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楼主 Author: sobereva
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[综合交流] 简单量子化学问题答疑专帖

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-7-8 23:50:55 | 只看该作者 Only view this author
abu123 发表于 2024-7-8 16:41
我在做几何优化的时候一直出现Error termination request processed by link 9999.错误,试了opt=loose,sym ...

Au4这么常见的体系别自己随便摆个结构就优化,google直接搜Au4 cluster,看文献里已经报道的结构是什么样,摆个差不多的再去优化。你这么随便摆一个结构,离最终极小点结构很远,达到收敛自然需要很多步,而当前原子数又少,Gaussian默认设的步数上限太少,显然会因为达到步数上限之前还没满足收敛限而报错。
报错原因自己看输出文件根据原理判断,别瞎试。

另外,B3LYP不太适合金属团簇类体系,看
谈谈量子化学研究中什么时候用B3LYP泛函优化几何结构是适当的
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发表于 Post on 2024-7-9 09:20:11 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2024-7-8 23:50
Au4这么常见的体系别自己随便摆个结构就优化,google直接搜Au4 cluster,看文献里已经报道的结构是什么样 ...

Sob老师,我是想研究C12Mn4Au4这个结构的基态结构(自旋多重度为21)的来源,然后我们老师说将其分成两部分,一部分为C12Mn4,另一部分为Au4,将这两部分从整体的结构中挖出来,分别进行计算并分析两者的相互作用,解释21重度的来源。所以这里的Au4结构是被挖出来的,我优化5重度时算出来了,但是单重度出现了上述情况,这里如果我用google搜出来的结构优化,会不会对我对整体的分析有影响?

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-7-9 13:54:02 | 只看该作者 Only view this author
abu123 发表于 2024-7-9 09:20
Sob老师,我是想研究C12Mn4Au4这个结构的基态结构(自旋多重度为21)的来源,然后我们老师说将其分成两部 ...

可以从片段角度分析相互作用,但不能对片段重新优化,要不然结构可能有极大的变化,基于单独优化的片段结构你也没法去分析实际整体结构下的片段间相互作用
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发表于 Post on 2024-7-9 15:51:23 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2024-7-9 13:54
可以从片段角度分析相互作用,但不能对片段重新优化,要不然结构可能有极大的变化,基于单独优化的片段结 ...

好的,那这样的话我就可以直接计算片段的单点能去分析对吧?

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发表于 Post on 2024-7-9 22:33:38 | 只看该作者 Only view this author
老师您好,我在用HFIP做溶剂计算,做优化想用IEFPCM溶剂模型,关键词中写的是scrf(read,solvent=generic),然后输入文件末尾写了eps=16.70,epsinf=1.6256,但是总是报错,显示识别不出来eps,想问一下老师,这该怎么改一下?
Unrecognized atomic symbol eps
Error termination via Lnk1e in /home/chen/bkd/gaussian/g09/l301.exe at Thu Jul  4 18:33:59 2024.

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发表于 Post on 2024-7-9 22:54:44 | 只看该作者 Only view this author
化小白 发表于 2024-7-9 15:33
老师您好,我在用HFIP做溶剂计算,做优化想用IEFPCM溶剂模型,关键词中写的是scrf(read,solvent=generic), ...

空行的数目不对吧
Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员
Google Scholar: https://scholar.google.com/citations?hl=zh-CN&user=XW6C6eQAAAAJ&view_op=list_works&sortby=pubdate
ORCID: https://orcid.org/0000-0002-4540-8734
主页:http://www.qitcs.qd.sdu.edu.cn/info/1034/1702.htm
本团队长期招收研究生,有意者可私信联系

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-7-10 14:41:27 | 只看该作者 Only view this author
abu123 发表于 2024-7-9 15:51
好的,那这样的话我就可以直接计算片段的单点能去分析对吧?

可以
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发表于 Post on 2024-7-11 09:59:26 | 只看该作者 Only view this author

谢谢sob老师,我还有一个问题。如果我假设Mn4C12有24个单电子,Au4有5个单电子,当其相互作用后,形成有20个单电子的C12Mn4Au4.那么我在验证这个猜测是否正确时,是不是可以先分别找出这三个体系中alpa和beta未配对的轨道,然后找出Mn4C12中未配对的轨道可以与Au4中未配对的轨道相互作用的轨道,然后用Mn4C12中未配对的轨道减去可以相互作用的这几个轨道,剩下的轨道如果与C12Mn4Au4中未配对的轨道一致,就可以说明这个假设是正确的?

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发表于 Post on 2024-7-11 10:52:14 | 只看该作者 Only view this author
突然发现自己把Default.Rou文件放在了\G09W\目录下,而非\G09W\scratch\,但好像也可以生效?

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-7-11 15:42:12 | 只看该作者 Only view this author
abu123 发表于 2024-7-11 09:59
谢谢sob老师,我还有一个问题。如果我假设Mn4C12有24个单电子,Au4有5个单电子,当其相互作用后,形成有2 ...

直接对比不同自旋态的能量就完了,能量最低的就是实际的自旋态
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发表于 Post on 2024-7-11 17:21:13 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2024-7-11 15:42
直接对比不同自旋态的能量就完了,能量最低的就是实际的自旋态

对,现在是确认了C12Mn4Au4 的实际自旋态是21,现在想通过分析片段的相互作用来理论解释21重度的来源。上述的这个分析思路是否可行?

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发表于 Post on 2024-7-13 14:03:35 | 只看该作者 Only view this author
各位老师好,请问系间窜越过程(S1 --> T1)可以和化学反应A --> B的过程类比吗?即:我是否可以通过某些手段湮灭T态,降低T态的浓度,从而促进未系间窜越的S态进一步向T态转移呢?
(我的理解中这两者是没法类比的,毕竟系间窜越只是S1 --> S0释能途经中的一条,除非切断其他释能途经,否则理论上应该无法在其他条件不变的情况下,通过湮灭T态来促进系间窜越进一步的发生吧?)

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发表于 Post on 2024-7-13 14:11:37 | 只看该作者 Only view this author
各位老师好:如何查看用Gaussian 09计算的T1 state的能量?
我将基态优化后的结果使用0 3的方法计算了分子三重态的能量,但无法从log文件里找到相应的三重态的能量值。
因此想询问各位大佬如何查看T1的能量,不胜感激。

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发表于 Post on 2024-7-13 15:13:10 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2024-7-9 22:54
空行的数目不对吧

在最后写完基组SDD下面的****下空了一行写的eps, 老师

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发表于 Post on 2024-7-13 16:12:44 | 只看该作者 Only view this author
千面追风 发表于 2024-7-13 07:11
各位老师好:如何查看用Gaussian 09计算的T1 state的能量?
我将基态优化后的结果使用0 3的方法计算了分子 ...

仔细阅读https://mattermodeling.stackexch ... -triplets/9357#9357了解怎么算T1
Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员
Google Scholar: https://scholar.google.com/citations?hl=zh-CN&user=XW6C6eQAAAAJ&view_op=list_works&sortby=pubdate
ORCID: https://orcid.org/0000-0002-4540-8734
主页:http://www.qitcs.qd.sdu.edu.cn/info/1034/1702.htm
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