简单量子化学问题答疑专帖（旧版，已关帖）

sobereva · 发表于 Post on 2022-11-20 14:01:55

Yjc 发表于 2022-11-20 13:59
谢谢社长回复！我还有一个疑问想请教您的，高斯在量化计算时看的初始条件是原子间的相对位置，那我在建模 ...

gview建模过程中键的类型对初始键长的影响对于优化过程的耗时造成的差异可以忽略不计

Yjc · 发表于 Post on 2022-11-20 14:03:41

嗯嗯好的，感谢社长的耐心解答，非常感谢您！

sobereva · 发表于 Post on 2022-11-20 14:13:09

大头攒毛发表于 2022-11-20 11:16
大家好，我在用gauss进行几何优化时，log文件报错了，请问大家，为什么会出现这种情况？下面是我附上的gjf ...

以后有问题先用公社论坛首页google框搜索再问，避免问老生常谈回复过无数次的问题

ccx · 发表于 Post on 2022-11-20 14:31:19

我想计算四氟硼酸锌与丙烯酸之间的结合能，如何用gaus构建四氟硼酸锌结构并对其进行优化——计算小白

sobereva · 发表于 Post on 2022-11-20 14:44:22

ccx 发表于 2022-11-20 14:31
我想计算四氟硼酸锌与丙烯酸之间的结合能，如何用gaus构建四氟硼酸锌结构并对其进行优化——计算小白

gview画结构，保存gjf文件，填恰当关键词就完了，诸如# PBE1PBE/6-311G* opt

如果完全0基础，对计算和建模完全没概念，建议参加北京科音初级量子化学培训班（http://www.keinsci.com/workshop/KEQC_content.html）从头开始系统性完整学习一遍。这不是网上远程几句话能教明白的。

大头攒毛 · 发表于 Post on 2022-11-20 14:58:43

sobereva 发表于 2022-11-20 14:13
以后有问题先用公社论坛首页google框搜索再问，避免问老生常谈回复过无数次的问题

谢谢sob老师，之后我一定注意

shanshan007 · 发表于 Post on 2022-11-20 20:11:34

本帖最后由 shanshan007 于 2022-11-20 20:35 编辑

sob老师好，我要用Gaussian做Co3O4的优化和频率分析，算有其参与的反应的gibbs自由能变。但是这种是晶体的物质，分子结构应该怎么画才合适呢？另外就是，我做的是钴酸锂的热解过程，选用B3LYP和6-31G(d)基组，主要是考虑计算资源有限，这么选ok吗？谢谢老师

wzkchem5 · 发表于 Post on 2022-11-21 00:13:55

shanshan007 发表于 2022-11-20 13:11
sob老师好，我要用Gaussian做Co3O4的优化和频率分析，算有其参与的反应的gibbs自由能变。但是这种是晶体的 ...

需要用VASP、QE等周期性程序算，高斯算不了。
注意用DFT+U

Lithium · 发表于 Post on 2022-11-21 03:07:54

sobereva 发表于 2022-11-17 16:06
Gaussian能算，但体系很大，没有很好的计算资源的话很难算得动
ORCA做也可以，TDDFT利用RIJCOSX比Gaussi ...

sob老师谢谢您之前的回复，我看了您用cp2k计算周期性体系紫外光谱的文章，我试了一下您的文件，可以正常运行。我现在想尝试用cp2k来计算这个结构，一个cif文件大概有上千个原子，按照您的步骤生成inp文件，但是在运行时报错了，所以我想问您，首先还是能不能运行，如果能运行，计算量会很高吗？对于镧系元素应当选取哪一种赝势？

wzkchem5 · 发表于 Post on 2022-11-21 03:29:52

Lithium 发表于 2022-11-20 20:07
sob老师谢谢您之前的回复，我看了您用cp2k计算周期性体系紫外光谱的文章，我试了一下您的文件，可以正常 ...

但凡问报错的问题，一定要给出详细的报错信息，以及完整的输入输出文件

Mr.zhen · 发表于 Post on 2022-11-21 13:04:55

请问大家，在用ts法寻找过渡态时，查看优化过程的能量发现是逐渐降低的，和结构优化过程一样，不过过渡态不应该是反应过程中的能量最高点吗？为什么找的还是能量最低的结构

好兄弟 · 发表于 Post on 2022-11-21 14:48:04

请问用orca计算两个态之间的socme应该用初态结构坐标而不是末态对吗？我想分别求s1到t1-t5的系间窜越速率，需要s1分别和t1-t5的socme，我是不是只需要将s1的xyz文件作为初始结构，nroots设为5以上进行一次socme的计算就可以得到s1和t1-t5的五个socme了？

wzkchem5 · 发表于 Post on 2022-11-21 15:33:22

Mr.zhen 发表于 2022-11-21 06:04
请问大家，在用ts法寻找过渡态时，查看优化过程的能量发现是逐渐降低的，和结构优化过程一样，不过过渡态不 ...

过渡态是反应路径上的最高点，但是是垂直于反应路径的方向上的最低点。如果初猜结构不在反应路径上，那么能量未必升高

wzkchem5 · 发表于 Post on 2022-11-21 15:34:26

好兄弟发表于 2022-11-21 07:48
请问用orca计算两个态之间的socme应该用初态结构坐标而不是末态对吗？我想分别求s1到t1-t5的系间窜越速率， ...

计算SOCME需要用什么结构不是唯一确定的，和你用SOCME做什么事情有关。研究ISC、RISC、SOC校正的吸收光谱等，需要的结构都是不一样的。具体在这个论坛搜，我以前回答过

Mr.zhen · 发表于 Post on 2022-11-21 15:46:18

wzkchem5 发表于 2022-11-21 15:33
过渡态是反应路径上的最高点，但是是垂直于反应路径的方向上的最低点。如果初猜结构不在反应路径上，那么 ...

谢谢老师，那么如果我发现我的ts过程是能量下降的，是说明我的初猜不对需要进行改变吗？改变至ts过程变为能量上升为止。不过opt关键词是不是只会降低能量呢

		自动登录 Automatic login	找回密码 Forget password
密码 Password			注册 Register

[综合交流] 简单量子化学问题答疑专帖（旧版，已关帖）