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楼主 Author: sobereva
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[综合交流] 简单量子化学问题答疑专帖(旧版,已关帖)

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发表于 Post on 2022-11-8 18:25:04 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2022-11-8 15:04
看看是不是有两个虚频都特别小(例如绝对值小于100cm^-1),被作者忽略了。如果是的话,作者的处理不严格 ...


老师你好,文献中虚频为-111.1,我重复出来是-109左右。振动是对的

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发表于 Post on 2022-11-8 18:29:52 | 只看该作者 Only view this author
lurensan 发表于 2022-11-8 11:25
老师你好,文献中虚频为-111.1,我重复出来是-109左右。振动是对的

那就是作者处理不严格,把小虚频忽略了。
至于优化不收敛,是因为高斯想把这两个小虚频消掉,但是消着消着结构可能就跑偏了。如果发现不管怎么试图把小虚频消掉,过渡态都会完全跑偏,那说明这个过渡态很可能不存在,也就是作者不该忽略那两个小虚频,这种情况下可以考虑跟作者发信argue一下。
Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员
Google Scholar: https://scholar.google.com/citations?user=XW6C6eQAAAAJ
ORCID: https://orcid.org/0000-0002-4540-8734
主页:http://www.qitcs.qd.sdu.edu.cn/info/1133/1776.htm
GitHub:https://github.com/wzkchem5
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发表于 Post on 2022-11-8 18:50:51 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2022-11-8 18:29
那就是作者处理不严格,把小虚频忽略了。
至于优化不收敛,是因为高斯想把这两个小虚频消掉,但是消着消 ...

好的老师,感谢老师指导

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发表于 Post on 2022-11-8 19:44:10 | 只看该作者 Only view this author
lurensan 发表于 2022-11-8 18:50
好的老师,感谢老师指导

会不会是作者用了非默认的积分格点但没说

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发表于 Post on 2022-11-8 20:15:36 | 只看该作者 Only view this author
请教各位老师,对于C4H8双自由基,如果想要利用molpro做一个CASPT2(2,2)计算的话,设置如下:basis=VTZ  
{hf;wf,32, irrep,0} (①单重态双自由基wf项中的第二项irrep,即波函的总对称性怎么写呢?)
{casscf;occ,17;closed,15;} (单重态双自由基,两个单电子,32-2=30,,3/2=15,故15个双占据轨道,closed设置15;occ=closed+活性轨道数目=17②这样理解正确吗?)
③{rs2c;occ,17;closed,15;orbital;maxit,500},麻烦各位老师看看,谢谢老师。

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发表于 Post on 2022-11-8 20:55:09 | 只看该作者 Only view this author
糖糖糖豆9988 发表于 2022-11-8 13:15
请教各位老师,对于C4H8双自由基,如果想要利用molpro做一个CASPT2(2,2)计算的话,设置如下:basis=VTZ  
...

对称性怎么写取决于你的C4H8双自由基的构象。分子属于C2v点群、C2h点群或者其他点群时,对称性相关的关键词的写法是截然不同的
Zikuan Wang
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发表于 Post on 2022-11-9 08:44:59 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2022-11-8 20:55
对称性怎么写取决于你的C4H8双自由基的构象。分子属于C2v点群、C2h点群或者其他点群时,对称性相关的关键 ...

老师,之前我只涉及过电荷与自旋多重度0 1的情况,所以wf 第二个参数写的是单电子所在的轨道不可约表示;现在对这种有俩单电子的双自由基(两个双自由基分别是属于C1和C2h点群;),①请问这两种点群的双自由基第二个参数如何设置呢?,第二个参数我就有点迷惑;而且这俩双自由基在结构优化的时候我没有在gview设置允许点群对称性。②为了在out文件有不可约表示,我是不是要勾选再做一次结构优化?谢谢老师

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-11-9 12:38:17 | 只看该作者 Only view this author
KCM@SHU 发表于 2022-11-8 17:33
老师我想问一下虚拟机和双系统那个会好一点呢?

有专门跑计算的机子就装实体linux,需要兼顾windows下程序的使用就虚拟机
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
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思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-11-9 12:39:41 | 只看该作者 Only view this author
好兄弟 发表于 2022-11-8 16:04
各位老师好,我用shermo计算能量,将计算频率没有优化结构的高斯log文件作为输入,setting.ini中的校正没有 ...

看不懂你的描述
振动分析任务只计算一次电子能量,哪有第一次和最后一次之分
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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发表于 Post on 2022-11-9 14:13:44 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2022-11-9 12:39
看不懂你的描述
振动分析任务只计算一次电子能量,哪有第一次和最后一次之分

嗯嗯我自己解决了,是我在一个提交文件中分成两次计算了所以输出了两次

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发表于 Post on 2022-11-9 14:32:22 | 只看该作者 Only view this author

求助高斯计算时混合溶剂如何定义

求助,高斯计算时,考虑溶剂化,溶剂为混合溶剂该如何描述?比如DMSO/DMF, v/v, 4/1的混合溶剂。

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发表于 Post on 2022-11-9 14:46:30 | 只看该作者 Only view this author
http://sobereva.com/327
1.5.2自定义溶剂和混合溶剂
ORCA大法好!CP2K大法好!
嶺南粤音 泛粤典 https://jyutjam.org/

山河自落蒼梧月,風雨猶驅草木兵。
san huɔɞ ki lɔk tʰɔŋ ŋ ᵑgut,fʊŋ ʝi ʝiu kʰui tʰɔu ᵐbʊk pɪŋ

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发表于 Post on 2022-11-9 15:03:21 | 只看该作者 Only view this author
请问我要计算磷光分子零场分裂能zfs是应该用基态结构还是激发态结构来计算?具体原因是什么呢?

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发表于 Post on 2022-11-9 15:21:02 | 只看该作者 Only view this author
好兄弟 发表于 2022-11-9 08:03
请问我要计算磷光分子零场分裂能zfs是应该用基态结构还是激发态结构来计算?具体原因是什么呢?

没有唯一答案,取决于你计算ZFS的目的。
例如,如果研究磷光或激发态EPR,又或者是RISC里面Boltzmann因子的贡献,应该用T1结构;如果为了研究SOC校正的吸收光谱,应该用S0结构。
Zikuan Wang
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-11-9 15:48:15 | 只看该作者 Only view this author
lizn 发表于 2022-11-9 14:32
求助,高斯计算时,考虑溶剂化,溶剂为混合溶剂该如何描述?比如DMSO/DMF, v/v, 4/1的混合溶剂。

看17046L
以后有什么问题都先用论坛首页google框搜索,如果找不到答案再问
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