简单量子化学问题答疑专帖（旧版，已关帖）

Lucas_xin · 发表于 Post on 2022-6-21 10:39:35

请问我做一个过渡金属配合物体系，用PBE0-D3BJ做opt freq，MN15算单点能是一个合理的选择吗？

snljty2 · 发表于 Post on 2022-6-21 10:58:13

Lucas_xin 发表于 2022-6-21 10:39
请问我做一个过渡金属配合物体系，用PBE0-D3BJ做opt freq，MN15算单点能是一个合理的选择吗？

说具体一些，第几周期的过渡金属，过渡金属是单核还是多核，有没有过渡金属与过渡金属成的键，一共多少个原子。过渡金属是开壳层还是闭壳层。

Lucas_xin · 发表于 Post on 2022-6-21 11:08:41

snljty2 发表于 2022-6-21 10:58
说具体一些，第几周期的过渡金属，过渡金属是单核还是多核，有没有过渡金属与过渡金属成的键，一共多少个 ...

是Pd，没有金属之间成键，就是做能垒计算，原子数的话因为配体比较大会有100多个原子

yuyao_yang · 发表于 Post on 2022-6-21 11:21:37

本帖最后由 yuyao_yang 于 2022-6-21 12:20 编辑

算Resp电荷时，用Gaussian优化时
B3LYP/def2SVP em=GD3BJ scrf(solvent=water) opt
这里的solvent=water 用其它溶剂会有影响吗？有必要换吗？

忘不掉的回忆 · 发表于 Post on 2022-6-21 13:01:20

请问老师，使用molclus+Gaussian做构型搜索优化，得到的能量最低的构型，还有必要在同等基组的级别下单独使用Gaussian再做一次优化吗？
谢谢老师

chands · 发表于 Post on 2022-6-21 14:00:11

忘不掉的回忆发表于 2022-6-21 13:01
请问老师，使用molclus+Gaussian做构型搜索优化，得到的能量最低的构型，还有必要在同等基组的级别下单独使 ...

如果优化结果收敛，不用在同等级别下再一次优化。但是可以将优化后的结构提取出来，在更高的级别上继续优化。

忘不掉的回忆 · 发表于 Post on 2022-6-21 14:06:48

chands 发表于 2022-6-21 14:00
如果优化结果收敛，不用在同等级别下再一次优化。但是可以将优化后的结构提取出来，在更高的级别上继续优 ...

谢谢老师

wzkchem5 · 发表于 Post on 2022-6-21 15:17:36

你如果研究非水相过程，就换非水溶剂。如果是水相过程，就没有任何道理换其他溶剂了

Elden、Lord · 发表于 Post on 2022-6-21 15:33:02

本帖最后由 Elden、Lord 于 2022-6-21 15:34 编辑

请问各位老师，有没有软件能做可旋转二面角的力场参数，而且能符合图中的QME曲线。

WOOOOWOOOO · 发表于 Post on 2022-6-21 15:38:13

请问，反应物和过渡态自旋多重度不一样，IRC要怎么跑？

wzkchem5 · 发表于 Post on 2022-6-21 16:05:40

本帖最后由 wzkchem5 于 2022-6-21 09:07 编辑

WOOOOWOOOO 发表于 2022-6-21 08:38
请问，反应物和过渡态自旋多重度不一样，IRC要怎么跑？

按过渡态的自旋多重度跑。与此同时找到反应的MECP结构，一般来说MECP会在IRC上，然后从MECP开始按反应物自旋多重度跑downhill的IRC。两段IRC接起来就是完整的IRC。
以上是假设ISC比反应快。如果ISC比反应慢的话，说明反应物从初始自旋多重度ISC到过渡态自旋多重度是决速步，此时按过渡态自旋多重度把IRC跑到头就行了。

weifujing · 发表于 Post on 2022-6-21 17:05:58

取7个阿司匹林分子作为分子团簇，只优化H原子，不优化其他分子，采用D3色散修正，gjf输入文件附在附件里
优化过程一直停留在 Petite list used in FoFCou.
Requested convergence on RMS density matrix=1.00D-08 within 128 cycles.
Requested convergence on MAX density matrix=1.00D-06.
Requested convergence on energy=1.00D-06.
No special actions if energy rises.
Integral accuracy reduced to 1.0D-05 until final iterations.
Initial convergence to 1.0D-05 achieved. Increase integral accuracy.
请问如何解决

WOOOOWOOOO · 发表于 Post on 2022-6-21 17:19:23

本帖最后由 WOOOOWOOOO 于 2022-6-21 17:22 编辑

wzkchem5 发表于 2022-6-21 16:05
按过渡态的自旋多重度跑。与此同时找到反应的MECP结构，一般来说MECP会在IRC上，然后从MECP开始按反应物 ...

谢谢大佬！我的反应物如下图，氧气为三重态，发生一个加成反应。请问这个过程从自旋多重度由4到2快吗？怎么判断哩。我算了下用过渡态的自旋多重度跑出来两边一样的，都是产物的形态。

coolrainbow · 发表于 Post on 2022-6-21 17:23:42

4个核，115原子，311基祖，只能慢慢等着了

sobereva · 发表于 Post on 2022-6-21 17:48:24

CPU太烂，体系太大，而且还不用#P监控迭代过程，显然仿佛卡住似的

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[综合交流] 简单量子化学问题答疑专帖（旧版，已关帖）

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