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楼主 Author: sobereva
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[综合交流] 简单量子化学问题答疑专帖(旧版,已关帖)

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发表于 Post on 2016-7-11 11:41:24 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2016-7-11 11:27
没事甭用MP2,早就out了
选合适的泛函,速度快得多,精度更好
简谈量子化学计算中DFT泛函的选择

老师您好!是这样,我不是要用mp2算实际的体系。是出于理论上的原因,自己老板让我看用mp2算凝胶模型的过程。所以现在需要mp2理论的系统的入门级的书籍或者讲议。您有什么推荐吗?麻烦您了^_^

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2016-7-11 11:41:58 | 只看该作者 Only view this author
ygao_ustc 发表于 2016-7-11 11:40
老师您好!是这样,我不是要用mp2算实际的体系。是出于理论上的原因,自己老板让我看用mp2算凝胶模型的过 ...


随便找点外文量化书都会讲,比如Quantum Chemistry (Levine I N.)、Modern Quantum Chemistry(SZABO),都讲得很清楚
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
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发表于 Post on 2016-7-11 11:46:54 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2016-7-11 11:41
随便找点外文量化书都会讲,比如Quantum Chemistry (Levine I N.)、Modern Quantum Chemistry(SZABO), ...

非常感谢!

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发表于 Post on 2016-7-11 12:43:55 | 只看该作者 Only view this author
liyuanhe211 发表于 2016-7-11 11:13
在opt选项里加上noeigentest,没特殊情况不要用cartesian

多谢,老师,找过渡态或者结构优化 笛卡尔坐标不好找?

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发表于 Post on 2016-7-11 12:44:07 | 只看该作者 Only view this author

收到,多谢老师

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发表于 Post on 2016-7-11 13:10:43 | 只看该作者 Only view this author
小书童 发表于 2016-7-11 12:43
多谢,老师,找过渡态或者结构优化 笛卡尔坐标不好找?

优化是cartesian往往所需步骤比内坐标要多,且优化不收敛的概率增加。其只在几个原子形成直线,内坐标不适用的时候管事。

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发表于 Post on 2016-7-11 14:30:45 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2016-7-11 11:31
你得问你老板,毕竟通常不是能自己随意决定方向的。计算化学很杂,广度很大,很难给建议。反正如果自由研 ...

老板的意思就是自己决定,那我还是还按照您说的多看看文献吧,多谢老师啦。
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发表于 Post on 2016-7-11 15:13:36 | 只看该作者 Only view this author

如何由计算得到的分子轨道信息 画分子轨道图

利用高斯软件,采用ONIOM(QM/MM)方法做的激发态单点计算,其*.fchk文件里不含分子轨道信息,因此不能通过Gview或 Multiwfn等可视化工具看计算体系QM部分的轨道信息。

我想问的是,采用什么方法可以可视化的看QM/MM体系中QM部分的轨道图(HOMO,LUMO等),或者如何由计算输出的分子轨道系数等信息,画出分子轨道图,希望高手指点迷津,谢谢。

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发表于 Post on 2016-7-11 16:15:46 | 只看该作者 Only view this author
想请教sob老师一些问题,我今年刚本科毕业,之前毕设和参加学校的一些课题组接触过一些计算,我发现我特别喜欢这个方面,不想学的半懂,现在在看老师您推荐的赖文 的量化,找了很多资料,但总是感觉不得其门,老师您当年是咋学习的?希望老师给些建议。

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2016-7-11 17:28:11 | 只看该作者 Only view this author
小桥流水1102 发表于 2016-7-11 15:13
利用高斯软件,采用ONIOM(QM/MM)方法做的激发态单点计算,其*.fchk文件里不含分子轨道信息,因此不能通过Gv ...


自己把QM部分抠出来,边缘悬键处加氢,当普通体系计算单点,得到fch再绘图。
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2016-7-11 17:30:19 | 只看该作者 Only view this author
GAOFENG0026 发表于 2016-7-11 16:15
想请教sob老师一些问题,我今年刚本科毕业,之前毕设和参加学校的一些课题组接触过一些计算,我发现我特别 ...

多看书,多尝试,多思考,逐渐积累知识和经验
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liyuanhe211 发表于 2016-7-11 13:10
优化是cartesian往往所需步骤比内坐标要多,且优化不收敛的概率增加。其只在几个原子形成直线,内坐标不 ...

恩恩,多谢李老师的解答

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发表于 Post on 2016-7-11 19:08:03 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2016-7-11 17:28
自己把QM部分抠出来,边缘悬键处加氢,当普通体系计算单点,得到fch再绘图。

好的额,谢谢Sob老师。

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发表于 Post on 2016-7-11 22:50:51 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 superrice 于 2016-7-11 22:57 编辑

弱弱的问下,CIS具有大小一致性吗?如果是的话,ZINDO也具有吗?

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2016-7-12 06:42:40 | 只看该作者 Only view this author
superrice 发表于 2016-7-11 22:50
弱弱的问下,CIS具有大小一致性吗?如果是的话,ZINDO也具有吗?

截断的CI都不具有大小一致性,ZINDO也是一样(本质上就是半经验轨道上做CIS)
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