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楼主 Author: sobereva
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[综合交流] 简单量子化学问题答疑专帖

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发表于 Post on 2024-12-11 16:22:03 | 只看该作者 Only view this author
l9999大概率是优化到指定步数后仍然没有收敛,你可以把输出文件再往前翻一点就能看到原因

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发表于 Post on 2024-12-11 20:23:06 | 只看该作者 Only view this author
你可以看看结构,如果变成反应物或者产物了,可能说明过渡态没找好
今古北邙山下路,黄尘老尽英雄。
人生长恨水长东。
幽怀谁共语,远目送归鸿。
盖世功名将底用,从前错怨天公。
浩歌一曲酒千钟。
男儿行处是,未要论穷通。

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-12-11 21:49:51 | 只看该作者 Only view this author
Adele_zhang 发表于 2024-12-11 15:40
做过渡态搜索总是出现这样的问题,但是看结果也没有发生震荡:
Error termination request processed by  ...

cartesian和gdiis根本没法一起用
对于优化过渡态notrust本身就是默认的,没必要写
初始结构明显太烂,Cl的半径那么大,哪能和H才0.7埃多,严重缺乏找过渡态的基本常识

北京科音初级量子化学培训班(http://www.keinsci.com/KEQC)里给了巨量找过渡态的例子和很详细的讲解,缺乏经验和常识的话建议系统性学学
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-12-11 21:55:10 | 只看该作者 Only view this author
15670538028 发表于 2024-12-11 11:17
老师好,体系中含有两个过剩电子,在做T态反应路径B---C, 发现B结构的T态优化后再算单点的能量E(BT)   低于 ...

只能说B的三重态极小点结构下B的基态是三重态
并且guess=mix不保证能得到基态,必须说清楚stable任务提示了什么
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发表于 Post on 2024-12-11 22:43:16 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2024-12-11 21:55
只能说B的三重态极小点结构下B的基态是三重态
并且guess=mix不保证能得到基态,必须说清楚stable任务提 ...

谢谢老师的答复,上述提及的单重态都是经guess=mix,显示S**2=0,并且经stable关键词显示波函数是稳定的。还有点不清楚的是  上述是想算加入两个过剩电子后包合物B中发生的反应(考虑可能发生电子态转变),先算出T态时反应路径B经能垒生成C,然后算单态反应路径时发现,B在单态时优化直接变成结构Y,Y经一定能垒生成中间体结构Z。而Y,Z能量是低于B,C的,那反应物B中反应是直接在单态下进行(  B(不稳定单态)---Y---Z?)  还是反应过程中由T态转变为单态呢(B(T态)--电子态转变---Y---Z)?

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发表于 Post on 2024-12-16 19:12:04 | 只看该作者 Only view this author

高斯计算报错

高斯计算时候出现问题,请问是什么情况导致的呢?谢谢大家

202412161911169200..png (803.17 KB, 下载次数 Times of downloads: 0)

202412161911169200..png

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发表于 Post on 2024-12-16 20:08:45 | 只看该作者 Only view this author
没有看到错误信息,而且看右图,任务被杀掉了,不知道啥情况

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-12-17 05:34:02 | 只看该作者 Only view this author
张晓婷 发表于 2024-12-16 19:12
高斯计算时候出现问题,请问是什么情况导致的呢?谢谢大家

左边根本不是报错提示

程序被杀掉是其他原因,诸如内存分配量超了等等,没更多细节没法说,怀疑运行环境有问题就去咨询管理员
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发表于 Post on 2024-12-17 10:39:39 | 只看该作者 Only view this author
大佬们,请问,电荷传递和电子激发,跃迁什么关系呀?比如聚苯胺具有导电性,原理是离域的pi电子进行电荷传递,这个过程是什么电子激发或者跃迁吗?还有金属铜导电,好像是电子很容易挣脱束缚变成游离的电子进行电荷传递,那这个过程是是激发吗?

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发表于 Post on 2024-12-17 10:48:40 | 只看该作者 Only view this author
现在molclus程序的isostat能量排序依据是电子能量+吉布斯自由能校正能,请问怎样才能把能量排序依据修改为电子能量

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-12-17 11:33:20 | 只看该作者 Only view this author
Xiaol 发表于 2024-12-17 10:48
现在molclus程序的isostat能量排序依据是电子能量+吉布斯自由能校正能,请问怎样才能把能量排序依据修改为 ...

不做振动分析,isomers.xyz里写入的就是电子能量。如果已经做了振动分析,那没办法
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-12-17 11:35:03 | 只看该作者 Only view this author
WOOOOWOOOO 发表于 2024-12-17 10:39
大佬们,请问,电荷传递和电子激发,跃迁什么关系呀?比如聚苯胺具有导电性,原理是离域的pi电子进行电荷传 ...

这和量子化学研究的电子激发是两码事

参考北京科音CP2K第一性原理计算培训班(http://www.keinsci.com/KFP)的幻灯片:

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发表于 Post on 2024-12-17 11:41:44 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2024-12-17 11:35
这和量子化学研究的电子激发是两码事

参考北京科音CP2K第一性原理计算培训班(http://www.keinsci.com ...

sober,我最近用pi-pi堆叠原理做了一个电荷传递的研究,我的想法是pi电子是离域的,在形成pi-pi堆叠时,离域的pi电子向分子转移。来自外加电场的电荷也通过这个通道进行电荷传递。我这个说法对吗?

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-12-17 12:25:17 | 只看该作者 Only view this author
WOOOOWOOOO 发表于 2024-12-17 11:41
sober,我最近用pi-pi堆叠原理做了一个电荷传递的研究,我的想法是pi电子是离域的,在形成pi-pi堆叠时, ...

分子间电荷转移可以通过Marcus理论讨论,需要做电子转移积分的计算。公社论坛里搜相关信息
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发表于 Post on 2024-12-17 14:10:38 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2024-12-17 11:33
不做振动分析,isomers.xyz里写入的就是电子能量。如果已经做了振动分析,那没办法

谢谢社长,那我用molclus优化好的isomers.xyz重新作为输入结构算一遍单点能,这样就把单点能校正顺便做了

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