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楼主 Author: sobereva
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[综合交流] 简单量子化学问题答疑专帖

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发表于 Post on 2024-5-10 14:45:14 | 只看该作者 Only view this author

gaussian计算报错2070

本帖最后由 xjun 于 2024-5-10 16:23 编辑

Gaussian计算显示 severe Error Message #2070:
The processsing of the last link ended abnormally. All processing has been aborted

查看gif文件末尾也空行了,还是报错。我用的是win板的G16。另外,我这个有机小分子是一个阳离子中间体,在chemdraw画好结构上传到gview,生成gif文件,自旋多重度为2,这个正确嘛,麻烦各位大佬帮忙看看。






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发表于 Post on 2024-5-10 14:59:17 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2024-5-10 07:58
必须得从生化降解的机理出发思考,考虑所有影响降解效率的可能性,典型的就是反应自由能垒

好的,我再尝试一下,谢谢sob老师!

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发表于 Post on 2024-5-10 15:46:51 | 只看该作者 Only view this author
Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员
Google Scholar: https://scholar.google.com/citations?hl=zh-CN&user=XW6C6eQAAAAJ&view_op=list_works&sortby=pubdate
ORCID: https://orcid.org/0000-0002-4540-8734
主页:http://www.qitcs.qd.sdu.edu.cn/info/1034/1702.htm
本团队长期招收研究生,有意者可私信联系

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发表于 Post on 2024-5-10 15:48:05 | 只看该作者 Only view this author
输入文件末尾空2行

吐槽一下:
1. 经典之输入文件是gjf而不是gif
2. HF配6-31G*简直是来搞笑的
3. 带阳离子的怎么可能电荷数是0
4. 盲猜一个楼主想做静电势电荷拟合,建议参考http://sobereva.com/441
too young, too simple, sometimes naïve

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发表于 Post on 2024-5-10 16:01:29 | 只看该作者 Only view this author
junemu 发表于 2024-5-8 15:25
请问老师,我想利用量化计算比较2-溴酚,3-溴酚,4-溴酚生化降解的难易程度,该用什么方法或用什么指标来衡 ...

这种问题适合从实验的角度解决。实验上确定哪个酶对于溴酚的降解占主导,然后再从计算上研究那个酶。
如果不做实验,且要做严格的计算,必须穷尽所有能和这些底物反应的酶。虽然和溴酚里面的C-Br键反应的酶不多,但是能和溴酚的O-H键以及邻对位碳原子反应的酶极其多,例如很多催化底物氧化的铁酶和铜酶。把任何一个酶算清楚都是一篇文章的工作量。
Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员
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发表于 Post on 2024-5-10 16:02:50 | 只看该作者 Only view this author
anson 发表于 2024-5-10 15:48
输入文件末尾空2行

吐槽一下:

是的,我是按文献的方法想做想用高斯和antechamber做配体分子RESP电荷计算,然后分子动力学模拟。没接触过高斯,也是在摸索做

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发表于 Post on 2024-5-10 16:03:15 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2024-5-10 15:46
按照http://bbs.keinsci.com/thread-4829-1-1.html自查

好嘞,感谢

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发表于 Post on 2024-5-10 16:04:57 | 只看该作者 Only view this author
anson 发表于 2024-5-10 15:48
输入文件末尾空2行

吐槽一下:

我这个末尾文件空了两行,试过也不行

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发表于 Post on 2024-5-10 16:14:54 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 xjun 于 2024-5-10 16:18 编辑
anson 发表于 2024-5-10 15:48
输入文件末尾空2行

吐槽一下:

通过g16空两行解决问题了,感谢感谢!原始文件空了两行,上传到g16就没有空行了。这个电荷我改成了1,自旋多重度是2正确吗?好吧,自旋多重度为2直接报错

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发表于 Post on 2024-5-10 17:28:56 | 只看该作者 Only view this author
xjun 发表于 2024-5-10 16:14
通过g16空两行解决问题了,感谢感谢!原始文件空了两行,上传到g16就没有空行了。这个电荷我改成了1,自 ...

...就算软件操作有问题,自旋多重度也没有理由算错啊

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发表于 Post on 2024-5-10 17:57:11 | 只看该作者 Only view this author
各位老师好,我用的ORCA 5.0.4,想问一下对于下面这种体系,泛函和基组的选择是否合适。结构优化和过渡态 : wB97X-D3/def2-SVP;能量计算:wB97M-V/def2-TZVP。

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发表于 Post on 2024-5-10 18:50:59 | 只看该作者 Only view this author
0000 发表于 2024-5-10 10:57
各位老师好,我用的ORCA 5.0.4,想问一下对于下面这种体系,泛函和基组的选择是否合适。结构优化和过渡态  ...

问题不大,不过注意对Na+做显式溶剂化
Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员
Google Scholar: https://scholar.google.com/citations?hl=zh-CN&user=XW6C6eQAAAAJ&view_op=list_works&sortby=pubdate
ORCID: https://orcid.org/0000-0002-4540-8734
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发表于 Post on 2024-5-10 18:56:27 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2024-5-10 18:50
问题不大,不过注意对Na+做显式溶剂化

好的,感谢老师。

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发表于 Post on 2024-5-10 19:45:03 | 只看该作者 Only view this author
Hi everyone,
Upon optimizing a structure using the provided input, the task abruptly terminates without displaying an error code. Are there any issues with what I submitted?

202405101940145816..png (29.27 KB, 下载次数 Times of downloads: 6)

202405101940145816..png

202405101943187046..png (60.15 KB, 下载次数 Times of downloads: 6)

202405101943187046..png

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-5-10 21:49:55 | 只看该作者 Only view this author
moiumuio 发表于 2024-5-10 19:45
Hi everyone,
Upon optimizing a structure using the provided input, the task abruptly terminates wit ...

%mem is too low
There is no reason to use so small memory setting
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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