简单量子化学问题答疑专帖（旧版，已关帖）

dy19930508 · 发表于 Post on 2016-8-22 18:09:31

各位老师好，我想问一下基组def2-QZVPP(-g,-f)和def2-QZVPP之间较大的区别是什么呢？谢谢老师！

sobereva · 发表于 Post on 2016-8-23 12:03:25

前者就是把后者的g、f角动量函数给砍了以节约时间
DFT不需要角动量很高的基函数，而且高角动量基函数还会令计算量暴增，所以DFT（包括双杂化）计算时候把f、g角动量砍了没什么问题。

dy19930508 · 发表于 Post on 2016-8-23 15:59:38

sobereva 发表于 2016-8-23 12:03
前者就是把后者的g、f角动量函数给砍了以节约时间
DFT不需要角动量很高的基函数，而且高角动量基函数还会 ...

谢谢sob老师！

librakitty · 发表于 Post on 2016-8-23 23:46:03

老师，我想考察一下不同的反应物A和不同化合物B反应中，A和B结构对反应的影响。通过比较不同A、B的静电势和AILE，倒是能从反应活性的角度加以说明，但是我觉得还是有位阻作用影响的，于是就参照您的博文http://sobereva.com/68对不同AB的复合物（每种都取得各个反应通道中反应能垒最低的通道的复合物）进行了RDG函数等值面分析，但发现所有复合物等值面均是绿色的，参数设置和您的例子methanedimer几乎是一样的。老师，我严重怀疑我把哪里理解错了，麻烦您给予指导，谢谢老师。

摘星衬月 · 发表于 Post on 2016-8-24 09:19:52

大家好，我有一个问题不要请教大家，我用服务器的gaussian计算了一个构型的阴离子状态，得到了chk文件，转成fchk文件后，

想把电荷改成零，继续用windows下的gaussian计算，以便得到VDE的值，但为什么不能提交计算，一提交任务就出错？？

liyuanhe211 · 发表于 Post on 2016-8-24 09:34:45

又是出错出错出错，只说“出错了”、“LinkXXX报错”，而且连输入都没有，把Pople叫过来也没法确定你什么问题，还涉及这么多步骤不知道控制变量，出了问题先简化自己的问题，去掉不必要的步骤，比如既然有问题了，为什么不试试从头到尾都在一个机器上跑（虽然实际可能与此无关，但这是自己解决问题应该做的）？谁知道你是chk文件有问题、转fchk出错、win下Gaussian有问题、还是压根电荷改了多重度没改之类的，算中性物种要读阴离子的fchk干啥？
打包后传输入输出

摘星衬月 · 发表于 Post on 2016-8-24 10:02:11

liyuanhe211 发表于 2016-8-24 09:34
又是出错出错出错，只说“出错了”、“LinkXXX报错”，而且连输入都没有，把Pople叫过来也没法确定你什么问 ...

好吧，确实是我说的不清楚，好在问题已解决，谢谢了。

sobereva · 发表于 Post on 2016-8-24 10:12:17

摘星衬月发表于 2016-8-24 10:02
好吧，确实是我说的不清楚，好在问题已解决，谢谢了。

http://bbs.keinsci.com/forum.php?mod=viewthread&tid=334

sobereva · 发表于 Post on 2016-8-24 10:15:36

librakitty 发表于 2016-8-23 23:46
老师，我想考察一下不同的反应物A和不同化合物B反应中，A和B结构对反应的影响。通过比较不同A、B的静电势和 ...

如果你是指用了几何优化过的复合物，分子间斥力都已经基本释放了，不会有明显位阻作用。
倒是考察过渡态的位阻是可行的。

librakitty · 发表于 Post on 2016-8-24 10:28:31

sobereva 发表于 2016-8-24 10:15
如果你是指用了几何优化过的复合物，分子间斥力都已经基本释放了，不会有明显位阻作用。
倒是考察过渡 ...

嗯嗯，多谢老师的解答，我用过渡态结构试试。

小书童 · 发表于 Post on 2016-8-24 11:32:47

自己的一篇论文，计算了煤分子表面的静电势，根据静电势推测水分子首先被吸附到那个区域，但是审稿人给了如下的意见“通过计算煤分子表面的静电势分布，推测和分析与水分子作用的方式是一种学术观点，可以尝试。但不能认为“分子间发生相互作用前，首先需要靠静电相互吸引至反应区域，进而发生化学反应或吸附作用”是唯一因素。例如，在温度比较高的条件下，水等气体小分子与煤表面的作用，分子热运动可能是更为重要的因素 ” 请问sob老师，我该怎么回复他好呢？一个是静电势，一个说热运动，请老师指点一下。多谢

kekexili_08 · 发表于 Post on 2016-8-24 11:42:16

小书童发表于 2016-8-24 11:32
自己的一篇论文，计算了煤分子表面的静电势，根据静电势推测水分子首先被吸附到那个区域，但是审稿人给了如 ...

审稿人的观点是对的。温度高的时候，碰撞方向更为随机，与静电势在各个方向的的差异基本不相关。

dingniu2 · 发表于 Post on 2016-8-24 12:26:42

请问老师，有的文献软度是s=1⁄η，有的为s=1⁄2η。请问哪一个是正确的？

小书童 · 发表于 Post on 2016-8-24 17:09:26

kekexili_08 发表于 2016-8-24 11:42
审稿人的观点是对的。温度高的时候，碰撞方向更为随机，与静电势在各个方向的的差异基本不相关。

多谢您的指导，实际煤分子和水分子的作用温度在常温25摄氏度左右，请问这时候起主导作用的是否是静电势呢？

librakitty · 发表于 Post on 2016-8-24 17:39:33

sobereva 发表于 2016-8-24 10:15
如果你是指用了几何优化过的复合物，分子间斥力都已经基本释放了，不会有明显位阻作用。
倒是考察过渡 ...

老师，我用过渡态试过了RDG分析还是没有出现位阻效应的迹象，可能我这个真的是位阻效应太弱了，我搜了搜帖子发现有提到范德华表面穿透程度我估计根据这个距离长短可能能说明点问题。另外就是除了静电位阻之类的作用之外，我是否可以依据不同反应体系的分子间轨道重叠程度来分析对比呢？我其实就想稍微深入一点分析一下反应物结构变化引起反应能垒变化的部分原因，请老师给点建议，多谢您。

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[综合交流] 简单量子化学问题答疑专帖（旧版，已关帖）

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