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楼主 Author: sobereva
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[综合交流] 简单量子化学问题答疑专帖(旧版,已关帖)

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2016-8-24 17:40:16 | 只看该作者 Only view this author
dingniu2 发表于 2016-8-24 12:26
请问老师,有的文献软度是s=1⁄η,有的为s=1⁄2η。请问哪一个是正确的?

前者。Parr的原文就是这么定义的。
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2016-8-24 17:43:27 | 只看该作者 Only view this author
小书童 发表于 2016-8-24 17:09
多谢您的指导,实际煤分子和水分子的作用温度在常温25摄氏度左右,请问这时候起主导作用的是否是静电势呢 ...


静电吸引+色散吸引,和热运动的随机运动,是竞争的关系。高温下后者占优,吸附不住;低温下前者占优,而且静电势对吸附方式的影响一般要大过色散作用。
25度下静电作用还是能对吸附方式起到一定影响的。当然最严格的考查方式还是做动力学模拟。
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2016-8-24 17:45:50 | 只看该作者 Only view this author
librakitty 发表于 2016-8-24 17:39
老师,我用过渡态试过了RDG分析还是没有出现位阻效应的迹象,可能我这个真的是位阻效应太弱了,我搜了搜 ...

你也可以试着用NBO的steric关键词分析NLMO之间的互斥作用,但我对这种分析只是持中立态度
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发表于 Post on 2016-8-24 18:16:15 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2016-8-24 17:45
你也可以试着用NBO的steric关键词分析NLMO之间的互斥作用,但我对这种分析只是持中立态度

谢谢老师的建议,不过我觉得位阻影响应该是真的太弱了,所以我打算把这块放弃了。
很抱歉这么追着您问,实在是自己懂得太少,无法自己判断合理性。
就是我上个问题提到的考察范德华表面穿透程度来做一点比较可否?另外就是除了静电位阻之类的作用之外,我是否可以依据不同反应体系的分子间轨道重叠程度来分析对比呢?实在是麻烦您了。

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2016-8-24 23:27:26 | 只看该作者 Only view this author
librakitty 发表于 2016-8-24 18:16
谢谢老师的建议,不过我觉得位阻影响应该是真的太弱了,所以我打算把这块放弃了。
很抱歉这么追着您问, ...

分析轨道重叠程度没什么用
考察范德华表面穿透程度倒是可以
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发表于 Post on 2016-8-24 23:38:49 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2016-8-24 23:27
分析轨道重叠程度没什么用
考察范德华表面穿透程度倒是可以

嗯嗯,好的,多谢老师,我试试看。非常感谢您的耐心解答。

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发表于 Post on 2016-8-25 15:17:38 | 只看该作者 Only view this author
sob老师,我需要算一个酚类物质与自由基的反应,推测容易的反应位点和反应机理,在选择算法的时候一开始选的是  B3LYP/6-311+G(d,p),后来又试了  M062X/6-311+G(d,p), 两种方法算出的结果有差异。请问一下,这两种方法的HF成分差别有些大,算出的结果不知道哪个更好,在刚开始算的时候,如何选择一个合适的方法来算自己的体系。

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发表于 Post on 2016-8-25 21:42:38 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 primashen 于 2016-8-25 21:44 编辑

参考帖子“三重激发态寿命的问题”计算S0-T2的绝热激发能,即T2态的能级,(1)电荷,自旋多重度写0 3优化得到无虚频的T1,(2)以此结构TDDFT计算,电荷、自旋多重度写0 1,root=2, 优化T2态得到相应的T2态能级。不知这样计算是否正确。另外,在T1结构基础上TDDFT计算时,可否写0 3, root=1优化T2态?谢谢老师!

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2016-8-26 00:26:58 | 只看该作者 Only view this author
chengxing545946 发表于 2016-8-25 15:17
sob老师,我需要算一个酚类物质与自由基的反应,推测容易的反应位点和反应机理,在选择算法的时候一开始选 ...

对这类问题M06-2X通常比B3LYP更好
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primashen 发表于 2016-8-25 21:42
参考帖子“三重激发态寿命的问题”计算S0-T2的绝热激发能,即T2态的能级,(1)电荷,自旋多重度写0 3优化 ...

第一步完全多余。直接用第二步就完了

另一问的写法不推荐
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发表于 Post on 2016-8-26 10:15:04 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2016-8-26 00:26
对这类问题M06-2X通常比B3LYP更好

好的,非常感谢sob老师您的建议,感谢感谢,但是可否告知为什么MO6-2X在这方面要优于B3LYP,我从网上查的B3LYP-gCP-D3,这种方法你建议使用吗?再次对sob老师的回答表示诚挚的谢意

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2016-8-26 14:34:20 | 只看该作者 Only view this author
chengxing545946 发表于 2016-8-26 10:15
好的,非常感谢sob老师您的建议,感谢感谢,但是可否告知为什么MO6-2X在这方面要优于B3LYP,我从网上查的 ...


对于有机体系,大量测试都表明M06-2X完胜B3LYP。前者参数化做得好。
你研究的是化学反应,而不是弱相互作用,加gCP、D3没用。而且高斯还不支持gCP。
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发表于 Post on 2016-8-26 16:45:18 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 1130240115 于 2016-8-26 16:46 编辑

各位老师,请问一下。如果使用AIM电子密度拓扑分析方法分析弱相互作用,电子密度和H(r)可以用来作为评价不同含氧官能团与同一种分子形成的氢键的强弱的标准吗(形成的氢键都为O-H氢键,只不过有的是C-O-H氢键,有的是O-H-O氢键)

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2016-8-26 21:27:35 | 只看该作者 Only view this author
1130240115 发表于 2016-8-26 16:45
各位老师,请问一下。如果使用AIM电子密度拓扑分析方法分析弱相互作用,电子密度和H(r)可以用来作为评价不 ...

C-O-H氢键是什么氢键?哪个是氢键给体和氢键受体?
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发表于 Post on 2016-8-26 21:49:28 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2016-8-26 21:27
C-O-H氢键是什么氢键?哪个是氢键给体和氢键受体?

老师,抱歉,写得不太明白。形成的氢键包括A分子的羰基氧与B的羟基氢,A分子的醚键氧与B分子的羟基氢,A分子的羟基氢与B分子的羟基氧和B间的羟基形成的氢键。。老师您说过只有同种类型的氢键其强度才能使用电子密度和H(r)比较,不知道四种氢键是否可以归于同一种类型的氢键。问题写得不明确,耽误老师时间,抱歉。争取下次不出现这种情况。

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