发表于 Post on 2024-4-17 10:29:17 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2024-4-17 05:12
不要用“仿真”这个词,仔细看
计算化学中的一些常见不良写法和用词
http://sobereva.com/298(http:// ...

好的谢谢老师~

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发表于 Post on 2024-4-17 10:41:44 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2024-4-16 03:48
说清楚具体什么不收敛,说不清楚就上传输出文件

老师,报错部分这样子的“ Convergence failure -- run terminated.
Error termination via Lnk1e in /data/Software/g16/l502.exe at Sun Apr 14 21:37:19 2024.
Job cpu time:      12 days  2 hours  3 minutes 15.8 seconds.
Elapsed time:       0 days 11 hours 16 minutes 32.5 seconds.
File lengths (MBytes):  RWF=   1520 Int=      0 D2E=      0 Chk=     52 Scr=      1”

11-1.out

28.43 KB, 下载次数 Times of downloads: 1

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发表于 Post on 2024-4-17 11:35:32 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 498746012 于 2024-4-17 11:39 编辑

老师好,用IRC验证过渡态,IRC走了10几步停掉了,说是PES minimum detected,这个结构不是我想要的,我用IRC最后一步的结构进行OPT最后的结构验证过渡态可以吗?

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发表于 Post on 2024-4-17 15:38:00 | 只看该作者 Only view this author
各位老师好!我现在在使用高斯进行一个过渡金属配合物催化的机构优化和几何计算,但是一直出现虚频,尝试在opt上加了tight或calcfc都没有消去,请问我之后该怎么做呢?以下是我的输入文件和输出文件

Co3-mid-2.gjf

3.16 KB, 下载次数 Times of downloads: 2

Co3-mid-2.zip

3.04 MB, 下载次数 Times of downloads: 3

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发表于 Post on 2024-4-17 15:54:05 | 只看该作者 Only view this author
sai77 发表于 2024-4-16 19:06
B和O没有指定基组

谢谢老师!我昨天没有看到回复之前又去掉了输入文件中的cartesian,maxcyc=200,然后又遇见了l9999报错,我重新添加基组后再看看这次的结果

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发表于 Post on 2024-4-17 18:31:11 | 只看该作者 Only view this author

用高斯结构优化出现错误 QPErr --- A syntax error was detected in the input line.

老师们好,做结构优化时出现语法错误,关键词基组都没问题不知道问题出现在哪里,请老师们帮忙看一下

opt-MOS2-1.gjf (6.99 KB, 下载次数 Times of downloads: 1)






opt-MOS2-1.log

4.19 KB, 下载次数 Times of downloads: 0

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发表于 Post on 2024-4-17 19:10:36 | 只看该作者 Only view this author
em=gd3bj

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发表于 Post on 2024-4-17 19:58:04 | 只看该作者 Only view this author

我天,不说我都没发现,我找了一天,没注意这里,感谢

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发表于 Post on 2024-4-17 20:31:23 | 只看该作者 Only view this author
Hi Prof.
According to the author of this article, "dx.doi.org/10.1021/ma4005023," in a neutral triplet state, LUMO would be the most accurately calculated with aHOMO. Considering that the differences between LUMO from that method and VEA are only ~0.3–0.5 eV which seems appropriate. However, I have never seen anyone use LUMO energy from triplet states—not even in the articles the author wrote afterward.

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-4-18 07:28:44 | 只看该作者 Only view this author
cokie 发表于 2024-4-17 10:26
各位老师好,请问对于一个分子A,我想计算其受光激发并发生电荷分离(Charge Separation)后的复合物: (A+A- ...

需要用CDFT
谈谈约束性DFT(CDFT)
http://sobereva.com/271http://bbs.keinsci.com/thread-535-1-1.html

CP2K、NWChem等程序支持

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moiumuio 发表于 2024-4-17 20:31
Hi Prof.
According to the author of this article, "dx.doi.org/10.1021/ma4005023," in a neutral trip ...

This paper is somewhat misleading. Please check http://sobereva.com/543, which clarified concept of HOMO and LUMO.
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498746012 发表于 2024-4-17 11:35
老师好,用IRC验证过渡态,IRC走了10几步停掉了,说是PES minimum detected,这个结构不是我想要的,我用IR ...

可以
记得结合较小的步长上限
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