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楼主 Author: sobereva
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[综合交流] 简单量子化学问题答疑专帖(旧版,已关帖)

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发表于 Post on 2022-11-21 16:28:56 | 只看该作者 Only view this author
Mr.zhen 发表于 2022-11-21 08:46
谢谢老师,那么如果我发现我的ts过程是能量下降的,是说明我的初猜不对需要进行改变吗?改变至ts过程变为 ...

不是。过渡态优化不需要初猜在反应路径上,只需要收敛的结构在反应路径上就行了。但是要确定是在你要的反应路径上,不是在另外某个不相关的反应的路径上。
一般情况下opt收敛的结构能量低于初始结构,但是优化过程中很可能暂时变得比初始结构能量还高。此外极个别情况下,因为优化的步长迈大了,跑到了临近一个更高的局部极小值点附近,可能会导致收敛的结构能量高于初始结构,此时应该缩小步长重新优化。
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员

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发表于 Post on 2022-11-21 16:47:29 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2022-11-19 22:51
说具体gview和Gaussian版本
别用太老的gview

老师GaussView 6.0.16,Gaussian 16, Revision B.01

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发表于 Post on 2022-11-21 17:06:53 | 只看该作者 Only view this author
请问各位老师,我想要通过黄昆因子的大小去讨论磷光发射光谱最强发射峰和0-0峰之间存在的位移,根据文献了解到S越大,位移越大,导致最强发射峰相较于0-0跃迁的红移越大,所以我想知道是应该考虑体系所有振动模式的黄昆因子的和,还是最强振动模式所对应的黄昆因子呢?

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发表于 Post on 2022-11-21 20:43:26 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2022-11-21 15:34
计算SOCME需要用什么结构不是唯一确定的,和你用SOCME做什么事情有关。研究ISC、RISC、SOC校正的吸收光谱 ...

好的我去找找,谢谢wzk老师

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发表于 Post on 2022-11-22 10:58:34 | 只看该作者 Only view this author
Sob老师您好,我正在计算一个关于氢负离子转移的反应,已经找到该反应的过渡态并计算出了此过渡态的路径扫描irc.out文件。
我想要对irc.out里的其中一个点的结构做NBO电荷分析。
我可以选中保存irc.out里的某个点后 直接去做NBO的计算吗?
道友请留步

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发表于 Post on 2022-11-22 12:27:29 | 只看该作者 Only view this author

高斯TD计算出现负波长,是什么问题,该如何解决

如题,下面附上输入文件和输出文件


7mr-bi-td-input.gjf

2.17 KB, 下载次数 Times of downloads: 1

7mrbi-td-1.out

252.64 KB, 下载次数 Times of downloads: 1

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发表于 Post on 2022-11-22 14:47:53 | 只看该作者 Only view this author
无需另开新帖,老生常谈的问题,论坛上已有大量相关帖子,一搜就有,随便看几个就明白了
https://cn.bing.com/search?q=sit ... p;ghacc=0&ghpl=
自动做多参考态计算的程序MOKIT

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发表于 Post on 2022-11-22 16:19:38 | 只看该作者 Only view this author
各位老师好,请问如果想从原有chk文件中读取坐标,且要保留这个chk文件,关键词是否可以这么写:“geom=check %oldchk=原来chk文件地址 chk=新产生chk文件的地址”?肯请各位老师指教,谢谢!
坚信J曲线的力量,永远做正确的事

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发表于 Post on 2022-11-22 16:26:10 | 只看该作者 Only view this author
Yjc 发表于 2022-11-22 16:19
各位老师好,请问如果想从原有chk文件中读取坐标,且要保留这个chk文件,关键词是否可以这么写:“geom=che ...

可以。注意要写 %chk=新产生chk文件(chk前加%)
ORCA大法好!算得快,还免费,我爷爷的爷爷都说不赖!
山河自落蒼梧月,風雨猶驅草木兵。
san huɔᵊ ki lɔk tʰɔŋ ŋ ᵑgut,fʊŋ ʝi ʝiu kʰui tʰɔu ᵐbʊk pɪŋ。

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发表于 Post on 2022-11-22 16:40:42 | 只看该作者 Only view this author
请问各位老师,我在高斯中用tddft的方法优化t2结构,t2的总电子能应该是log文件中最后一个SCF Done后的能量还是最后一个SCF Done的能量再加上第二个激发能的能量呢?

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发表于 Post on 2022-11-22 16:41:13 | 只看该作者 Only view this author
请问各位老师,我在高斯中用tddft的方法优化t2结构,t2的总电子能应该是log文件中最后一个SCF Done后的能量还是最后一个SCF Done的能量再加上第二个激发能的能量呢?

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发表于 Post on 2022-11-22 16:58:42 | 只看该作者 Only view this author
chands 发表于 2022-11-22 16:26
可以。注意要写 %chk=新产生chk文件(chk前加%)

嗯嗯明白了,感谢您的解答并且指出我的问题!
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发表于 Post on 2022-11-22 17:02:16 | 只看该作者 Only view this author
各位老师好,在卢老师的初级班讲义中讲到如果在gview中做过对称化而gaussian却没有判断对实际点群的情况。我有一个疑问,如何才能知道gaussian有没有正确判断点群呢?是需要等高斯输出out文件后才知道吗?谢谢!
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发表于 Post on 2022-11-22 23:39:42 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 lurensan 于 2022-11-22 23:50 编辑

老师好,使用sob老师推荐的双路2696v3服务器进行简单有机体系(100个原子以内)的DFT计算反应能垒。软件使用gaussian。一般选用什么方法和基组呢?有正负离子的情况下,使用B3LYP-D3(BJ)/6-311+G(d,p)优化结构,使用B3LYP-D3(BJ)/def2-TZVPP 计算能量可以吗?还是使用6-31G(d)优化结构,使用def2-TZVPP 计算能量也可以呢?(纯小白)
如果有过渡金属参与,又该怎样选择基组呢,需不需要使用赝势基组?



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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-11-23 00:29:43 | 只看该作者 Only view this author
zhuweirun 发表于 2022-11-22 12:27
如题,下面附上输入文件和输出文件

看17167L的回帖。以后有什么问题先用论坛首页google框搜索,所有常见问题肯定早就被讨论过了
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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