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楼主 Author: sobereva
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[综合交流] 简单量子化学问题答疑专帖

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发表于 Post on 2024-12-27 11:08:49 | 只看该作者 Only view this author

使用ocra计算soc

正在重复文献,soc的计算让我费解
这是我的输入文件
!B3LYP/G 6-31g(d,p) opt freq  tightscf grid4 gridx4 noautostart miniprint nopop
%pal nproc 20 end
%maxcore 2000
end
%tddft nroots 8
dosoc true
tda false
printlevel 3
end
* xyz 0 1




Gaussian 16:  ES64L-G16RevA.03 25-Dec-2016
                27-Dec-2024
******************************************
%pal nprocs 20 end
Error parsing percent card:
QPErr --- A syntax error was detected in the input line.
%pal nprocs 20 end
  '
Last state= ""
TCursr=       938 LCursr=         1
Error termination via Lnk1e in /home/dell/apps/g16/l1.exe at Fri Dec 27 05:45:27 2024.
Job cpu time:       0 days  0 hours  0 minutes  0.0 seconds.
Elapsed time:       0 days  0 hours  0 minutes  0.0 seconds.
File lengths (MBytes):  RWF=      0 Int=      0 D2E=      0 Chk=      0 Scr=      0


一直显示输入错误 请问各位老师,我应该如何改正。

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发表于 Post on 2024-12-27 11:22:07 | 只看该作者 Only view this author
先不讨论计算关键词的合理性,你怎么把orca的输入文件丢给Gaussian去了。。。

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4068#
发表于 Post on 2024-12-27 11:27:55 | 只看该作者 Only view this author
wxsxjj 发表于 2024-12-27 11:22
先不讨论计算关键词的合理性,你怎么把orca的输入文件丢给Gaussian去了。。。

加一,先把程序搞清楚吧

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发表于 Post on 2024-12-27 11:43:28 | 只看该作者 Only view this author
量化小王子 发表于 2024-12-27 11:27
加一,先把程序搞清楚吧

好的 老师

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4070#
发表于 Post on 2024-12-27 11:43:50 | 只看该作者 Only view this author
量化小王子 发表于 2024-12-27 11:27
加一,先把程序搞清楚吧

好的 老师

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发表于 Post on 2024-12-28 15:56:21 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2024-12-5 19:59
明显是显示问题
和波函数分析有关的简单问题要发到1L提到的波函数分析答疑专贴里

嗯嗯好的  谢谢老师 下次注意

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迷茫的本科生一枚

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发表于 Post on 2024-12-28 17:27:19 | 只看该作者 Only view this author

求助orca用TD-DFT方法跑AIMD报错,搜了下论坛只有一个帖子报错一致,但我尝试了帖子里的解决方法把#restart ifexists  # Continue MD by reading [basename].mdrestart if it exists. In this case "initvel" should be commented删了,还是报错如图1
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发表于 Post on 2024-12-28 17:38:59 | 只看该作者 Only view this author
2877321934 发表于 2024-12-28 10:27
求助orca用TD-DFT方法跑AIMD报错,搜了下论坛只有一个帖子报错一致,但我尝试了帖子里的解决方法把#resta ...

看*.int.log、*.scf.log这两个文件的最后几十行,分析报错原因
Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员
Google Scholar: https://scholar.google.com/citations?hl=zh-CN&user=XW6C6eQAAAAJ&view_op=list_works&sortby=pubdate
ORCID: https://orcid.org/0000-0002-4540-8734
主页:http://www.qitcs.qd.sdu.edu.cn/info/1034/1702.htm
本团队长期招收研究生,有意者可私信联系

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迷茫的本科生一枚

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发表于 Post on 2024-12-28 19:44:54 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2024-12-28 17:38
看*.int.log、*.scf.log这两个文件的最后几十行,分析报错原因

谢谢老师的回复,我是在服务器上提交的计算,但是已提交服务器就显示计算完成而非错误,而且并没有生成int.log和.scf.log文件,由于我是第一次用orca跑AIMD,我也不太懂是什么导致的
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发表于 Post on 2024-12-29 04:19:29 | 只看该作者 Only view this author
2877321934 发表于 2024-12-28 12:44
谢谢老师的回复,我是在服务器上提交的计算,但是已提交服务器就显示计算完成而非错误,而且并没有生成in ...

看一下是不是你指定的maxcore太大了
Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员
Google Scholar: https://scholar.google.com/citations?hl=zh-CN&user=XW6C6eQAAAAJ&view_op=list_works&sortby=pubdate
ORCID: https://orcid.org/0000-0002-4540-8734
主页:http://www.qitcs.qd.sdu.edu.cn/info/1034/1702.htm
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发表于 Post on 2024-12-29 16:01:21 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 2877321934 于 2024-12-29 17:12 编辑
wzkchem5 发表于 2024-12-29 04:19
看一下是不是你指定的maxcore太大了

这个问题已解决,能成功生成.int.log和scf.log了,但是又有新的问题, ,看了下输出文件应该是内存爆了,以Maximum memory used throughout the entire LEANSCF-calculation: 104.6 MB结尾,服务器为56核心,256G内存,我使用的内存分配是56核心*4000MB算70个原子,应该是够用的,试了下用28或者16核心,每个核心分配4000MB,也是一样爆,我翻阅了一下您之前的解答 ,openmpi安装应该没问题,.bashrc写对的,请问可能是什么原因呢?
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发表于 Post on 2024-12-29 16:37:33 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 2877321934 于 2024-12-29 16:45 编辑
2877321934 发表于 2024-12-29 16:01
这个问题已解决,能成功生成.int.log和scf.log了,但是又有新的问题,,我翻阅了一下您之前的解答,确保o ...

补充一下,这是我在服务器上检查MPI库的结果,请问老师,这样说明openmpi安装没问题吧 ,不过我是先安装的ORCA,然后发现MPI有问题再重新安装了正确的版本
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发表于 Post on 2024-12-29 17:31:14 | 只看该作者 Only view this author
2877321934 发表于 2024-12-29 09:37
补充一下,这是我在服务器上检查MPI库的结果,请问老师,这样说明openmpi安装没问题吧,不过我是先安装的 ...

同一台服务器并行跑小分子的单点能或梯度,会遇到这个问题吗?
Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员
Google Scholar: https://scholar.google.com/citations?hl=zh-CN&user=XW6C6eQAAAAJ&view_op=list_works&sortby=pubdate
ORCID: https://orcid.org/0000-0002-4540-8734
主页:http://www.qitcs.qd.sdu.edu.cn/info/1034/1702.htm
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发表于 Post on 2024-12-29 17:31:46 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2024-12-29 17:31
同一台服务器并行跑小分子的单点能或梯度,会遇到这个问题吗?

谢谢老师的回复,我去测试一下
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发表于 Post on 2024-12-29 17:58:23 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 2877321934 于 2024-12-29 18:05 编辑
wzkchem5 发表于 2024-12-29 17:31
同一台服务器并行跑小分子的单点能或梯度,会遇到这个问题吗?

试着跑了下苯环的单点,好像没什么问题,图一为输入文件,图二,三为输出
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