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楼主 Author: sobereva
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[综合交流] 简单量子化学问题答疑专帖(旧版,已关帖)

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发表于 Post on 2022-6-20 19:05:37 | 只看该作者 Only view this author
WOOOOWOOOO 发表于 2022-6-20 11:43
请问,我验证一个过渡态的波函数的稳定性时出现了SCF不收敛,这意味着我的波函数不稳定对吗?

只有收敛的波函数才有稳定和不稳定的分别。所以如果SCF不收敛,必须先让SCF收敛,然后做稳定性分析,光是SCF不收敛这一点无法得出任何关于波函数稳定性的结论。
Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员
Google Scholar: https://scholar.google.com/citations?user=XW6C6eQAAAAJ
ORCID: https://orcid.org/0000-0002-4540-8734
主页:http://www.qitcs.qd.sdu.edu.cn/info/1133/1776.htm
GitHub:https://github.com/wzkchem5
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发表于 Post on 2022-6-20 19:12:58 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2022-6-20 19:05
只有收敛的波函数才有稳定和不稳定的分别。所以如果SCF不收敛,必须先让SCF收敛,然后做稳定性分析,光是 ...

谢谢大佬,再多问一下。①SCF和波函数是什么关系呀,这方面的知识有帖子给推荐下吗?②我过渡态的振动趋势是我想要的,但是计算单点能和验证波函数都出现了SCF不收敛,那这个过渡态是正确的吗?

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发表于 Post on 2022-6-20 20:25:48 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2022-6-20 19:04
所以如果做TDDFT单点计算算发射光谱,不能直接写个td就算,要额外加关键词来指定平衡溶剂。因为你是单点 ...

好的,感谢老师~

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15784#
发表于 Post on 2022-6-20 21:49:48 | 只看该作者 Only view this author

高斯09极化率计算

Gaussian 09:  ES64L-G09RevD.01 24-Apr-2013
                20-Jun-2022
******************************************
%chk=polar-def.chk
%mem=3000MW
---------------------------
#p B3LYP/def2SVPD opt Polar
---------------------------
QPErr --- A syntax error was detected in the input line.
#p B3LYP/def2SVPD opt Polar
          '
Last state= "GCL"
TCursr=      3523 LCursr=         9
Error termination via Lnk1e in /share/apps/g09/l1.exe at Mon Jun 20 21:38:29 2022.
Job cpu time:       0 days  0 hours  0 minutes  0.1 seconds.
File lengths (MBytes):  RWF=     12 Int=      0 D2E=      0 Chk=      2 Scr=      2


或者把#p B3LYP/def2SVPD opt Polar改成#p M062X/def2SVPD opt Polar 均报错,不知道是为什么。计算的是有机D-A分子,想算极化率,组内没有人算过这个关键词,可以请教泛函和基组的使用方法吗。谢谢老师

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发表于 Post on 2022-6-20 21:55:26 | 只看该作者 Only view this author
高斯没有内置def2svpd基组

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发表于 Post on 2022-6-20 21:59:51 | 只看该作者 Only view this author
WOOOOWOOOO 发表于 2022-6-20 12:12
谢谢大佬,再多问一下。①SCF和波函数是什么关系呀,这方面的知识有帖子给推荐下吗?②我过渡态的振动趋 ...

(1)随便找一本量化教材看看,网上也有很多
(2)结果不能用,必须把SCF收敛了,而且波函数是稳定的,结果才能用

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WOOOOWOOOO + 2 谢谢

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Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
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Google Scholar: https://scholar.google.com/citations?user=XW6C6eQAAAAJ
ORCID: https://orcid.org/0000-0002-4540-8734
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-6-20 22:03:40 | 只看该作者 Only view this author
yirantian 发表于 2022-6-20 21:49
Gaussian 09:  ES64L-G09RevD.01 24-Apr-2013
                20-Jun-2022
************************* ...

自己去BSE基组库拷定义使用
详解Gaussian中混合基组、自定义基组和赝势基组的输入
http://sobereva.com/60

opt和polar甭一起用
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-6-20 22:07:21 | 只看该作者 Only view this author
chennanjie 发表于 2022-6-20 16:03
可能是我找文献的方法不对,但是我真的不怎么会这么精确的找到谁做过TTF或者衍生物的分子轨道这种。
我 ...

也建议用Google学术,搜索功能更强大。我搜文献一律用Google学术
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
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发表于 Post on 2022-6-21 10:39:35 | 只看该作者 Only view this author
请问我做一个过渡金属配合物体系,用PBE0-D3BJ做opt freq,MN15算单点能是一个合理的选择吗?

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发表于 Post on 2022-6-21 10:58:13 | 只看该作者 Only view this author
Lucas_xin 发表于 2022-6-21 10:39
请问我做一个过渡金属配合物体系,用PBE0-D3BJ做opt freq,MN15算单点能是一个合理的选择吗?

说具体一些,第几周期的过渡金属,过渡金属是单核还是多核,有没有过渡金属与过渡金属成的键,一共多少个原子。过渡金属是开壳层还是闭壳层。

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发表于 Post on 2022-6-21 11:08:41 | 只看该作者 Only view this author
snljty2 发表于 2022-6-21 10:58
说具体一些,第几周期的过渡金属,过渡金属是单核还是多核,有没有过渡金属与过渡金属成的键,一共多少个 ...

是Pd,没有金属之间成键,就是做能垒计算,原子数的话因为配体比较大会有100多个原子

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发表于 Post on 2022-6-21 11:21:37 | 只看该作者 Only view this author

Resp电荷计算gaussion优化遇到的问题

本帖最后由 yuyao_yang 于 2022-6-21 12:20 编辑

算Resp电荷时,用Gaussian优化时
B3LYP/def2SVP em=GD3BJ scrf(solvent=water) opt
这里的solvent=water 用其它溶剂会有影响吗?有必要换吗?

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15793#
发表于 Post on 2022-6-21 13:01:20 | 只看该作者 Only view this author
请问老师,使用molclus+Gaussian做构型搜索优化,得到的能量最低的构型,还有必要在同等基组的级别下单独使用Gaussian再做一次优化吗?
谢谢老师

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天上地下三山亖海五湖六合八荒九州之泛粤大典編輯委員會編外委員

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发表于 Post on 2022-6-21 14:00:11 | 只看该作者 Only view this author
忘不掉的回忆 发表于 2022-6-21 13:01
请问老师,使用molclus+Gaussian做构型搜索优化,得到的能量最低的构型,还有必要在同等基组的级别下单独使 ...

如果优化结果收敛,不用在同等级别下再一次优化。但是可以将优化后的结构提取出来,在更高的级别上继续优化。
ORCA大法好!CP2K大法好!
嶺南粤音 泛粤典 https://jyutjam.org/

山河自落蒼梧月,風雨猶驅草木兵。
san huɔɞ ki lɔk tʰɔŋ ŋ ᵑgut,fʊŋ ʝi ʝiu kʰui tʰɔu ᵐbʊk pɪŋ

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发表于 Post on 2022-6-21 14:06:48 | 只看该作者 Only view this author
chands 发表于 2022-6-21 14:00
如果优化结果收敛,不用在同等级别下再一次优化。但是可以将优化后的结构提取出来,在更高的级别上继续优 ...

谢谢老师

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